张国栋 作品数:4 被引量:86 H指数:3 供职机构: 东北林业大学林学院 更多>> 发文基金: 国家转基因植物研究与产业化专项 国家重点基础研究发展计划 黑龙江省科技攻关计划项目 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
一种适用范围广的总RNA提取方法 被引量:57 2006年 介绍一种RNA提取方法,该方法以SDS、氯仿和Tris苯酚为主要提取试剂,以LiC l和乙醇为RNA沉淀试剂。分别以柽柳(木本植物)、星星草(草本植物)、天牛(昆虫)、酿酒酵母和白腐菌(真菌)为RNA提取材料,用该方法成功地提取出了它们的总RNA。获得的RNA条带清晰,A260/A280在1.8以上。通过对LiC l和乙醇沉淀RNA的效果分析表明,该方法可在10 m in内完全沉淀RNA,同时也可以同时获得纯度较高的DNA。提取的RNA质量可满足cDNA文库构建,基因芯片探针标定和RT-PCR等对RNA质量要求较高的分子生物学操作,说明这是一种应用范围广的RNA提取方法。 王玉成 张国栋 姜静关键词:RNA cDNA微阵列技术研究干旱胁迫下柽柳基因的表达 被引量:17 2007年 运用cDNA微阵列技术研究干旱胁迫下柽柳(Tamarix androssowii)基因的表达。分别将Cy5和Cy3两种荧光染料标记在干旱处理和对照的柽柳cDNA上,并与载有柽柳基因的微阵列进行杂交,通过计算机对芯片进行扫描和分析研究干旱胁迫下基因的表达。共获得了47个下调表达和62个上调表达的基因。Blastx分析表明这些基因按功能可以分为脱水保护、信号传导与调控、活性氧清除、光合作用、代谢、核糖体蛋白、蛋白质的分解与再生等几大类别。同时,发现了一些与干旱胁迫相关的功能未知基因和新基因。从而揭示了柽柳具有活性氧消除、代谢调节、脱水保护、蛋白质降解与再生等抗旱途径,并阐述了干旱胁迫前后柽柳基因的差异表达。 王玉成 李红艳 杨传平 张国栋关键词:基因芯片 柽柳 干旱胁迫 基因表达 柽柳MnSOD基因(英文) 被引量:2 2006年 在环境胁迫下,植物体内活性氧(ROS)的大量积累会对其本身产生毒害作用。SOD酶在清除这些活性氧化酶机制中发挥关键作用。大量研究表明,MnSOD可有效增强转基因植物抵抗氧化胁迫的能力。我们从抗逆性较强的木本植物紫杆柽柳中克隆到一个新的MnSOD基因,并将该全长基因在GenBank上注册,其登录号分别为AY573576(基因序列)和AAS77885(氨基酸序列)。这将为研究木本植物的抗逆机理和该酶在抗逆基因工程中的应用奠定基础。 张国栋 王玉成 夏德安关键词:基因克隆 基因芯片技术研究柽柳NaHCO_3胁迫下基因的表达 被引量:11 2005年 运用基因芯片技术研究了NaHCO3胁迫下柽柳 (Tamarixandrossowii)基因的表达。将Cy5和Cy3两种荧光染料分别标记在NaHCO3处理和对照的柽柳cDNA上 ,将两种荧光探针混合 ,与载有柽柳基因的高密度芯片进行杂交并用芯片扫描系统进行扫描 ,通过Cy5与Cy3信号强度比值的计算研究基因的差异表达。共获得了 89个差异表达的基因 ,其中 ,2 7个下调表达 ,6 2个上调表达。BlastX分析表明这些基因按功能可以分为光合作用、活性氧清除、渗透调节、信号传导与表达调控、代谢、发育相关、核糖体蛋白、蛋白质的分解与再生、转运类蛋白、水通道蛋白等几大类别。同时 ,发现了一些与盐胁迫相关的功能未知基因或未有任何功能信息的基因 ,这些基因可能在柽柳抗盐过程中具有重要作用。揭示了柽柳的抗盐胁迫涉及的几种重要途径 ,并获得了NaHCO3胁迫前后柽柳基因表达谱。 杨传平 王玉成 刘桂丰 姜静 张国栋关键词:基因表达谱 基因芯片技术 未知基因 信号传导 柽柳