束正齐
- 作品数：10 被引量：32H指数：3
- 供职机构：云南省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学经济管理生物学更多>>
- 甘蓝型油菜的花期与生育期QTL定位被引量：3
- 2019年
- 【目的】对甘蓝型油菜花期和生育期QTL进行定位,为精细定位和克隆早花基因及开展分子标记辅助早熟油菜品种选育提供理论依据。【方法】以极早熟甘蓝型油菜G28、甘蓝型油菜H008及以二者为亲本构建的175个F1DH株系为材料,利用甘蓝型油菜60K SNP芯片分型技术绘制高密度遗传连锁图谱,并采用完备复合区间作图法对2016─2017年度丽江和临沧2个生长环境下甘蓝型油菜的花期(FT)和生育期(MT)田间调查数据进行QTL扫描分析。【结果】F1DH株系花期与生育期具有较明显的超亲现象,表明双亲材料控制花期和生育期的位点不同。F1DH株系在丽江生长环境下花期与生育期相关系数为0.63,在临沧生长环境下二者相关系数为0.79,即花期与生育期呈较高的正相关。利用SNP芯片构建的高密度遗传连锁图谱共包含19条连锁群,7601个SNPs位点,总长3838.2 c M。在丽江和临沧2个生长环境下共检测到6个花期QTL和5个生育期QTL,分布于A02、A07、C02、C03、C06、C07和C09连锁群上,可分别解释2.96%～17.40%和4.98%～11.82%的遗传变异。花期QTL qFTA02-1和qFTC03-2在2生长个环境下均可检测到,加性效应值相反,其中qFTA02-1具有最高的LOD值(20.43)、贡献率(17.40%)和加性效应值(3.27 d),且与生育期QTL qMTA02-1置信区间重叠,是最主要的花期主效QTL;qFTC03-2为次要的花期主效QTL。在qFTA02-1置信区间内发现2个拟南芥花期调控关键基因FLC和FY的油菜同源基因拷贝BnaA02g00370D和BnaA02g01670D。【结论】花期主效QTL qFTA02-1和qFTC03-2可用于分子标记辅助选育早熟油菜品种。BnaA02g00370D和BnaA02g01670D可能为qFTA02-1置信区间内控制甘蓝型油菜花期性状的目标基因。
- 俎峰赵凯琴张云云田正书刘亚俊奚俊玉束正齐符明联
- 关键词：甘蓝型油菜花期生育期QTL定位
- 油菜杂交种DNA高通量获取方法被引量：3
- 2020年
- 通过油菜(Brassica napus)杂交种深孔板内发芽,简化碱裂解法提取DNA步骤,配合高通量研磨器Fast&Fluid Management SK300样品混匀仪的使用,提供了一整套快速高通量低成本获取油菜杂交种子叶DNA样品的集约化方案。该方法可以实现10 h完成万份DNA样品的提取,极大提高了DNA获取效率,有利于利用分子标记对杂交油菜种子进行纯度鉴定。
- 俎峰李霞何晓莹赵凯琴陈苇束正齐董云松
- 关键词：杂交种DNA提取分子标记纯度鉴定
- 浅谈计算机信息技术与我国农业现代化被引量：10
- 2007年
- 论述国外几个发达国家及我国的计算机信息技术的发展和在农业领域的具体应用情况,在此基础上简要介绍精确农业,分析计算机信息技术在我国农业应用中存在的问题,并提出加强农业信息技术发展,促进农业信息化的设想。
- 晏发斌周航白建明杨琼芬李正平包丽仙依香伦涂菊华束正齐
- 关键词：信息技术农业科技农业现代化
- 芸薹属SSR标记e-PCR与云南省芥菜型油菜种质遗传多样性分析被引量：2
- 2023年
- 云南芥菜型油菜种质资源丰富,为整理前人搜集的275份芥菜型油菜种质材料亲缘关系与评估电子PCR技术(e-PCR)的实用性,本研究利用搜集的17713对公开发表的芸薹属作物SSR标记在芥菜型油菜参考基因组和cDNA序列中进行e-PCR分析后挑选引物进行群体PCR分析。e-PCR分析结果显示8016对预期有扩增产物,共计扩增37272个位点,平均每对引物扩增4.65个位点;其中336对引物在基因组与cDNA序列均预期扩增2个位点。从336对引物中随机挑选合成20对预期扩增位点覆盖全基因组的SSR标记组合进行群体分析,PCR电泳结果共检测出63个条带,每对引物多态性片段为2~5个,平均每对引物可扩增3.15个条带;标记PIC值变化范围0.03~0.69,平均PIC值0.45,结果符合e-PCR分析预期。群体遗传聚类分析结果表明,云南芥菜型油菜的亲缘关系并不完全与地域性相关,少数来源不同地区的材料也可聚成一类;275份材料可在遗传相似系数为0.70处被划分为八大类群,95份原始记录信息缺失的种质材料大多位于第Ⅷ大类。本研究同时从分子标记层面理清了275份芥菜型油菜种质材料亲缘关系,验证了e-PCR分析结果的有效性,并绘制扩增芥菜型油菜基因内部序列的SSR标记图谱,这将为芥菜型油菜种质资源评价,保护及后续育种利用提供有力的理论依据与技术支持。
- 任静何晓莹原小燕李根泽李庆刚束正齐程小毛俎峰
- 关键词：芥菜型油菜种质资源SSR标记
- 利用SNP芯片构建甘蓝型油菜高密度遗传连锁图谱及含油量性状QTL分析被引量：2
- 2019年
- 【目的】在云南生境下挖掘甘蓝型油菜含油量QTL位点,为高含油量性状遗传机制研究和分子标记辅助高含油量育种提供理论基础。【方法】以高含油量材料G28为母本,低含油量材料H008为父本,通过小孢子培养技术创建包含175份株系的F1 DH群体,利用60K SNP芯片构建高密度遗传连锁图谱,结合2016-2017年丽江与临沧点DH群体含油量数据采用完备区间作图法,以LOD=2.5为阈值扫描含油量性状QTL。【结果】DH群体含油量性状呈现正态分布,表现出单向超亲分离。2个环境下共检测到6个含油量QTL,分别可解释6.29%~10.36%的表型变异。通过Blast分析将这6个QTL分别映射到参考基因组-Darmor-bzh ChrA01,ChrA10,ChrC05与ChrC08染色体物理图谱上。与前人研究比较分析推测位于C05染色体上的qOCc05.1与qOCc05.2为新的含油量性状相关的QTL。【结论】在云南生境下检测到6个含油量性状QTL并明确了其在染色体的物理区间,定位结果可用于下一步主效QTL的精细定位和分子标记辅助高含油量油菜育种。
- 俎峰赵凯琴张云云原小燕田正书贺斌奚俊玉束正齐符明联
- 关键词：DH系甘蓝型油菜含油量QTL
- 甘蓝型油菜BnEOD3基因克隆与比较测序分析被引量：1
- 2019年
- 【目的】克隆拟南芥籽粒大小发育母体效应基因EOD3在甘蓝型油菜籽粒中表达的同源基因拷贝,并在大、小籽粒材料间开展序列比较分析。【方法】以1份大籽粒与1份小籽粒种质发育中的籽粒为研究材料,利用RT-PCR克隆发育中籽粒表达的BnEOD3基因拷贝,结合生物信息学手段在大、小籽粒材料间进行差异比较分析。【结果】生物信息学分析发现BnEOD3基因在甘蓝型油菜中有4个同源拷贝(BnaC04g00760D,BnaA05g01200D,BnaC04g50960D,BnaA04g27100D)。其中BnaA04g27100D在大、小籽粒材料发育籽粒中均有表达,且在第114碱基处存在SNP变异(大籽粒为C,小籽粒为G),BnaC04g50960D则仅在小籽粒材料中检测到表达,BnaC04g00760D与BnaA05g01200D基因则在大、小籽粒中均未检测到表达。【结论】BnEOD3基因仅有2个拷贝(BnaA04g27100D和BnaC04g50960D)在发育籽粒中检测到表达,其中BnaA04g27100D在第114碱基处的SNP变异导致氨基酸序列甘氨酸(G)与丙氨酸(A)的氨基酸的差异,可能与大、小籽粒性状有关。
- 俎峰李霞何晓莹张国建张建昆董云松王敬乔束正齐陈苇
- 关键词：油菜基因克隆
- 甘蓝型油菜花粉粒ARTP诱变及后代表型鉴定
- 2021年
- 为获得高含油量油菜的变异株系,开展了甘蓝型油菜(Brassica napus L.)花粉粒ARTP诱变试验。以甘蓝型油菜Ogu-CMS恢复系16C花粉为诱变材料,采用ARTP诱变技术分别辐照0、20、30、40 min,再将诱变后的花粉授于同一群体中自然产生的不育单株16CS。调查不同ARTP辐照时间下的诱变花粉授粉当代单角粒数及后代子粒发芽势、发芽率、不育株率和含油量的变化情况。结果表明,ARTP辐照甘蓝型油菜花粉30 min以上,能显著降低诱变花粉授粉当代单角粒数及后代M0代子粒的发芽势和发芽率,提升M0代植株的不育株率,提升M1代子粒的含油量,获得了含油量高达52.61%突变株系ARTP30-315。初步表明利用ARTP-P仪开展油菜花粉粒诱变是有效的,较为适宜的ARTP辐照时间为30~40 min。为生产上应用ARTP-P仪开展甘蓝型油菜花粉粒诱变探索出一个较为适宜的参数体系,为开展油菜种质创新提供了新的方法与思路。
- 何晓莹陆文虎师伟策王文敏王敬乔陈苇张国建张建昆束正齐俎峰
- 关键词：花粉粒雄性不育含油量
- 根肿病对云南十字花科作物的影响与对策被引量：4
- 2022年
- 参考国内外研究进展,重点阐述了根肿病对云南地区十字花科作物的危害以及根肿病大肆流行的原因,简述了应对根肿病的主要防治对策及存在问题,并以实地调研、网络查阅与试验相结合的方式对云南地区根肿菌种群分化类型做了进一步分析。结果表明,云南地区芸薹根肿菌(Plasmodiphora brassicae Woronin)种群类型丰富。
- 王娇娇何晓莹何晓莹俎峰赵凯琴束正齐罗延青
- 关键词：根肿病十字花科作物
- 甘蓝型油菜BnFAD2基因的生物信息学分析被引量：1
- 2021年
- 以拟南芥(Arabidopsis thaliana)AtFAD2为参考序列,通过BLAST进行同源序列比对,获得FAD2基因在甘蓝(Brassica oleracea)、白菜(Brassica rapa)和甘蓝型油菜(Brassica napus)基因组中的同源拷贝。运用生物信息学方法分析其氨基酸序列的组成、蛋白质基本理化性质、亚细胞定位、亲水性和疏水性、蛋白质二三级结构、保守结构域,并对FAD2基因编辑靶点进行预测及sgRNA设计。在白菜、甘蓝与甘蓝型油菜获得2条FAD2基因同源蛋白质序列;亚细胞定位显示这些AtFAD2同源蛋白质均位于内质网,肽链表现为疏水性、比较稳定;蛋白质序列二三级结构预测表明,主要以α-螺旋和无规则卷曲为组成成分;蛋白质序列保守结构域分析显示,FAD2具有高度的序列保守性,属于Membrane-FADS-like超家族,且含PLN02505保守结构域;系统进化树构建分析显示,甘蓝型油菜和白菜、甘蓝以及芥菜型油菜具有紧密的亲缘关系;CRISPR-Cas9基因编辑靶点分析发现,甘蓝型油菜FAD2基因中存在10段高度保守性序列可作为候选靶点,并设计出相应的sgRNA。
- 陈镇何晓莹王敬乔李根泽束正齐赵凯琴程小毛俎峰
- 关键词：甘蓝型油菜FAD2生物信息学油酸
- 甘蓝型油菜Ogura胞质不育系主要农艺性状配合力与遗传力分析被引量：6
- 2015年
- 利用35个甘蓝型油菜Ogura胞质不育系与4个恢复系进行配合力及遗传力分析。采用4×35不完全双列杂交,对140个组合的9个重要农艺性状进行了配合力和遗传力的估算,其中包括根据云南地方气候特点制定的主茎冻荚与主茎阴荚性状。研究表明,一般配合力综合排名母本前5名分为A19>A29>A21>A20>A2;父本优劣排名次序为21R>64R>68R>16R;单株产量特殊配合力最好的组合为A17×21R。本研究旨在探明亲本材料的应用潜力,为生产上利用Ogura胞质不育系统选育甘蓝型油菜强优势组合提供数据支持。
- 张国建俎峰刘坚坚李劲峰董云松罗延青赵凯琴陈苇束正齐王敬乔
- 关键词：甘蓝型油菜农艺性状配合力遗传力
