张建
- 作品数:22 被引量:41H指数:2
- 供职机构:南京大学物理学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目江苏省自然科学基金更多>>
- 相关领域:自动化与计算机技术生物学医药卫生一般工业技术更多>>
- 钙钛矿铁电体及其薄膜的相变、介电和非线性光学性质研究
- 钙钛矿氧化物铁电体同时具有压电,热释电,电光,声光,光折变和非线性光学效应,因而在微电子与光电子领域获得了大量的应用.基于这类材料的重大应用价值,该论文从理论上研究了钙钛矿氧化物铁电体及其薄膜的相变行为,介电性质,电子结...
- 张建
- 关键词:相变行为介电性质
- 文献传递
- 基于乳腺超声视频流和自监督对比学习的肿瘤良恶性分类系统
- 2024年
- 乳腺超声广泛应用于乳腺肿瘤诊断,基于深度学习的肿瘤良恶性分类模型可以有效地辅助医生诊断,提高效率,降低误诊率,然而,由于标注数据的高成本问题,限制了此类模型的开发和应用.为此,从乳腺超声视频中构建了无标注预训练数据集,包含11805个目标样本数据和动态生成的正、负样本数据集(样本量分别为188880和1310355个).基于该数据集,搭建了三胞胎网络并进行了自监督对比学习.此外,还发展了Hard Negative Mining和Hard Positive Mining方法来选取困难的正负样本构建对比损失函数,加快模型收敛.参数迁移后,将三胞胎网络在SYU数据集上进行微调和测试.实验结果表明,与基于ImageNet预训练的若干SOTA模型以及与前人针对乳腺超声的多视图对比模型相比,提出的三胞胎网络模型具有更强的泛化能力和更好的分类性能.此外,还测试了模型对标注数据量的需求下限,发现仅使用96个标注数据,模型性能即可达到AUC=0.901,敏感度为0.835.
- 唐蕴芯廖梅张艳玲张建陈皓王炜
- 关键词:乳腺超声
- 基于卷积神经网络的蛋白质折叠类型最小特征提取被引量:1
- 2020年
- 通过蛋白质的序列、结构等信息构建完整的蛋白质宇宙是生物信息学中的重要课题,相关研究对蛋白质结构预测、蛋白质进化路径分析以及蛋白质结构设计等方面的研究都有重要的意义.从蛋白质结构的一种简化表示——蛋白质接触图出发,通过训练卷积神经网络进行特征提取,筛选出可识别结构域折叠类型的最小特征向量,构建蛋白质折叠类型空间,并使用谱聚类等方法对不同蛋白质折叠类型的高维分布情况进行分析.得到的最小特征向量兼顾了信息的完整性与冗余度,可以很好地表示全部七种常见蛋白质类的空间关联.该研究结果填补了之前蛋白质宇宙研究中对不常见类的空间位置和相互关系描述的空白,加深了对于蛋白质结构相似性的理解.
- 潘越王骏王骏张建李文飞
- 关键词:卷积神经网络
- 非编码RNA三级结构预测及其折叠动力学研究
- 张建
- 根据该项目的研究目标,课题组发展了一套预测RNA三级结构的方法,同时研究了典型RNA赝结的折叠过程从而为结构预测提供新的思路。取得的具体成果如下:1)发展了一个新的基于RNA侧链构象的离散模型。这一模型具有概念上的创新性...
- 关键词:
- 关键词:网络服务器折叠动力学
- 基于句号特征字串的中文网页重复文档检测和过滤方法
- 本发明公开了一种基于句号特征字串的中文网页重复文档检测和过滤方法,包括如下步骤:提取待检测网页的句号特征字串;利用所述句号特征字串对待检测网页进行模板信息过滤以便保留和提取网页主题文本内容;计算所述网页主题文本内容的相似...
- 黄宜华袁春风韦永壮刘玉龙张建
- 文献传递
- 蛋白质分子体系和生物网络的物理特性
- 王炜王骏刘锋张建李文飞
- 蛋白质等生物大分子体系和生物网络是典型的软物质系统,具有丰富的生物学和物理学内涵。围绕其序列、结构和功能及相互关系,开展序列复杂性简化、结构折叠组装机制和功能调控动力学的研究是物理学与生物学交叉的科学前沿。例如,能否和如...
- 关键词:
- 关键词:蛋白质生物网络物理特性
- CT图像分辨率对人工智能肺结节辅助诊断系统诊断准确性的影响被引量:25
- 2020年
- 目的探讨肺部CT图像分辨率对人工智能(AI)辅助诊断软件肺结节诊断准确性的影响。方法前瞻性收集2019年9月~10月来我院行胸部CT平扫检查的患者35例。每位患者的肺部图像均使用两种不同分辨率进行重建,使用常规高分辨率512×512矩阵重建的为A组图像,使用超高分辨率1024×1024矩阵重建的为B组图像。使用AI辅助诊断软件分别对A、B两组图像进行肺结节分析,记录结节的密度类型、体积和最大径。同时由2名胸部影像诊断医师在AI辅助诊断的基础上,对B组图像进行肺结节分析,以2位医师的一致性意见作为该患者肺结节诊断的金标准。将肺结节按最大径>4mm和最大径≤4mm进行分类分析比较,不同分辨率组间AI辅助诊断结果的敏感性比较采用McNemar检验,P<0.05认为差异具有统计学意义。结果对于最大径>4mm和最大径≤4mm的结节,AI辅助诊断系统在超高分辨率(B组)图像的诊断敏感性均显著高于常规高分辨率(A组)图像(97.1%vs 75.4%、96.9%vs 74.8%),差异均具有统计学意义(χ^2=111.76、74.33,P均<0.01)。对于全部结节,B组的敏感性高于A组(97.0%vs 75.0%),差异具有统计学意义(χ^2=83.83,P<0.01)。A、B两组AI诊断结果的全部结节的假阳性检出率(FPDR)分别为17.6%和21.1%。结论使用超高分辨率肺部CT图像进行AI辅助肺结节诊断,无论结节大小,诊断的敏感性明显高于常规高分辨率图像。对于最大径>4mm的结节,FPDR没有明显变化。对于所有结节,FPDR则略有升高,可以提高肺结节诊断的准确性。
- 杨尚文胡安宁徐亚运张帅张建卢玉刘柏韵张冰杨雯辛小燕
- 关键词:肺结节人工智能超高分辨率
- 我国制药公司网站现状及分析
- 中国许多制药公司已经拥有自己的网站,但水平良萎不齐,大多数网站没有发挥应有的功能.为了深入了解中国制药公司网站的现状,包括形式和内容,辨别和记录中国制药公司网站中存在的主要问题,以免其它制药公司在制作网站时重蹈覆辙,作者...
- 张建
- 关键词:互联网
- 文献传递
- 一种基于深度学习的膝关节轮廓特征提取方法和装置
- 本发明公开了一种基于深度学习的膝关节轮廓特征提取方法和装置。该方法首先将样本中的膝关节图片格式化后组成训练样本集,样本包括膝关节图片和膝关节轮廓特征信息,膝关节轮廓特征信息包括膝关节内侧间隙宽度、膝关节外侧间隙宽度、膝关...
- 郭亚冲张冰王炜杨献峰周清清张建李文飞
- 纳米材料与生物分子的相互作用与微结构特性被引量:2
- 2012年
- 纳米材料是物理、化学、生物等领域所广泛关注的研究方向,主要分为无机材料、有机材料及复合材料。其中由纳米粒子与生物分子组成的复合材料因具有独特的光学、化学、电磁学等性质,在医学和医疗等方面有着良好的应用前景。此外,利用生物分子自组装的方法,可设计出具有复杂有序结构的复合材料。因此,研究纳米粒子和生物分子的相互作用对纳米材料的设计和应用有着重要的意义。本文从实验和计算机模拟两个方面综述了纳米粒子对生物分子(包括蛋白质、DNA、生物膜)结构特性以及热力学、动力学性质的影响,并概述了影响两者相互作用的多种因素,包括纳米粒子的尺寸、形状、浓度、表面特性等。
- 过馨露张建王炜
- 关键词:纳米材料蛋白质DNA生物膜