关文达 作品数:54 被引量:226 H指数:8 供职机构: 广州医科大学 更多>> 发文基金: 澳门特别行政区科学技术发展基金 广州市科技计划项目 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
四种腺病毒核酸提取方法的比较 被引量:3 2009年 目的通过蛋白酶K法、苯酚法、病毒DNA/RNA提取试剂盒、腺病毒荧光PCR检测试剂盒等四种腺病毒核酸提取方法的比较,为进一步研究腺病毒的分子生物学特性选择合适的方法提供参考。方法以腺病毒感染的A549细胞为样品,分别以蛋白酶K法、苯酚法、病毒DNA/RNA提取试剂盒、腺病毒荧光PCR检测试剂盒等四种方法提取核酸,核酸经紫外分光光度计检测A260/A280的比值后,用荧光定量PCR方法检测核酸中腺病毒拷贝数浓度,并记录四种腺病毒核酸提取方法所需的操作时间。结果蛋白酶K法、苯酚法、病毒DNA/RNA提取试剂盒、腺病毒荧光PCR检测试剂盒等四种方法提取核酸的A260/A280的比值依次为1.85532、1.7377、1.81474和1.43934,核酸中腺病毒拷贝数浓度依次为4.9×105copies/mL、3.94×103copies/mL、2.66×106copies/mL和6.15×106copies/mL,提取核酸所需的时间分别为1.5、15、0.5和0.5h。结论四种腺病毒核酸提取方法中,蛋白酶K法简单快捷、成本低廉,适合一般实验室使用;苯酚法适合用于提取细胞培养上清中病毒的核酸;病毒DNA/RNA试剂盒的优点是操作时间短,得到的病毒核酸纯度较高;腺病毒荧光PCR检测试剂盒对病毒的核酸损耗少,操作步骤少,适用于临床标本的腺病毒核酸检测。 关文达 秦笙 王丹芬 杨子峰 莫自耀关键词:腺病毒 核酸 一种病毒运送培养基的改良及其评价 被引量:1 2009年 目前我国临床实验室常用的病毒运送培养基多以商业化产品为主,但其效果未见相应的实验数据。本研究利用流感病毒PR8株、呼吸道合胞病毒Long株作为试验用病毒的代表,根据临床实际应用情况对病毒运送培养基的最适条件进行筛选和评价。 杨子峰 秦笙 王玉涛 招穗珊 黄群娣 关文达 周荣 莫自耀关键词:流感病毒 培养基 呼吸道合胞病毒 LONG 支气管镜检查在儿童大叶性肺炎的临床应用 徐佳兴 陈德晖 林育能 吴上志 曾庆思 邓宇 刘文宽 关文达 牛学峰 苏丹红新型冠状病毒肺炎疫情下治疗药物监测的临床应用与实验室防控策略 被引量:2 2020年 目的探讨当前新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情下治疗药物监测(TDM)的临床应用与实验室防控策略。方法归纳TDM在COVID-19患者治疗中的临床应用,结合新型冠状病毒的特点总结相关实验室防控策略。结果TDM的临床应用有利于安全合理用药,制订更精准的药物治疗方案,有效控制患者病情。TDM实验人员需接触相关的样本,操作过程中存在职业暴露风险,需要做好感染防控。结论TDM工作安全有效地开展,能为COVID-19临床治疗提供有力的帮助,同时降低实验人员的职业暴露风险。 周守宁 关文达 谢慧 何玉文 郭晓亮 孟冬梅 魏理关键词:治疗药物监测 实验室 冷氧等离子体杀灭甲型H1N1流感病毒的实验研究 被引量:1 2012年 目的在自行设计的等离子体反应装置中,模拟冷氧等离子体对甲型H1N1流感病毒气溶胶的杀灭作用。方法以甲型H1N1流感病毒PR8株和2009年季节性甲型H1N1流感病毒临床分离株作为指示病毒株,将流感病毒悬液雾化成气溶胶状态(约3.5μm),通过装置有冷氧等离子发生器和普通紫外灯管(8W)的自制管道,分别作用30min,在管道上、下方的出口收集病毒气溶胶于基础培养基(MEM)培养液中;以空斑形成法检测收集的流感病毒滴度。结果无任何干预条件下,流感病毒悬液雾化经过管道后,PR8株平均存活率为23.0%,病毒滴度下降0.64logPFU,临床分离株平均存活率为35.7%,病毒滴度下降0.44logPFU;PR8株气溶胶颗粒经冷氧等离子和普通紫外灯作用后,平均病毒滴度分别下降2.19、5.83logPFU,相对杀灭率为99.35%、100.00%;临床分离株气溶胶颗粒经冷氧等离子和普通紫外灯作用后,平均病毒滴度分别下降2.15、1.95logPFU,相对杀灭率为99.3%、98.9%。结论冷氧等离子对于受测的甲型H1N1流感病毒气溶胶,均显示了较好的杀灭作用,与普通紫外灯效果基本类似。 王玉涛 杨子峰 招穗珊 李润峰 关文达 秦笙 曾广翘关键词:流感病毒 消毒 基础研究对新冠肺炎疫情防控的引领及支撑作用 2022年 医学基础研究的出发点与最终目标是解决临床实践过程中遇到的实际问题,从而提高患者诊治成功率。自抗击非典型肺炎疫情以来,国家自然科学基金委员会长期连续地资助了以疫情防控和临床需求为导向的基础研究,不但产出了大量原创性科研成果,也培育了一批优势团队和平台。在抗击以新型冠状病毒肺炎为代表的突发呼吸道传染性疾病过程中,多个团队在前期研究基础上,通过多学科交叉(临床、医工、信息等)形成了整体防疫和系列救治方案,包括建立了呼吸道病毒诊断与预警平台,研发了新一代病毒检测设备和试剂,提出了重症预警、肺保护通气、中西医相结合的抗病毒联合治疗措施,快速开发了疫苗和药物,研究成果被写入国内外新冠肺炎诊疗指南。这些均充分体现出基础研究领域的长远布局有力地支撑了我国疫情防控和患者诊治的战略需求。在“面向人民生命健康”的指导思想下,进一步发挥基础研究对新冠疫情防控的推动及引领作用,具有重要的科学和现实意义。 关伟杰 杨子峰 赵金存 沈华浩 宋元林 关文达 黎毅敏 黄勇波 陈凌 钟南山关键词:国家自然科学基金 新型冠状病毒 临床救治 应用单一和双重荧光定量PCR法快速检测军团菌 被引量:2 2011年 目的 建立单一和双重荧光定量PCR方法分别和同时进行军团菌属及嗜肺军团菌的检测.方法 利用军团菌属16 S rRNA基因和嗜肺军团菌mip基因设计引物和探针,两条基因探针分别标记FAM和HEX,并将相关反应体系和条件进行优化.分别应用单一基因探针(单一荧光定量PCR)和双重基因探针(双重荧光定量PCR)对嗜肺军团菌、非嗜肺军团菌及非军团菌进行检测,并验证两种方法的特异度、敏感度.应用双重荧光定量PCR检测空调水样滤膜样品和DNA提取样品,比较两者结果的一致性.结果 针对军团菌属及嗜肺军团菌,应用荧光定量PCR,16 S rRNA基因和mip基因均能较好的检出,16S rRNA和mip的最低检出限分别为8和10个拷贝.经优化得到了最佳反应体系.单一荧光定量PCR方法所检的8株嗜肺军用菌及4株非嗜肺军团菌16 S rRNA基因均为阳性,嗜肺军团菌mip基因阳性,非嗜肺军团菌mip基因阴性.双重荧光定量PCR方法所检的23株嗜肺军团菌中有2株为假阴性,9株非嗜肺军团菌和非军团菌属中有1株为假阳性.49份空调水样滤膜直接检测和提取DNA后检测的结果一致,其中26份水样军团菌阳性,20份为嗜肺军团菌,6份为非嗜肺军团菌;1份弗朗西斯菌检测HEX阳性(假阳性),占实际培养分离的1/26.结论 单一及双重荧光定量PCR法特异、快速、敏感,一次同时检测嗜肺与非嗜肺军团菌,满足对空调和环境水样军团菌监测的要求. 莫自耀 秦建强 赵红波 关文达 秦笙 王玉涛 杨子峰关键词:聚合酶链反应 荧光 军团菌 RRNA基因 MIP基因 从乙型流感病毒流行株中筛选获得鼠肺适应株的研究 被引量:3 2014年 目的从乙型流感流行株中筛选获得可在鼠肺中稳定复制的毒株。方法利用免疫抑制剂甘露聚糖分别联合5株乙型流感临床分离株和1株标准株感染BALB/c小鼠,筛选出可稳定在鼠肺中连续感染传代的毒株,并纯化后感染小鼠,检测其致病力与致死率,最后对病毒核酸进行测序,分析分子特征。结果从5株临床分离株中筛选到1株乙型流感病毒,可在小鼠中稳定感染并致死,经测序比对发现适应过程中该株病毒血凝素(HA)发生2个突变:N212Y和E361K,神经氨酸酶(NA)发生1个位点突变S339F,其中HA E361K是裂解位点。结论成功从临床乙型流感分离株筛选适应获得一株鼠肺适应株,为进一步开展药物和发病机制研究提供了可能。 杨子峰 杨春光 王玉涛 潘思华 江海明 李润峰 关文达关键词:乙型流感病毒 小鼠模型 呼吸道合胞病毒NS1基因原核表达及其免疫原性分析 2012年 目的原核表达呼吸道合胞病毒(RSV)非结构NS1蛋白,并对其免疫特性进行研究。方法采用PCR技术获得NS1基因,将其插入pET41a(+)载体上,导入大肠杆菌后诱导表达;利用GST亲和层析柱对诱导表达的NS1蛋白进行纯化,免疫动物制备抗体,Westernblot法鉴定抗体的特异性。结果重组质粒经酶切鉴定和DNA序列测序完全正确,经IPTG诱导后融合蛋白在大肠杆菌BL21-DE3中得到高效表达,表达产物经超声破碎和GST亲和层析纯化获得重组蛋白,分子量约42000Mr,以抗NS1蛋白的多克隆抗体为一抗进行Westernblot检测,结果只有RSV感染细胞的样品在15000Mr处有特异性带显示,其他病毒感染的细胞和阴性对照没有相应条带。结论 NS1基因得到高效表达,免疫制备得到的抗体与RSV感染细胞有特异性反应,与其他常见呼吸道病毒感染细胞无交叉免疫反应。 刘昆 陈俏连 伍时冠 潘思华 李海涛 杨子峰 关文达 秦笙关键词:呼吸道合胞病毒 非结构蛋白 蛋白纯化 病原宏基因组高通量测序生物信息学分析质量评价的研究现状与思考 2024年 病原宏基因组高通量测序(mNGS)技术已成为感染病原学诊断的新工具,由实验操作(湿实验)和生物信息学分析(干实验)两部分组成。干实验由算法和数据库构成,其功能是对湿实验产生的测序数据进行分析处理后输出检测结果。干实验的性能受到测序数据中复杂多变的干扰因素的影响,包括临床样本中大量的人源核酸、试剂与耗材携带的微生物核酸、采样与湿实验引入的环境微生物核酸、数据库中基因组质量不均一或不同物种基因组之间的相似性过高导致的错误比对与注释,以及算法与参数差异对分类鉴定的影响等。上述干扰因素可能来自mNGS检测各个环节,不仅可能导致干实验输出错误的物种鉴定和微生物检测结果,也给干实验的质量控制与评价带来较大挑战。本文综述了mNGS干实验质量控制的关键问题以及关于质量评价方法的思考。 刘东来 关文达 关文达 吴林寰 王浩 许四宏关键词:生物信息学分析