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韩晨

作品数:7 被引量:0H指数:0
供职机构:中国科学院化学研究所更多>>
发文基金:中国科学院“百人计划”国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
相关领域:理学生物学一般工业技术轻工技术与工程更多>>

文献类型

  • 6篇会议论文
  • 1篇期刊文章

领域

  • 3篇理学
  • 1篇生物学
  • 1篇轻工技术与工...
  • 1篇一般工业技术

主题

  • 4篇非天然氨基酸
  • 4篇分子
  • 3篇动力学
  • 3篇动力学模拟
  • 3篇酰胺
  • 3篇分子动力学
  • 3篇分子动力学模...
  • 2篇构象
  • 2篇光谱
  • 2篇红外
  • 2篇红外光
  • 2篇红外光谱
  • 2篇分子构象
  • 2篇分子力学
  • 2篇FTIR
  • 2篇MOLECU...
  • 1篇振动
  • 1篇振动频率
  • 1篇溶剂
  • 1篇溶剂化

机构

  • 7篇中国科学院

作者

  • 7篇韩晨
  • 7篇王建平
  • 2篇赵娟
  • 2篇石纪培

传媒

  • 1篇Chines...
  • 1篇第十七届全国...
  • 1篇第十七届全国...

年份

  • 2篇2012
  • 1篇2011
  • 3篇2010
  • 1篇2009
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
基于分子力学的β-肽酰胺-Ⅰ带振动
利用超快红外光谱实验、量化计算以及分子动力学模拟研究了氮乙基丙酰胺(NEP)的动态结构.建立了基于分子力学的静电频率转换模型(MM-MAP),研究了NEP溶液相中酰胺-Ⅰ带的光谱.利用此MM-MAP预测了一个β-七肽分子...
赵娟石纪培韩晨王建平
关键词:FTIR
文献传递网络资源链接
含有非天然氨基酸的三肽分子构象的酰胺-I带研究
研究了非天然氨基酸Pra分子中C=O基团在不同溶剂环境中的红外吸收峰变化。利用红外光谱实验、量子化学计算及分子动力学模拟等手段研究了一种含Pra的三肽分子(Ac-Pra-Pra-NH
韩晨王建平
关键词:非天然氨基酸红外光谱分子动力学模拟
文献传递
非天然氨基酸H-Pra-OH的非谐性振动和溶剂化影响
韩晨王建平
基于分子力学的β-肽酰胺-Ⅰ带振动
利用超快红外光谱实验、量化计算以及分子动力学模拟研究了氮乙基丙酰胺(NEP)的动态结构。建立了基于分子力学的静电频率转换模型(MM-map),研究了NEP溶液相中酰胺-Ⅰ带的光谱。利用此MM-map预测了一个β-七肽分子...
赵娟石纪培韩晨王建平
关键词:分子动力学模拟FTIR
文献传递
Temperature-Dependence of the Amide-Ⅰ Frequency Map for Peptides and Proteins
2011年
In our recent work [Phys. Chem. Chem. Phys. 11, 9149 (2009)], a molecular-mechanics force field-based amidc-Ⅰ vibration frequency map (MM-map) for peptides and proteins was constructed. In this work, the temperature dependence of the MM-map is examined based on high-temperature molecular dynamics simulations and infrared (IR) experiments. It is shown that the 298-K map works for up to 500-K molecular dynamics trajectories, which reasonably reproduces the 88 ℃ experimental IR results. Linear IR spectra are also simulated for two tripeptides containing natural and unnatural amino acid residues, and the results are in reasonable agreement with experiment. The results suggest the MM-map can be used to obtain the temperature-dependent amide-Ⅰ local mode frequencies and their distributions for peptide oligomers, which is useful in particular for understanding the IR signatures of the thermally unfolded species.
韩晨王建平
非天然氨基酸与生物水相互作用的从头算分子动力学模拟
<正>生物分子周围的第一层溶剂水,通常被称为"生物水"分子。生物分子与生物水之间的动态相互作用,对生物分子的结构与功能至关重要。从头算分子动力学(ab initio molecular dynamics)是将第一性原理与...
韩晨王建平
关键词:非天然氨基酸
文献传递
含有非天然氨基酸的三肽分子构象的酰胺-Ⅰ带研究
研究了非天然氨基酸Pra分子中C-O基团在不同溶剂环境中的红外吸收峰变化。利用红外光谱实验、量子化学计算及分子动力学模拟等手段研究了一种含Pra的三肽分子(Ac-Pra-Pra-NH2)的动态结构信息,利用MM-Map方...
韩晨王建平
关键词:非天然氨基酸红外光谱分子动力学模拟
共1页<1>
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