秦向东
- 作品数：4 被引量：5H指数：1
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 癌症基因表达谱挖掘中的特征基因选择算法GA/WV被引量：1
- 2010年
- 鉴定癌症表达谱的特征基因集合可以促进癌症类型分类的研究,这也可能使病人获得更好的临床诊断?虽然一些方法在基因表达谱分析上取得了成功,但是用基因表达谱数据进行癌症分类研究依然是一个巨大的挑战,其主要原因在于缺少通用而可靠的基因重要性评估方法。GA/WV是一种新的用复杂的生物表达数据评估基因分类重要性的方法,通过联合遗传算法(GA)和加权投票分类算法(WV)得到的特征基因集合不但适用于WV分类器,也适用于其它分类器?将GA/WV方法用癌症基因表达谱数据集的验证,结果表明本方法是一种成功可靠的特征基因选择方法。
- 申伟科钟理葛昆张波王建飞张小刚秦向东
- 关键词：模式识别
- 乳腺癌蛋白质芯片的构建及其肿瘤标志物的筛选
- 2009年
- 目的制备乳腺癌蛋白芯片并初步用于乳腺癌肿瘤标志物(TM)筛选。方法利用蛋白芯片检测系统及双荧光标记法用30份乳腺癌患者和30份正常对照人群血清样品进行淘洗、初筛、诊断鉴定,从系统中寻找可用于乳腺癌检测的TM。结果通过筛选,有Ⅱ-B3(0.056 1)、Ⅱ-B4(0.067 9)、Ⅱ-D10(0.071 2)其P值在0.05附近。结论初步筛选得到的蛋白特异性较低,需对实验条件优化提高筛选效率。
- 张波钟理葛昆申伟科王建飞张小刚秦向东
- 关键词：乳腺肿瘤蛋白芯片肿瘤标志物
- 食管癌组织中HAAH基因表达及临床意义被引量：1
- 2010年
- 目的探讨人类天冬氨酸盐β羟化酶(HAAH)基因对食管癌的诊断价值。方法采用半定量RT-PCR法检测23份食管癌组织及其癌旁组织中HAAH基因表达水平,并对实验数据进行统计学分析。结果食管癌及癌旁组织HAAH基因表达率分别为100%(23/23)、78.3%(18/23),P>0.05。灰度扫描半定量分析,HAAH mRNA在食管癌组织及癌旁组织中的表达水平值分别为0.688±0.238、0.319±0.157,P<0.01。经ROC曲线分析,取0.489作为HAAH基因表达水平的阈值时,73.9%(17/23)的癌组织呈现高表达,而癌旁组织中高表达率仅为13%(3/23),P<0.01。结论HAAH基因在食管癌组织中呈高表达;其可作为食管癌诊断的标志物。
- 王建飞钟理陈冬张小刚王皓葛昆秦向东
- 关键词：食管癌
- DKK1在胃癌患者癌组织及血清中的表达及临床意义被引量：3
- 2010年
- 目的探讨分泌型蛋白Dickkopf-1(DKK1)在胃癌诊断中的价值。方法采用半定量RT-PCR法检测25份胃癌及15份癌旁组织中DKK1 mRNA表达水平;采用Western blot法检测17份胃癌和15份癌旁组织DKK1蛋白表达水平;采用ELISA法检测34份胃癌患者及38份健康人血清中DKK1蛋白含量。结果与癌旁组织相比,有24%(6/25)的胃癌组织DKK1 mRNA表达上调,4%(1/25)的胃癌组织中DKK1 mRNA表达下降,P均<0.05;72%的胃癌组织DKK1 mRNA表达与癌旁组织无显著差异;5.88%(1/17)的胃癌组织DKK1蛋白表达上调,11.76%(2/17)的胃癌组织中DKK1蛋白表达下降,P均<0.05,82.36%胃癌组织DKK1蛋白表达与癌旁组织无显著差异;胃癌患者血清中DKK1蛋白含量明显低于健康人,P<0.01;当确定DKK1蛋白含量阈值为3.539 0μg/L时,其诊断敏感性为61.8%,特异性为84.2%。结论胃癌患者血清DKK1蛋白含量明显低于健康人,其可能作为胃癌的血清学诊断指标,但有待大样本进一步验证。
- 张小刚钟理刘青王建飞王皓葛昆秦向东
- 关键词：血清
