公共文化服务平台

A型口蹄疫病毒VP1基因序列的基因分型研究: 2007年; 为设计A型FMDV基因分型探针建立其3个基因型的数据库,以美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因库和英国口蹄疫世界参考实验室(FMDWRL)基因库中所登记的血清A型口蹄疫病毒(FMDV)VP1基因序列为研究对象,运用双序列比对和构建系统发育树的方法对未知基因型的VP1序列进行基因分型并比较两种方法的分型结果。结果表明,两种分型方法的分型率均达到92%,分型结果基本一致。运用这两种方法都可实现对A型FMDV VP1序列的基因分型。; 梁之昶陈小玲姚刚章振华相磊杨兵石岗; 关键词：A型口蹄疫病毒 VP1 基因分型双序列比对

用于检测仔猪致病菌的23S rRNA基因芯片的研制被引量：3: 2010年; 以副猪嗜血杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠道沙门氏菌、猪链球菌等12种仔猪致病菌为目标细菌,23SrRNA基因为靶基因,从GenBank中下载其23SrDNA全序列,在其变异区设计特异性探针,在保守区设计通用引物。通过序列分析、PCR靶标与探针杂交试验,建立了有13条寡核苷酸探针和2对通用引物的仔猪常见致病菌基因芯片检测方法。以参考菌株粗提基因组DNA的10倍系列稀释模板做PCR,扩增产物与探针杂交,检出芯片的灵敏度为100fg。对33个参考菌株用芯片检测,结果有1例不正确,只鉴定到属;在61个野外分离株中,55株的芯片检测结果与生化或测序结果一致,有6例不一致,符合率为90%。初步研究证明,该检测方法能快速、有效地鉴定多种仔猪常见致病菌,但要区分某些细菌的致病株与非致病株,还要检测毒力/毒素基因。; 伍诚意曹峰子梁之昶章振华杨兵周宏专季海峰陈小玲; 关键词：仔猪致病菌 RRNA基因寡核苷酸探针

新生阿勒泰羔羊母羊喂养与奶粉喂养效果的比较研究: 2008年; 在当前的养羊生产中，使用目前市售代乳料的羔羊都有生长慢、易患病的缺点，因此为提高羔羊的育成率和促进生长，进一步研究各种乳源性生物活性肽，开发新型的代乳料有重要的现实意义。研究目的是探索缺乏母源性生物活性肽对羔羊生长发育的影响，为代乳料的研制提供一定的理论基础。; 王文均许莲萍何艳香梁之昶姚刚; 关键词：羔羊生长发育奶粉母羊

口蹄疫分型诊断芯片探针设计初报: 对O型FMDV8个基因型、A型FMDV3个基因型和AsiaⅠ型口蹄疫病毒(Foot-and-Mouth DiseaseVirus,FMDV)设计出基因型特异性探针,使其不但能够将同一血清型内的不同基因型FMDV序列区分开...; 相磊陈小玲李伍举梁之昶章振华胡国良徐福洲石岗; 关键词：FMDV VP1基因基因芯片寡核苷酸探针; 文献传递

口蹄疫病毒分型诊断芯片探针设计初报被引量：3: 2008年; 为建立口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)不同血清型与基因型的基因芯片检测方法,设计针对O型8个基因型、A型3个基因型和亚洲1型的特异性探针。从美国GenBank与英国世界口蹄疫参考实验室基因库下载了O型、A型和亚洲1型FMDV的VP1基因序列547条。对每一血清型序列用DNA Star软件ClastalW程序进行多重比对,做系统发育分析并进行基因分型。用生物学软件BioSun 2.0建立基因型数据库,设计每一基因型的特异性探针。共设计出104条候选探针,通过芯片试验筛选出12条特异性探针。以各型特异性探针所对应的靶序列模板做10倍系列稀释进行PCR扩增,扩增产物与探针杂交,验证各探针的灵敏度。对O型SEA、Euro-SA、ME-SA、WA 4个基因型的各条探针的灵敏度进行了检验,结果这些探针能够检测到102数量级拷贝数的阳性靶标。; 相磊陈小玲李伍举梁之昶章振华王学文胡国良徐福洲石岗; 关键词：口蹄疫病毒血清型 VP1基因基因芯片寡核苷酸探针

三株口蹄疫病毒的克隆和基因型鉴定被引量：1: 2007年; 目的:将O、A、Asia-Ⅰ型等3株口蹄疫病毒(FMDV)VP3-VP1-2A区域的一个片段克隆到pMD18-T载体上,构建阳性重组质粒,并且鉴定3株病毒所属的基因型。方法:将从中国农业科学院兰州兽医研究所获得的O、A、Asia-Ⅰ型灭活FMDV提取RNA作为模板,采用RT-PCR技术扩增了VP3-VP1-2A区域的一个约1 070 bp的片段,包含了全部的VP1序列;将其克隆到pMD18-T载体上,鉴定后得到阳性重组质粒;将目的片段进行序列测定、分析、绘制系统发育树,进而确定各灭活病毒的基因型。结果与结论:经鉴定,O型灭活FMDV属Cathay基因型,它与该基因型3条参考毒株序列的相似性在87%以上;A型灭活FMDV与参考株的相似性差异较大,但在系统发育树上可以看出该毒株属于Asia基因型;Asia-Ⅰ型FMDV只有1个基因型,将测序结果在NCBI网站上BLAST,证实该灭活病毒为Asia-Ⅰ型。; 相磊梁之昶章振华王学文胡国良徐福洲石岗陈小玲; 关键词：口蹄疫病毒 VP1基因克隆系统发育树基因型

O型口蹄疫病毒VP1基因区序列系统发育树分型被引量：3: 2007年; 从GenBank和世界口蹄疫参考实验室基因库(WRLFMD)下载O型FMDV全VP1序列共210条,其中23条为已知基因型序列,其他为未知基因型序列。利用分子生物学软件DNA Star中的Clust-alW和Tree View工具,以已知基因型的VP1区序列构建系统发育树,验证分型结果与已知基因型是否一致。然后以已知基因型序列作为参照,将未知基因型序列与已知基因型序列一起构建系统发育树,以已知基因型序列在系统发育树中所处的位置,来判断未知基因型序列的归属,从而明确它们归属于何种基因型。结果表明,采用此种分型方法获得Cathay型74条、SEA型24条、EA型4条、WA型4条、Euro-SA型21条、ME-SA型68条、ISA-1型3条、ISA-2型2条,未能分型序列10条。; 相磊章振华胡国良陈小玲梁之昶徐福洲石岗; 关键词：O型口蹄疫病毒系统发育树 VP1基因

用反向斑点杂交方法检测猪常见致病菌: 2010年; 目的:建立检测猪常见致病菌的反向斑点杂交方法。方法:将23S rRNA基因芯片用的针对12种细菌的25～30 mer探针加长到30～38 mer,2对通用引物序列不变。用地高辛标记下游引物,以尼龙膜为载体制备膜芯片,检验探针/膜杂交的特异性和敏感性;另外设计1条大肠杆菌K88基因探针、一段带K88探针的报告基因和1对报告基因的反向PCR引物,在PCR体系中增加封口的K88报告基因和反向引物对,被检样品扩增后进行膜杂交。结果:修改的13条探针与参考目标菌株在膜上成特异性杂交,对52个参考菌株和野外分离株的检测准确率为92%;膜杂交的敏感性与玻片芯片接近,最小检出量为100 fg DNA;在尼龙膜上增加K88探针,与3重PCR产物杂交,可以检测到大肠杆菌K88毒力基因。结论:建立的反向斑点杂交方法简便快速,检测成本低,可用于仪器设备不足的实验室,同时可以加入检测如大肠杆菌K88等致病基因,提高基于保守基因的芯片的诊断能力。; 曹峰子伍诚意宋勤叶江洪梁之昶季海峰陈小玲; 关键词：反向斑点杂交 RRNA基因反向PCR

仔猪12种致病菌的16 S rRNA分析被引量：1: 2007年; 研究仔猪12种致病菌的16 S rRNA基因序列,分析其亲缘关系,为设计其16 S rRNA基因的诊断探针提供理论依据。从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因库中下载332条仔猪12种致病菌的16S rRNA基因序列,应用双序列比对和构建系统进化树的方法对这些序列进行种内分析,选出每种细菌的代表序列,再对代表序列用同法进行种间分析,并将种间分类结果与伯杰氏细菌分类手册(第8版)的分类结果进行比较。从每种细菌的数据库中选出一条接近16 S rRNA基因序列全长,与同种其他序列的核苷酸替代率差异较小的序列为该种细菌的代表序列,进行种间16 S rRNA基因序列系统进化分析,结果与伯杰氏细菌分类手册(第8版)的分类基本一致。该16 S rRNA基因的系统进化分析所提供的信息将用于下一步针对这12种致病菌的16 S rRNA基因诊断探针的设计。; 梁之昶陈小玲相磊章振华姚刚杨兵; 关键词：RRNA基因致病菌双序列比对系统进化分析仔猪

仔猪常见致病菌检测芯片的研究: 目的：研究仔猪常见致病菌的基因芯片检测方法。方法：1)选取12种仔猪常见致病菌作为基因芯片检测的靶细菌，从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因库中下载它们的16S rRNA基因序列，利用Biosun2.0...; 梁之昶; 关键词：仔猪致病菌基因芯片; 文献传递

渝B2-20050021-1　渝公网安备 50019002500403号　违法和不良信息举报中心　互联网出版许可证　新出网证(渝)字10号

梁之昶

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户反馈

梁之昶

合作作者

文献类型

领域

主题

机构

作者

传媒

年份

用户登录

用户反馈