张正国
- 作品数：95 被引量：183H指数：6
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院基础医学院基础医学研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技基础性工作专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术机械工程更多>>
- 基于语义的疾病表型相似性被引量：1
- 2012年
- 已知一种药物可用于治疗某疾病,则该药物可能对与该疾病具有相似表型的其他疾病有疗效。因此,大规模地计算疾病表型相似性可辅助发现的疾病新的治疗方法。我们从OMIM下载了3742种疾病的表型信息,从Mesh词库下载13721个关联解剖学和疾病症状的注释词。我们将以上的Mesh词逐一在3742种疾病的表型信息文本中搜索,得到每种疾病涉及的Mesh词汇列表,进而基于语义分析的方法系统地计算了疾病表型的两两相似性矩阵。我们发现疾病关联生物通路最多的有肿瘤生物通路,胰岛素信号通路,肥大心肌病通路和细胞粘附通路等。随疾病对表型相似度的增加,其更涉及相同KEGG生物通路的概率亦增加,证明了本文方法的可靠性。疾病表型相似性可作为疾病在基因水平相似性的补充,有望为药物发现研究提供一条新途径。
- 王志刚谢丽芳陈鑫杨啸林彭屹张正国
- 关键词：语义
- 基于Web Service的生物学实体映射数据库被引量：1
- 2010年
- 生物学实体映射就是要实现对基因、蛋白质、小分子物质、化合物和药物等实体的不同标识符和名称之间的相互转换。生物学实体映射可以帮助生物医学研究者将实验结果关联到海量的在线生物医学数据资源,并为生物医学文本挖掘和信息检索的研究者在命名实体识别和查询关键词扩展方面提供技术支持。构建一个生物学实体映射数据库,其中存储了大量的生物学实体映射信息;还构建一个基于Web Service的生物学实体映射网络应用系统,为用户同时提供通过浏览器和通过Web Service的两种方式访问生物学实体映射数据库。
- 张智张正国
- 关键词：映射网络服务数据库
- 婴儿行为法的听力筛查被引量：3
- 1998年
- 用自行研制的便携式“婴儿行为听力筛查仪”对北京城区3个街道的婴儿进行了筛查.共计筛查了520名婴儿(男276,女244),其中43(8.3%)名未通过.对43名未通过筛查的和随机抽选的50名已通过筛查的婴儿用听性脑干反应和声导抗测试复查.未通过筛查的43名婴儿中.6名(1.15%)有听力损失,37名听力正常;通过筛查的50名婴儿全部具有正常听力.经计算该筛查方法的敏感度为100%,特异度为92.8%,表明该筛查仪适用于婴儿听力筛查.
- 张正国张伍玲王建明林金森柯肖枚
- 关键词：婴儿听力筛查行为测听
- 信号平均心电图预处理常用方法中存在的问题及分析
- 1997年
- 用相干平均法提心电信号中的微电势对预处理精度有严格的要求。通过计算机模拟，本文对最大相关系数法（MCC法）的信号判别能力和其常用相关窗及阈值对信号预处理精度的影响进行分析。结果显示，MCC算法本身对实验信号幅度和宽度的变化分别表现为完全不敏感和较不敏感。在进行信号对齐时，计算相关的时间窗越窄使相关系数对信号问对齐误差的反应越不敏感。在阈值设为0．99时，无论是用40ms还是100ms窗都使平均信号的功率谱发生畸变。说明MCC法中存在的上述问题使其在心房或心室晚电位提取这类对平均预处理精度要求较高的应用中有一定的局限性。
- 程小明林金森张正国
- 关键词：计算机模拟信号平均心电图
- 脑组织血管动态调节的无损伤测量研究被引量：3
- 2002年
- 近红外光谱信号分析 (NIRS)近年来发展迅速并获得临床应用 ,人们一直试图用此方法得到精确的组织血液成分的信息 ,而没有挖掘其中蕴涵的血管动态调节的丰富信息。本文描述了一种新的近红外光谱信号分析方法 (NIRS) ,能区分出动脉血和静脉血的相对变化 ,实现脑组织血管动态调节的无损伤测量。通过设计一些可用已知生理学理论解析的方法诱发组织血管的调节作用 ,对比观察电磁血流量计和NIRS测量结果 ,并进行了人体实测研究。目的在于使由此而得到的血管调节信息易于判断与确信 ,从而有利于运用这种连续动态的光电检测法去观察更深层的生理与心理的未知现象。
- 王强张正国罗致诚
- 关键词：脑血管光电检测
- 肌肉组织背景下的微血管分割方法研究
- 2012年
- 微血管的分割提取是微循环网络特征参数分析与功能障碍评估的关键性图像处理技术基础之一。目前尚缺乏有效的专门针对肌肉组织来源图像的微血管分割方法,使用现有的血管分割算法难以取得理想的分割效果。本研究依据该类图像的特点,针对性地提出了一种基于多技术组合联用的分割方案—TOSC分割法。首先以阈值法进行初次分割,然后通过形态学开运算截断背景与微血管间连接区,再以种子填充法对微血管区域进行二次识别与分割,最后通过形态学闭运算填充分割区域中的孔洞和缺刻,实现了微血管的分割提取以及在此基础上的功能微血管面积密度测量。分割测试结果表明TOSC分割法能够准确地将微血管区域从复杂的肌纤维组织背景中提取出来,可满足基础研究与临床处理的要求。
- 盛有明张坚张正国修瑞娟
- 关键词：微血管图像分割数学形态学种子填充
- 瞬态诱发耳声发射的能量分布图被引量：2
- 1998年
- 耳声发射是近年来耳科界研究的热点。文章提出以小波变换提取不同尺度下瞬态诱发耳声发射（ＴＥＯＡＥ）的小波信号，并以其平均能量作为特征参数，建立了ＴＥＯＡＥ能量分布图，为ＴＥＯＡＥ的定量频率分析提供新手段。ＴＥＯＡＥ能量分布图以正常人的平均能量作为０ｄＢ，以单侧５％位数作为９５％正常值范围，它体现了能量的损失情况，便于与纯音测听的结果相比较。ＴＥＯＡＥ能量分布图的建立，说明ＴＥＯＡＥ信号也包含了定量的频率信息，并提供了其定量分析的有效手段。
- 李丽明林金森张正国
- 关键词：瞬态诱发耳声发射小波变换
- 两导心电信号的独立成分分析
- ＜正＞独立成分分析（ICA）是一项盲源分离技术,它能把混合信号分解成统计独立的各个分量。近年来ICA在生物医学信号,尤其是脑电信号处理中,展示了很好的应用前景。心电信号（ECG）可以看作是由单个源产生的波形信号,按照一定...
- 谢元芳张正国
- 文献传递
- T波形态学分析心室复极不一致性在黑龙江省中老年人群分布特点被引量：2
- 2010年
- 目的了解心室复极不一致性T波形态学分析指标人群分布特征和相关影响因素的关系。方法分析2 514人（35~81岁,男性42.8%）的十二导联10 s数字心电图。心室复极不一致性指标包括Bazett校正QT间期（QTcB）、Frideric ia校正QT间期（QTcF）和T波形态学分析指标总QRS/T夹角余弦（TCRT）、T波形态学变异（TMD）、T波主成份比值（PCA ratio）以及相对T波残余（rTWR）。考察其年龄、性别和血压分布,利用多元回归分析进行多因素分析。结果女性QTcB、PCA ratio、TCRT、TMD和rTWR高于男性（P〈0.05）。高血压人群的QTcB、QTcF、TMD、PCA ratio和rTWR的值高于血压正常人群（P〈0.05）。多元回归显示,年龄、性别和收缩压是所有心室复极指标的影响因素,Sokolow指数仅对T波形态学分析指标有影响。结论T波形态学分析指标受年龄、性别、血压和心肌肥厚程度影响,对心室复极评价独立于QT间期。
- 杨啸林张靖韩少梅张正国朱广瑾
- 关键词：心电图心室复极
- 呼吸对心电图中QRS波形的影响被引量：5
- 2002年
- 通过对20例健康男性Frank导联心电图在不同呼吸阶段的QRS波波形平均和振幅统计 ,观察到处于不同呼吸阶段的QRS波的振幅有差别。其中QRS波的振幅在呼气中期最高在吸气中期最低 ,根据呼吸运动时肺容积及肺内压变化的规律 ,认为是由于胸腔压力和心室舒容积的改变 。
- 王坤赤林金森张正国
- 关键词：心电图QRS波形
