乔亮
- 作品数：23 被引量：13H指数：1
- 供职机构：复旦大学化学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市科学技术委员会资助项目国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学医药卫生生物学自动化与计算机技术更多>>
- 氨基修饰的大孔氧化硅泡沫材料辅助的off-gel酶解分离体系
- 生物样品一般具有很高的复杂性,在分析检测中,质谱技术常与色谱和凝胶电泳等技术串联使用从而降低样品复杂度和提高检测效果.然而此过程步骤繁琐,费时费力.为了加快实验流程和减少实验操作中样品损失,我们利用氨基修饰的大孔氧化硅泡...
- 甘金蕊李怡欣乔亮樊惠芝刘宝红
- 基于微流控芯片-质谱联用的细菌耐药分析
- 抗生素耐药(AMR)严重影响公众健康和社会安全,是当今社会亟待解决的难题[1]。当用抗生素进行灭菌时,细菌通常会经历形态变化。据报道,上述形态变化可以导致细菌耐药性的产生[2]。为了理解细菌耐药性发展的机制,我们设计并构...
- 乔亮张冬雪
- 关键词：细菌耐药微流控质谱蛋白质组
- 基于光电氧化还原的离子源内蛋白质分析研究
- ＜正＞激光解析离子化已被广泛地应用于生物大分子的分析检测,在这一过程中形成了大量活性物质例如电子、质子、自由基、离子,这些活性物相互作用得到了最终结果。研究这些源内活性物质的光电氧化还原反应对于了解MALDI机理、拓展其...
- 乔亮纪季刘芸陈惠张松杨芃原孔继烈刘宝红
- 质谱信号放大技术超灵敏检测蛋白质标志物
- 蛋白质是生命活动的重要参与者,人类绝大多数疾病都与蛋白质的异常相关[1, 2],由于不同的疾病可能存在相同的标志物,所以多种标志物的同时检测对于疾病的确定更有意义[3, 4]。然而,作为疾病标志物的蛋白质分子含量极低,直...
- 王宇宁杜睿君乔亮刘宝红
- 关键词：标志物膜蛋白质谱信号放大
- 文献传递
- 电化学联用技术在光电催化和传感中的应用
- 分析化学对生命科学和新材料新能源等领域的发展起到了重要的促进作用,电化学与其它技术的联用是提高分析灵敏度和分辨率的有效方法之一。原位、高时空分辨表征反应过程,对于新型催化剂的开发制备和性质研究均具有重要意义,仅通过传统的...
- 张昆刘书娟刘玉洁赵静静乔亮刘宝红
- 关键词：微流控芯片质谱光谱
- 文献传递
- PCR-核酸飞行时间质谱系统检测新型冠状病毒方法的建立及应用研究被引量：12
- 2020年
- 背景新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在全球暴发,实验室检测结果是疾病诊断的重要依据,检测方法的灵敏度和特异度是影响实验结果的关键因素,现实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)核酸检测方法是COVID-19确诊的通用方法,但其检测灵敏度有方法局限性,依赖标本病毒含量。通过对PCR-核酸飞行时间质谱检测方法的优化,从而提高对低新型冠状病毒(SARS-CoV-2)含量病例检测的灵敏度,可为现有方法做有效补充。目的应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)原理,在Clin-ToFⅡ飞行时间质谱系统上,建立PCR-核酸飞行时间质谱(PCR-TOF MS)系统检测SARS-CoV-2的方法,并评估其实际应用价值。方法2020年2—3月于上海市临床检验中心室间质评阳性样本40份、阴性样本7份,国家卫生健康委员会室间质评阳性样本41份、阴性样本33份,本实验室购买阳性质粒及稀释样本32份,健康人样本28份,空白对照超纯水5份,共186份样本作为建立PCR-TOF MS系统数据。于2020年1—2月收集安徽省内临床送检到安徽省疾病预防控制中心的疑似COVID-19患者上呼吸道样本80份(咽拭子样本55份、痰液样本25份)及健康人群样本20份(均为咽拭子样本)作为评估PCR-TOF MS系统效果的数据。建立PCR-TOF MS系统试验体系步骤,包括PCR扩增、虾碱性磷酸酶(SAP)消化、单碱基延伸和质谱检测;并基于阳性质粒优化模版量,根据186份样本检测质谱峰的信噪比(SNP)确定该方法在SARS-CoV-2检测时的判读标准。对80份疑似SARS-CoV-2样本和20份健康人群样本进行检测分析,并与实时荧光定量PCR法进行对比。结果通过对PCR-TOF MS模板条件的优化,模版量6μl时,扩增产物可获得典型的质谱峰图。建立的PCR-TOF MS反应体系可以对SARS-CoV-2核酸的开放读码框1ab(ORF1ab)基因和核壳蛋白(N)基因进行有效扩增检测。本研究PCR-TOF MS方法对临床疑似病例样本的检出率为9
- 王俊张栋陈晴晴俞俊岭杨奕乔亮孙永
- 关键词：新型冠状病毒基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱核酸检测
- 基于质谱技术的非靶向检测微生物新算法、新技术
- 病原微生物可以引起多种疾病,是对公共卫生和安全产生的严重威胁。发展非靶向的、灵敏的微生物检测方法对于食品安全和临床诊断等需求至关重要。传统的微生物检测鉴定主要依赖于基于细菌培养的生化实验,耗时长、成本高、对检测人员的技术...
- 乔亮杨奕程鼎易佳张茹潭张冬雪
- 关键词：微生物MALDI-TOF微流控
- 生物质谱在生物制品宿主细胞蛋白残留分析中的应用
- 2024年
- 宿主细胞蛋白(host cell proteins,HCPs)残留影响生物制品的质量和安全,是生物制品生产的关键质控要素。目前,HCPs残留的主要质控方法是酶联免疫吸附试验(ELISA),但该方法的准确性高度依赖于抗体的特异性,且无法获得HCPs的种类及其含量分布信息,需要使用正交方法全面监测。而生物质谱技术无需依赖抗体即可实现HCPs的定性和定量分析,已逐渐成为除ELISA法外的主要分析表征方法,但质谱技术存在缺乏统一的操作流程和验证标准、高丰度药物信号抑制以及高昂的仪器成本等问题。本文总结了质谱法在生物制品HCPs分析中的工作流程及其应用进展,详细阐述了流程中涉及的样品准备、液相色谱分离、质谱数据采集、质谱数据分析和报告的开发原则和关键方法参数,并对未来的研究方向及挑战进行展望。
- 谢力琦王静朱添怡王佳馨黄懿乔亮
- 关键词：生物质谱生物制品
- 微生物宏蛋白质组从样品处理、数据采集到数据分析
- 2024年
- 微生物与人体疾病、健康密切相关,如何理解微生物群落的组成及其发挥的功能是一大亟需研究的问题。近年来,宏蛋白质组学已经成为研究微生物组成与功能的重要技术手段。然而,由于微生物群落样本的复杂性与高度异质性,样品处理、质谱数据采集与数据分析成为宏蛋白质组目前面临的三大挑战。在宏蛋白质组分析中往往需要针对不同类型的样品进行前处理优化,采取不同的微生物分离富集、提取和裂解方案。与单一物种蛋白质组相类似,宏蛋白质组学中的质谱数据采集模式有数据依赖性采集(data-dependent acquisition,DDA)模式和数据非依赖性采集(data-independent acquisition,DIA)模式。DIA数据采集模式可以完整地采集样品的肽段信息,具有很强的发展潜力。但是由于宏蛋白质组样品的复杂性,其DIA数据解析已成为阻碍宏蛋白质组深度覆盖的一大难题。在数据解析方面,最重要的步骤在于蛋白质序列数据库的构建。数据库的大小和完整性不仅对鉴定数量有很大影响,还会影响物种和功能水平上的分析。目前宏蛋白质组数据库构建的金标准是基于宏基因组的蛋白质序列数据库。同时,基于迭代搜库的公共数据库过滤方法也已被证明具有很强的实用价值。从具体的数据解析策略角度,以肽段为中心的DIA数据解析方法占据了绝对的主流。随着深度学习和人工智能的发展,其会极大地推动宏蛋白质组数据解析的准确度、覆盖度与分析速度。在下游生物信息学分析方面,近年来开发了一系列注释工具,可以在蛋白水平、肽段水平、基因水平上进行物种注释来获得微生物群落组成。与其他组学方法相比,微生物群落的功能分析是宏蛋白质组学的一个独特特征。宏蛋白质组已经成为微生物群落多组学分析中的重要组成部分,并且仍在覆盖深度、检测灵敏度、数据解析完整度
- 吴恩慧乔亮
- 关键词：样品前处理数据库
- 微纳酶反应器在膜蛋白分析中的应用研究
- 膜蛋白质作为细胞内外的重要门户和枢纽,在外界物质识别,运输以及信号传导等方面具有举足轻重的作用,约三分之一的基因组参与膜蛋白的编码[1]。因此,深入的研究膜蛋白在机体生理功能研究中具有重要的意义,然而由于膜蛋白的低丰度、...
- 方小泥乔亮晏国全杨芃原刘宝红
- 关键词：膜蛋白微反应器质谱
- 文献传递
