宋海娜
- 作品数:13 被引量:60H指数:6
- 供职机构:平顶山学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 大豆Rubisco大亚基含量QTL定位(英文)
- 2013年
- 摘要iRubisco是植物光合作用的关键酶。高等植物Rubisco由叶绿体基因编码的大亚基和核基因编码的小亚基组成,其催化活性位点位于大亚基。利用来自大豆品种科丰1号和南农1138—2的重组自交系群体NJRIKY及其分子遗传图谱,通过盆栽试验定位与Rubisco大亚基含量有关的QTL。检测到3个QTL,分别位于D2(染色体Gm17)、G(染色体Gm18)和O(染色体Gm10)连锁群上,LOD值为2.00~4.60,贡献率为4.50%~19.00%。这一结果表明,尽管大亚基由叶绿体基因编码,核基因组染色体的某些区段可调控其含量变化。这些区段内可能存在负责细胞核质间物质转运和/或信号传导的基因。
- 印志同孟凡凡宋海娜晁毛妮喻德跃
- 关键词:大豆重组自交系QTL
- 大豆光合气体交换参数的QTL分析被引量:11
- 2010年
- 光合气体交换参数是用来表示植物光合能力的常用指标。利用来自大豆品种科丰1号和南农1138-2的重组自交系群体NJRIKY(184个家系)及其分子遗传图谱,通过两年盆栽试验定位与光合速率、气孔导度、胞间CO2浓度和蒸腾速率有关的QTL。结果表明,4个参数的遗传力中等偏低,在0.48~0.60之间;两两间存在极显著正相关关系,相关系数在0.192~0.686之间;两年共检测到15个QTL,分别位于C1、C2、D2、E、H、I和O连锁群上,LOD值在2.25~6.31之间,贡献率为4.80%~12.30%;有6个QTL在不同环境下稳定表达,它们分别是控制光合速率的qPnC1.1、控制气孔导度的qSCD2.1和qSCI.1、控制胞间CO2浓度的qCiI.1和qCiO.1,以及控制蒸腾速率的qTrO.1;检测到4个同时控制两个或两个以上参数的标记区间,它们分别是C1连锁群上控制光合速率和气孔导度的sat_311~sct_191区间,E连锁群上控制光合速率、气孔导度和胞间CO2浓度的sat_172~satt268区间,I连锁群上控制气孔导度和胞间CO2浓度的satt726~satt330区间,以及D2连锁群上控制气孔导度和胞间CO2浓度的sat_296~sat_277区间。
- 印志同宋海娜孟凡凡许晓明喻德跃
- 关键词:大豆光合作用气体交换参数RIL群体QTL分析
- 大豆生物量与产量组分间的相关及关联分析被引量:19
- 2014年
- 生物量与后期的籽粒产量存在紧密联系,是决定作物经济产量的主要因素之一。本研究利用自然群体中的1142 SNP在2年环境下通过全基因组关联分析检测大豆基因组中与生物量及产量组分显著关联的SNP。结果表明:(1)生物量、百粒重和单株籽粒产量在自然群体中存在广泛的表型及遗传变异,并存在极显著的正相关,其中生物量与单株籽粒产量之间的相关略高于与百粒重;(2)两年环境下共检测到41、56和29个SNP分别与生物量、百粒重和单株籽粒产量显著关联,其中仅有6、19和1个SNP在2个环境中都被检测到;(3)共检测到15个SNP同时控制2个或2个以上性状,其中位于第19染色体上的BARC-029051-06057位点被检测到同时与生物量、百粒重和单株籽粒产量3个性状显著关联,表明有共同的遗传基础,同时也解释了性状间相关的遗传原因;(4)鉴定到的多个SNP与先前我们对叶绿素荧光参数及多个环境下产量相关性状的定位结果共位。这些显著关联SNP位点的鉴定,有助于理解生物量及产量相关性状的遗传机制,从而促进利用分子标记辅助选择聚合有利基因,实现未来大豆高产育种计划。
- 晁毛妮郝德荣印志同张晋玉宋海娜张怀仁褚姗姗张国正喻德跃
- 关键词:大豆自然群体
- 大豆耐低磷相关基因的定位与克隆被引量:3
- 2015年
- 大豆是食用油和植物蛋白的主要来源,土壤有效磷含量低是限制当前大豆生产的重要因素之一。鉴定优异耐低磷种质资源、快速发掘利用优异耐低磷基因、通过分子育种培育磷高效品种、改善大豆应对低磷胁迫的能力,是解决土壤有效磷含量低这一问题的有效途径。近年来,国内外开展了一些大豆磷效率相关基因的定位与克隆研究,但由于QTL连锁作图的精度较低,难以准确地分离候选基因,而大豆基因组的复杂性及相关功能基因分子机制的不明确阻碍了人们对大豆耐低磷特性本质的认识。文章综述了大豆耐低磷相关基因的定位、克隆及功能验证等方面的研究进展,分析了大豆耐低磷相关基因研究中存在的问题,以期为快速有效地分离目的基因、验证基因功能、解析大豆磷高效分子机制提供参考。
- 张丹宋海娜程浩喻德跃
- 关键词:大豆耐低磷基因定位分子育种
- 陆地棉Pht1家族成员的全基因组鉴定及表达分析被引量:7
- 2017年
- 【目的】磷是植物三大必需矿质元素之一,对植物的生长发育至关重要。Pht1家族的磷酸盐转运蛋白在植物磷吸收和转运方面具有重要作用,然而关于该基因的系统研究工作尚很少开展。本研究旨在进行Pht1家族成员全基因组鉴定和表达模式分析。【方法】通过生物信息学的方法对陆地棉Pht1家族成员的基因结构、编码蛋白质的结构、染色体定位、基因复制和表达情况等进行全面分析。【结果】(1)在陆地棉的基因组中共鉴定到17个磷酸盐转运蛋白基因(GhPT),其中A亚组包含8个GhPT,D亚组包含9个GhPT;(2)棉花GhPT蛋白之间序列相似性很高,并均具有12个疏水的跨膜区域;(3)进化分析表明这些GhPT蛋白主要聚为2大组(GroupⅠ和GroupⅡ),位于同一组的GhPT的编码基因大部分具有相似的内含子/外显子分布模式;(4)17个GhPT基因不均匀分布在A亚组和D亚组中的5条染色体上,串联复制和片段复制可能导致GhPT基因在陆地棉中的扩增;(5)表达模式分析表明,GhPT6和GhPT14在根中表达量最高,且同时响应低磷和低钾胁迫诱导并上调表达。【结论】这些结果将有助于深入了解Pht1家族基因的功能及离子信号途径相互作用的分子机制。
- 晁毛妮张志勇宋海娜李成奇张新胡根海张金宝王清连
- 关键词:陆地棉基因家族进化分析
- 一种多功能植物新品种育种架
- 本发明提供一种多功能植物新品种育种架,涉及植物培育技术领域,以解决现有的植物新品种育种架在使用过程中,多为箱式的结构,其中内部的环境统一设置,所以同一个批次出来的植物大致情况差不多,要想多组对照,需要进行多次培育,耗时比...
- 宋海娜李静婷贺军利
- 文献传递
- 灰霉病胁迫条件下的韭菜内参基因及内参基因的引物和应用
- 本发明属于基因工程育种技术领域,特别是涉及灰霉病胁迫条件下的韭菜内参基因及内参基因的引物和应用。本发明提供了灰霉病胁迫条件下的韭菜的内参基因UBC1和UBC2,所述UBC1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,UBC...
- 宋海娜贺军利程世平谢丽华姚鹏强张志录
- 野生豆Pht1基因家族的全基因组鉴定和表达分析被引量:1
- 2022年
- 植物体内磷的吸收、转运和再利用过程主要是由位于质膜上的磷酸盐转运蛋白基因(phosphate transporter 1,Pht1)家族调控。目前野生豆Pht1家族基因的鉴定和系统分析尚未见报道,为了研究野生豆Pht1家族基因的进化和功能,本研究通过同源序列比对的方法鉴定并获得了野生豆Pht1家族的15个基因,分布在8条染色体上。多序列比对和系统发育分析显示这些基因分为四组,分别包含10,2,2,1个基因。基因共线性分析显示Gs Pht1家族存在6对复制基因,分别是GsPht1;1/1;5,GsPht1;2/1;7,GsPht1;3/1;14,GsPht1;6/1;10,GsPht1;8/1;9和GsPht1;12/1;13。Ka/Ks分析显示野生豆Pht1家族基因的进化经受纯化选择,Tajima相对速率测验表明基因复制事件后复制基因增加了进化速率。Gs Pht1家族基因在不同组织的表达模式显示复制基因对具有组织表达特异性,低磷胁迫条件下该家族大部分基因在不同组织中被诱导表达。本研究结果为野生豆耐低磷分子机制的研究提供了依据。
- 宋海娜谢丽华程世平李彦娇
- 关键词:低磷胁迫
- 灰霉病胁迫条件下的韭菜内参基因及内参基因的引物和应用
- 本发明属于基因工程育种技术领域,特别是涉及灰霉病胁迫条件下的韭菜内参基因及内参基因的引物和应用。本发明提供了灰霉病胁迫条件下的韭菜的内参基因UBC1和UBC2,所述UBC1的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,UBC...
- 宋海娜贺军利程世平谢丽华姚鹏强张志录
- 文献传递
- 大豆开花盛期快速叶绿素荧光参数的QTL分析被引量:10
- 2011年
- 【目的】定位大豆R2时期(开花盛期)快速叶绿素荧光参数(JIP参数)QTL,分析不同参数间的遗传关系,比较参数在R2和R6时期(鼓粒盛期)遗传基础的异同。【方法】以大豆品种科丰1号和南农1138-2及其杂交衍生的184份重组自交系为材料,在盆栽条件下测定R2时期JIP参数,检测其QTL。【结果】检测到16个JIP参数QTL,分布在连锁群A1、C2、D2、I、M、N和O上,单个QTL的LOD值为2.40—5.65,贡献率为4.40%—20.06%;检测到3个同时控制多个参数的染色体区间,分别是连锁群C2上标记区间Satt286—Satt316、连锁群I上标记区间Sat_418—Satt650和连锁群O上标记区间Sat_231—Sat_196。【结论】不同JIP参数间既有共同的控制基因(QTL),也有各自独特的控制基因;JIP参数多数QTL不能在R2和R6时期重复检测到,控制其表达的遗传机制较为复杂;连锁群O上标记区间Sat_231—Sat_196在大豆R2和R6时期均检测到,该区间可能存在稳定表达的控制光合器官内禀结构和功能的基因,具有一定的育种价值。
- 印志同孟凡凡宋海娜晁毛妮许晓明邓德祥喻德跃
- 关键词:大豆重组自交系QTL定位