陆红云
- 作品数:2 被引量:4H指数:1
- 供职机构:温州医学院生命科学学院更多>>
- 发文基金:浙江省自然科学基金温州市科技计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 大肠埃希菌质粒氨基糖苷类耐药基因分布及多态性研究
- 2011年
- 目的 通过大规模测序研究临床分离的大肠埃希菌的质粒基因组所携带的氨基糖苷类耐药基因分布及其多态性.方法 收集4年临床分离非重复的320株大肠埃希菌.菌株分为两个部分,碱裂解法提取全部质粒,Solexa测序获得大规模的短序列.采用比较基因组学和分子进化方法分析两个样本所含的氨基糖苷类耐药基因类型及丰度的差异,研究氨基糖苷类耐药基因存在的核苷酸多态位点.结果 测序法获得两批数据,E1短序列总数为11 077 768,可以定位到参照序列上为71 528(0.646%).E2短序列总数为9 377 792,可以定位到参照序列上是49 944(0.532%).两个样本中共有9个氨基糖苷类耐药基因型,strB基因最多,其次是strA、aacC2.两个样本中9个氨基糖苷类耐药基因共发现67个单核苷酸多态性(SNPs)位点,约50%为非同义突变.同一个位点的A、G二核苷酸多态现象常见.结论 此次样本中大肠埃希菌质粒上分布多种氨基糖苷类耐药基因.存在着大量的SNPs.
- 陆红云王善振齐云玲李佩珍应俊周铁丽王慧丽包其郁李劲松
- 关键词:大肠埃希菌质粒氨基糖苷类抗生素单核苷酸多态性
- 大肠埃希菌CTX-M-9组超广谱β-内酰胺酶耐药基因研究被引量:4
- 2011年
- 目的了解CTX-M-9组超广谱β-内酰胺酶(ESBLs),在温州地区分离的产ESBLs大肠埃希菌中的分布,分析CTX-M-9组基因的种类、数量以及多态性。方法收集2005-2006年临床分离非重复的145株ESBLs大肠埃希菌,纸片扩散法检测ESBLs,聚合酶链反应(PCR)检测CTX-M-9组ESBLs基因,对PCR产物进行测序以确定基因型,核酸序列比对分析SNPs位点。结果 145株ESBLs大肠埃希菌中,114株携带CTX-M-9组基因,阳性率78.6%;其中2005年73株中CTX-M-9组基因阳性60株占82.2%,2006年72株中阳性54株占75.0%,各阳性菌株的ESBLs基因均与CTX-M-9组中的CTX-M-14型相似,25株菌的CTX-M-14基因5个位点发生点突变,造成80、158、242、275位氨基酸改变。结论温州地区大肠埃希菌CTX-M-9组ESBLs耐药基因传播情况严重,检测到的均与CTX-M-14型相似,部分样本有点突变,并引起相应的氨基酸的改变。
- 陆红云兰晓霞彭丽张谦卢丹赵支松张洪勤周铁丽李劲松
- 关键词:大肠埃希菌耐药基因产超广谱Β-内酰胺酶