曾云
- 作品数：1 被引量：2H指数：1
- 供职机构：淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点建设实验室更多>>
- 发文基金：中央财政支持地方高校发展专项资金江苏省海洋资源开发研究院科技开放基金江苏省海洋生物技术重点建设实验室基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 基于ITS2和16S rRNA的西施舌群体遗传差异分析被引量：2
- 2013年
- 目前,我国西施舌群体分子遗传差异研究结果存在争议。分析我国南北沿海(9个群体)、与广西北海毗邻的越南(1个群体)西施舌核DNA的内转录间隔区2(ITS2)和线粒体DNA的16S rRNA基因(16S)片段核苷酸序列及其二级结构,为解决争议问题提供分子生物学资料。扩增获得西施舌ITS2片段和16S序列,其长度分别为389—402 bp和306 bp,加之下载序列共147条;序列分析显示,74个ITS2序列共有17种基因型,73个16S序列有15种单倍型,其中,长乐(CL)群体独享9种ITS2基因型和5种16S单倍型,非长乐群体(nCL)多数为群体间交叉共享1种或几种基因(单倍)型;基因(单倍)型核苷酸变异位点占5.7%(ITS2)和11.8%(16S);基于ITS2和16S的CL群体和nCL群体间的遗传距离与群体内遗传距离之比分别为2.42和11.08,nCL群体间的平均遗传距离均为0.007;二级结构显示CL群体ITS2的9种基因型和16S的5种单倍型均区别于nCL群体,nCL的ITS2和16S二级结构分别相似;ITS2和16S基因的系统发育分析显示,CL西施舌形成支持率很高(98,96)的单系支,而nCL群体则交叉聚为另一支(98,96)。研究结果揭示,福建西施舌是腔蛤蜊属(Coelomactra)的一个新种。
- 孟学平申欣赵娜娜田美曾云陈建安董志国程汉良阎斌伦
- 关键词：西施舌ITS1RRNA
