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乌拉尔甘草EST资源的SSR信息分析被引量：6: 2012年; 目的:为了在乌拉尔甘草中开发功能性EST-SSR分子标记,分析乌拉尔甘草EST-SSRs特征。方法:从NCBI公共数据库中下载乌拉尔甘草EST序列,运用DNAstar软件中的Seqman Pro程序,对下载序列进行拼接和聚类,去除冗余序列,利用SSRIT软件筛选重复序列长度≥20 bp的二、三、四、五核苷酸4种类型的SSR,统计分析乌拉尔甘草EST-SSR的特征。结果:从NCBI公共数据库中下载50666条乌拉尔甘草EST序列,剔除冗余序列,得到全长为9.28×106bp的无冗余EST序列11100条。在这些序列中搜索出752条EST序列含有963个SSR,占无冗余EST序列的8.68%,平均每9.64 kb EST出现1个SSR位点。二核苷酸重复基元SSR出现频率最高(43.41%),其次是三核苷酸(41.95%),AG/TC、GA/CT和CTT/GAA是二、三核苷酸中的优势重复基元。乌拉尔甘草EST-SSR以4～10次重复为主,基序长度主要集中于20～30bp。结论:乌拉尔甘草EST-SSR的出现频率高,重复类型丰富,理论上表明这些EST-SSR具有较高的可用性。本文通过对乌拉尔甘草EST资源的SSR信息的研究,为分子水平和生物信息学角度上开发乌拉尔甘草的SSR功能性标记提供了候选序列。; 刘越黄怡鹤孙洪波冯金朝张水仙王真戴景峰黄璐琦; 关键词：乌拉尔甘草 EST SSR分析

裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析被引量：7: 2011年; 目的为了在裂叶牵牛中开发功能性EST-SSR分子标记,分析裂叶牵牛EST-SSRs特征。方法从NCBI公共数据库中下载裂叶牵牛EST序列,运用DNAstar软件中的Seqman Pro程序,对下载序列进行拼接和聚类,去除冗余序列,利用SSRIT软件筛选重复序列长度≥20 bp的二、三、四、五、六、七、八核苷酸7种类型的SSR,统计分析裂叶牵牛EST-SSRs的特征。结果从NCBI公共数据库中下载62 388条裂叶牵牛EST序列,剔除冗余序列,得到全长为8.35×106 bp的无冗余EST序列11 569条。在这些序列中搜索出985条EST序列含有1 132个SSRs,占无冗余EST序列的9.78%,平均每7.37 kb EST出现1个SSR位点。二核苷酸重复基元SSR出现频率最高(51.06%),其次是三核苷酸(33.57%),AG/TC、GA/CT和AAG/TTC是二、三核苷酸中的优势重复基元。裂叶牵牛EST-SSRs以4～10次重复为主,基序长度主要集中于20～30 bp。结论裂叶牵牛EST-SSR的出现频率高,重复类型丰富,理论上表明这些EST-SSRs具有较高的可用性。本实验通过对裂叶牵牛EST资源的SSR信息的研究,为分子水平和生物信息学角度上开发裂叶牵牛的SSR功能性标记提供了候选序列。; 刘越范增华孙洪波冯金朝张水仙熊圣文刘生全黄璐琦

槲寄生化学成分及药理作用研究进展被引量：26: 2011年; 本文对槲寄生的化学成分、药理作用及分子生物学等方面的研究进展进行综述,为今后该药用资源的研究与开发提供参考。; 张水仙刘越孙洪波姚雪楠冯金朝; 关键词：槲寄生化学成分药理作用生物技术

国内动物DNA条形码研究进展评述被引量：6: 2013年; DNA条形码作为当代生命科学领域最为活跃的学科之一受到了我国科研工作者的高度重视。以DNA条形码与COI(cox1)为检索词,在知网与维普数据库对2005-2012年可获中文文献进行搜集,以数据分析的方式对国内DNA条形码的研究动态及现状进行总结与评价,以期为后续研究提供我国在DNA条形码研究领域的概况参考。; 姚雪楠刘越薛堃冯晓晓张水仙马徐李军德; 关键词：DNA条形码论文发表

武陵山地区濒危植物遗传多样性研究进展被引量：2: 2015年; 武陵山地区位于湘鄂渝黔交界处。区内地理成分复杂,气候温暖湿润,生态环境复杂多样,孕育着丰富的生物资源,但是也有许多濒危物种亟需人们的研究与保护。查阅相关文献及综述,对武陵山地区的濒危植物资源调查、遗传多样性研究和保护利用进行概括、分析和总结,为武陵山地区的资源保护和可持续发展提供参考依据,对地区生物多样性起积极作用。; 马徐刘越冯晓晓张水仙姚雪楠张琳霞孙洪波; 关键词：武陵山濒危植物可持续发展

基于蒙药冷蒿基因组低通量测序的SSR遗传多样性分析: 冷蒿(Artemisiafrigida)，蒙古族常用药用植物，全草入蒙药，蒙药名为“阿给”。冷蒿为菊科蒿属多年生小半灌木，别名小白蒿、寒蒿，在内蒙古地区分布尤为广泛，还分布于我国东北、华北、青海及新疆等地，此外北美洲的加...; 张水仙; 关键词：微卫星标记; 文献传递

蒙药冷蒿的分子标记开发: 目的：冷蒿(Artemisia frigida),蒙古族常用药用植物,全草入蒙药,蒙药名为"阿给".冷蒿为菊科蒿属多年生小半灌木,别名小白蒿、寒蒿,在内蒙古地区分布尤为广泛.在临床上主治各种出血、关节...; 刘越张水仙霍纳新董玲丽王翊冯晓晓马徐Gu Yong Qiang; 关键词：冷蒿 SSR

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张水仙