李英娜
- 作品数：2 被引量：7H指数：1
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金重大基础研究前期研究专项国际科技合作重点项目计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 结构域蛋白质组学研究进展被引量：7
- 2003年
- 蛋白质的结构域是蛋白质中具有特异结构和独立功能的区域。与蛋白质本身的数量相比 ,结构域的数量是有限 ,每个结构域所包含的成员数目也是有限的。在蛋白质组学研究的现阶段 ,研究方法上的限制尚无法全面实时地研究哺乳动物细胞的整个蛋白质组。由于结构域在功能上的重要性和其数量的有限性决定了以结构域为研究对象在蛋白质组学规模上进行研究不失为现阶段蛋白质组学研究的一种现实的选择。本文综述一些在这些方面所做出的早期的尝试。研究人员分别以SH3、PDZ和WW等结构域为对象进行蛋白质组学规模上的研究 ,并建立和完善了一些研究方法。总之 。
- 李英娜高友鹤崔莲仙
- 关键词：结构域蛋白质组学PDZ
- 通过筛选随机多肽文库研究ZO-1中PDZ1结构域的配体结合特点被引量：1
- 2006年
- 选择ZO-1的PDZ1结构域作为研究对象,以酵母双杂交为筛选系统,筛选随机多肽文库和与其它PDZ结构域的配体进行相互作用,阐明ZO-1PDZ1的配体结合特性.ZO-1PDZ1识别配体C末端保守的氨基酸序列通式可以表示为[S/T][F/Y/W][V/I/L/C]-COOH、[S/T][K/R]V-COOH、V[F/Y/W][L/C]-COOH、EYV-COOH.研究发现ZO-1PDZ1的配体同时具有3种传统PDZ结构域配体的特点,不同的是其结合配体-1位对芳香族氨基酸具有强烈的偏好性.并且某些PDZ结构域配体的-1位和-3位对结构域与配体相互作用的特异性和亲和力有重要的作用.随后通过生物信息学的方法在Swiss-Prot数据库找到与此识别规律相符合的天然人类蛋白质.根据蛋白质的功能和细胞定位等性质选择10个配体用酵母双杂交验证相互作用.证实的相互作用配体有4个.本研究希望用这样的研究策略建立一种有效的研究蛋白质相互作用的方法,通过在全蛋白质组规模上对含有结合配体保守氨基酸序列的蛋白质的查询,理论上可以找到现有数据库中所有可能与目的结构域结合的潜在配体蛋白,特别是那些筛选cDNA文库不容易获得的低丰度配体.
- 田瑞李英娜宋婀莉高诗娟黄海明张玲马素参高友鹤
- 关键词：蛋白质相互作用PDZ结构域酵母双杂交
