杨洋 作品数:33 被引量:57 H指数:4 供职机构: 新疆农业科学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划项目 新疆维吾尔自治区自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 轻工技术与工程 更多>>
棉花陆海渐渗杂交群体纤维品质性状的QTL定位 被引量:1 2023年 【目的】有效发掘利用海岛棉优异性状基因,拓宽陆地棉栽培种遗传基础。【方法】采用新疆主栽早中熟陆地棉品种新陆中60号为母本,与优质海岛棉品种新海41号为父本杂交,并以新陆中60号为轮回亲本构建出由151个BC 1 F 1单株组成的回交群体,利用SSR分子标记和Join Map4.0软件构建遗传连锁图谱,采用复合区间作图法(CIM)对BC 1 F 2纤维品质性状的进行QTL定位。【结果】构建的遗传连锁图谱包含52个多态性标记、14个连锁群,该图谱总长824 cM,覆盖棉花基因组的18.5%;最长的连锁群为150.3 cM,包含6个标记,最短的为0.3 cM,包含2个标记。检测到1个与纤维上半部平均长度相关的QTL,qFL-Chr14-1,定位在第14号染色体上,解释表型变异8.59%。【结论】筛选的与优质QTL位点相关SSR标记可应用于棉花优质分子标记辅助选择。 马君 杨延龙 师维军 汪鹏龙 郑巨云 郭仁松 胡文冉 杨洋关键词:棉花 纤维品质 QTL定位 棉花转基因“喷花法”应用条件优化的研究 被引量:1 2013年 针对目前众多的棉花转基因方法存在转化过程复杂、成本高、效率较低等问题,实验对转基因方法一“喷花法”进行优化,明确了在棉花育种科研中应用条件,达到快速、高效转化外源基因的目的。实验选用了5个陆地棉品种(系)和2个海岛棉品种为转化受体材料,转化了2个外源基因-抗虫(Bt+CpTI)和增强纤维品质基因(NPTII-GhCAD6),并对转化时等渗液各成分的比例、转化的时间段、温度及湿度条件等因素对转化率的影响进行研究。结果表明,转化效率最高时等渗液各成分的含量:陆地棉为1/2MS+10%蔗糖+0.5g/LMES+0.01mg/L6-BA+200μl//L表面活性剂,pH=6菌株浓度OD600=0.5;海岛棉为1/2MS+15%蔗糖+0.5g/LMES+0.01mg/L6-BA+200μl/L表面活性剂,pH=6菌株浓度OD600=0.5;转化效率最高时转化的时间段为11:00—13130,相应的温度为22~29℃、湿度为70%-85%;转化后的哟代受体材料,首先在田间进行抗生素检测,然后在获得的阳性植株中,转抗虫基因材料用金标BT-CryIAb/Ac试纸条定性检测,转纤维品质基因材料做PCR电泳检测,经检测最终获得了一批转基因阳性植株。最终建立一种应用在农业育种科研中大批量、高效快速、简易实用的转基因方法。 聂新辉 尤春源 雷江荣 杨洋 李波 李晓东 吕军 冯国礼 孔杰 张大伟关键词:棉花 转基因 引进陆地棉种质材料纤维品质及农艺性状关联分析 被引量:4 2017年 引进陆地棉(Gossypium hirsutum)种质材料的性状-标记关联分析是发掘其优异基因并在分子标记辅助育种中使用的科学依据。本研究利用199个SSR标记和42个In Del标记对94份国外陆地棉种质材料和27份新疆本地品种的纤维品质和农艺学性状进行全基因组关联分析。遗传结构和Neighbor-Join聚类分析将陆地棉种质群体划分为2个亚群,连锁不平衡分析发现有9.42%的位点组合存在LD(p<0.01,r2≥0.05);基于混合线性模型的关联分析结果显示,能够同时在2个播期检测到的与6个纤维品质性状、4个产量性状和4个农艺性状显著关联的标记位点分别有18个、10个和5个,平均表型变异解释率分别为6.06%(1.17%~13.86%)、4.62%(1.18%~15.28%)和6.75%(1.87%~9.98%)。上述关联位点中共检测到188个等位变异,其中表型效应值大于0.6的优异等位变异有12个。研究结果可进一步用于分子辅助育种,并为基因精细定位提供参考资料。 马君 李波 胡文冉 杨洋关键词:陆地棉 分子标记 棉花纤维中木质素的相对分子量 被引量:4 2017年 分子量是聚合物的重要特性之一,木质素的分子量及其分布是研究苯丙烷类结构的反应、物理化学特性和评价其改性产物质量的内容之一。本研究以陆地棉TM-1成熟纤维为材料,分别利用酶解-温和酸解木质素法和二氧六环法提取棉纤维中木质素,结合凝胶渗透色谱法(gel permeation chromatography,GPC)调查和评价2种方法获得的棉纤维中木质素的相对分子量。结果表明,经二氧六环处理提取的棉花纤维中的木质素(dioxane lignin,DL)的重均分子量为2924g mol^(–1)、数均分子量2403 g mol^(–1),略高于由酶解-温和酸解处理提取的木质素(enzymatic hydrolysis-mild acidolysis lignin,EMAL)的重均分子量(2169 g mol^(–1))和数均分子量(1970 g mol^(–1)),EMAL的多分散系数稍低,说明木质素的均一性比DL高。表明EMAL法提取的木质素更适用于分析棉纤维中木质素的相对分子量。利用EMAL法分析棉纤维中木质素相对分子量表明,不同棉花品种的木质素重均分子量分布范围为938~2169 g mol^(–1),数均分子量分布范围为857~1970 g mol^(–1),多分散性系数在1.09~1.74间,均小于2。重均分子量与纤维马克隆值呈显著负相关,数均分子量与纤维长度呈显著负相关,与纤维马克隆值呈极显著负相关。 胡文冉 范玲 李晓荣 谢丽霞 杨洋 李波 陈方圆关键词:棉花纤维 木质素 凝胶渗透色谱 陆地棉CAD基因家族的进化和表达分析 被引量:5 2016年 【目的】对陆地棉CAD基因家族成员进行进化和表达分析,了解其在棉纤维发育中的作用。【方法】应用生物信息学方法,从棉花基因组中筛选出21个CAD基因,并对CAD的基因结构、染色体分布、基因倍增模式以及系统进化进行分析。利用深度表达数据分析CAD基因在棉纤维发育各时期的表达。对比观察拟南芥cad5突变体和野生型根毛表型。【结果】同源性高的CAD基因复制对之间有相似的基因结构;片段重复和串联重复是CAD基因扩增的主要方式。进化分析可知,CAD基因可分为七个亚组,且功能相近的基因聚类在相同亚组。利用深度测序表达数据分析可知,CAD基因在棉纤维各个发育时期均有表达。对比拟南芥cad5突变体和野生型根毛发现,突变体相比于野生型有更长的根毛。【结论】CAD基因参与了棉纤维的发育的过程,并对棉花纤维发育起到一定的调控作用。 张经博 李波 杨洋 胡文冉 陈方圆 谢丽霞 范玲关键词:棉纤维 系统进化分析 根毛 棉花种间SSR标记遗传图谱的构建 被引量:1 2014年 【目的】利用已有的棉花种间分子遗传连锁图谱信息,在陆地棉和海岛棉之间筛选具有共显性差异的SSR标记,并用这些标记构建新疆棉花海陆杂交BC1群体的遗传图谱。【方法】使用Bio Mercator软件比较分析10张不同群体(亲本不同)构建的遗传图谱,选择至少已在3个不同的群体中被定位,且在不同的图谱中被定位在同一条染色体上的SSR标记作为候选标记。将候选标记在多个陆地棉和海岛棉品种间进行多态性检测后,利用具有共显性差异的标记对陆海杂交BC1群体进行基因型分析,使用Joinmap软件构建遗传连锁图谱。【结果】从5 501对SSR引物中初选了763对,经检验具有多态性的引物403对,多态性比例为53%。选用其中77对引物在5个陆地棉和5个海岛棉之间进行扩增,有21对SSR引物在所有的亲本之间均具有多态性。77对SSR引物对BC1群体[(Gh line 565×Gb新海25号)×Gh line 565]的94株材料基因型进行检测,构建了一张由53个SSR标记,16个连锁群组成,全长为643.4 c M的遗传连锁图谱。【结论】利用77个SSR标记构建了棉花种间遗传图谱。为新疆棉花遗传图谱的绘制提供较准确的锚定标记和有育种潜力的共显性差异标记。 王玉晶 杨洋 胡文冉 曹佳强 张桦 范玲关键词:棉花 SSR 一种确立棉花纤维中木质素含量和纤维品质相关关系的方法 本发明提供了一种确立棉花纤维中木质素含量与纤维品质相关关系的方法。将传统的Klason法进行改良,测定出了棉花纤维中的木质素含量,从而建立了木质素含量与纤维长度、比强度、马克隆值之间的相关关系和回归方程。丰富了纤维品质的... 胡文冉 范玲 师维军 闫洪颖 杨洋 李波 马君 吾买尔江文献传递 外源松柏醛和芥子醛影响棉纤维苯丙烷代谢途径基因表达及生长 被引量:2 2013年 利用棉花胚珠离体培养和半定量RT-PCR及数字化图像处理技术,通过体外饲喂不同浓度苯丙烷代谢途径中间代谢物松柏醛(CA)和芥子醛(SA)来研究在棉花纤维发育过程中苯丙烷代谢关键中间产物对棉花纤维发育的影响。结果表明,在离体培养棉纤维中,不同浓度(100μmol.L-1、200μmol.L-1)外源松柏醛(CA)和芥子醛(SA)不但诱导了以CA和SA为底物的基因产物表达量增加,也诱导了苯丙烷代谢途径上游基因产物的表达量增加,且高浓度(200μmol.L-1)诱导的表达量高于低浓度(100μmol.L-1),芥子醛高于松柏醛;对GhEx-pansin1的表达和纤维生长均有抑制作用,且高浓度(200μmol.L-1)抑制作用更加明显,芥子醛抑制作用大于松柏醛。 李晓东 杨洋 李波 杨家平 范玲关键词:基因表达 棉花LIM蛋白基因家族的进化及表达特征分析 被引量:6 2015年 植物LIM蛋白参与细胞骨架的调节及调控次生细胞壁的发育。本研究在雷蒙德氏棉(D5)、亚洲棉(A2)基因组和陆地棉的A、D亚基因组中分别鉴定出14个LIM基因。陆地棉GhLIM基因在2个亚组间的染色体上的分布及基因的复制模式是一致的。推测其复制发生在其祖先同可可(6个LIM)分开之后,A2、D5基因组分化之前;陆地棉LIM除多倍体化使其数目加倍外,没有基因复制与丢失事件发生。蛋白系统进化分析表明,所有被子植物LIM蛋白可以划分为4个亚组(部分具有小亚组):αLIM1(FLIM1、WLIM1、PLIM1)、βLIM1、γLIM2(WLIM2)、δLIM2(PLIM2-I、PLIM2-II)。陆地棉GhLI M的同源复制基因分别在WLIM2和PLIM2-I、PLIM2-II中聚为独立的分支。通过分析深度测序表达谱,发现陆地棉GhLIM有3种表达类型:组成型表达的GhLIM1、2(FLIM),GhLIM3(WLIM1),GhLIM13(βLIM1)和GhLIM4、8、14(WLIM2);雄蕊中优势表达的GhLIM7、9(PLIM2-I),GhLIM5、6、10、11(PLIM2-II);在雄蕊和纤维中优势表达的GhLIM12(PLIM2-I)。实时荧光定量PCR分析表明,GhLIM基因各成员在不同的纤维发育阶段具有不同的表达特征,GhLIM1、13、14在纤维的快速伸长期(5~15 DPA)上调表达,在15 DPA表达量最高;GhLIM2则在纤维次生壁发育期(18~28 DPA)显著上调表达,在28 DPA表达量最高。而GhLIM12在10~23 DPA持续高表达,在28 DPA则没有表达。上述结果说明GhLIM家族基因在纤维发育的不同阶段发挥着不同的功能。 杨洋 李波 胡文冉 张经博 范玲关键词:棉花 LIM 纤维发育 基因复制 基因表达模式 棉花抗黄萎病分子机制研究进展 被引量:6 2016年 黄萎病(Verticillium wilt)已严重影响棉花的可持续生产,研究并明确棉花对黄萎病的抗病机制对于黄萎病的防控至关重要。本研究从诱导抗病性(induced disease resistance,IDR)、抗病相关基因介导的抗病性(resistance related gene induced disease resistance,RGIR)以及小RNA的抗病机制(micro RNA mediated disease resistance,MDR)这3个方面综述了棉花黄萎病抗性机制的研究进展,概述了激发子、抗病基因和转录因子的分类与特点以及诱导免疫和理想诱导物的特点;并在棉花抗病基因的发掘上重点作了展望,以期对棉花抗病育种提供理论参考。 陈方圆 杨洋 李波 范玲 李晓荣关键词:棉花 黄萎病 抗病机制