范小芳 作品数:12 被引量:16 H指数:2 供职机构: 周口师范学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 河南省基础与前沿技术研究计划项目 河南省科技攻关计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
人SEPT9蛋白同源建模和活性位点分析 2014年 利用生物信息学在线软件预测了人SETP 9蛋白质的二级结构和模体信息,同时对其三级结构进行同源建模和模建结果质量评价,其次预测了该蛋白质的活性位点信息,旨在从蛋白质序列特征和分子结构水平理解其在人类生理病理过程中的作用.结果表明,模建的SEPT 9蛋白结构品质较高,具有7段α-螺旋和2组β-折叠结构,是一个典型的α/β类蛋白,表面呈弱正电势分布;人SEPT 9蛋白具有8个不同模体,可能参与不同生化反应或执行不同的功能.搜寻获得了人SEPT 9蛋白配基结合位点有10个,其中位点1可能是该蛋白的活性位点.这些研究结果对理解人SEPT 9蛋白功能以及配基结合位点定位非常重要,也为针对SEPT 9蛋白的分子对接和药物从头设计提供了理论基础. 王俊生 阮先乐 范小芳 王永立 陈龙关键词:同源模建 活性位点 小麦Ta-UBX1基因克隆、表达及生物信息学分析 2015年 为深入研究小麦U-BOX基因的功能,以周麦22和周麦24为材料,利用RT-PCR技术克隆小麦的Ta-UBX1基因,对其序列结构、基因表达和进化特性进行分析。结果表明,小麦Ta-UBX1基因全长2 059 bp,编码553个氨基酸,在其序列的N端和C端分别具有UBA_like保守域和UBX结构域,属于泛素途径中的典型U-BOX蛋白,并且与其他禾本科植物同源的U-BOX蛋白具有高度的序列相似性;该基因在小麦叶片、小花、幼穗、根、种子中均有表达,但以小花和幼穗中的表达量较高,叶片中表达量较低;在花药发育的四分体期和单核早期表达量最高,单核后期到三核期表达量逐步降低,推测该基因表达可能与小麦花发育,尤其花药发育密切相关。本研究可为探究该基因的功能奠定分子基础。 王俊生 殷贵鸿 刘红占 范小芳 韩玉林 陈龙关键词:小麦 基因克隆 小麦DHAR基因的克隆及生物信息学分析 2014年 以电子克隆和RT-PCR克隆获得了1个小麦脱氢抗坏血酸还原酶(DHAR)基因,并对其编码的蛋白质序列进行了生物信息学分析。结果表明,该基因cDNA序列长1 187bp,编码263个氨基酸,蛋白质分子量为28 908.2Da,PI为6.84;具有GST-N家族和GST-C-DHAR结构域,分别属于硫氧还蛋白超家族和GST-C末端超家族;该蛋白序列无信号肽,是亲水性蛋白,定位于细胞质叶绿体中,二级结构中以无规则卷曲(40.30%)和α螺旋(37.64%)为主,并含有少量的片层结构(17.11%);该蛋白序列与大麦、二穗短柄草、玉米、水稻、拟南芥的同源蛋白序列相似性较高,其中与大麦胞质DHAR(BAJ97007.1)蛋白进化距离最近。 范小芳 王俊生 武安全 殷贵鸿 陈灿关键词:小麦 电子克隆 生物信息学 甘蓝型黄籽油菜高油品系下胚轴再生体系研究 被引量:7 2012年 为获得甘蓝型油菜高含油量双低恢复系,育成高含油量双低油菜杂交种,以2个不同甘蓝型黄籽油菜高油双低品系(GY1、GY2)下胚轴为外植体,采用正交设计,研究了预培养基中2,4-D和6-BA质量浓度、预培养时间、分化培养基中NAA和6-BA质量浓度组合以及AgNO3质量浓度5种不同因素对其下胚轴芽苗再生的影响。结果表明,除AgNO3质量浓度外,其他4种因素对2个油菜品系下胚轴芽苗再生均具有显著或极显著影响。2个油菜品系间和不同处理间的芽苗再生频率差异均达显著水平,且油菜品系与处理间存在明显互作效应。4d苗龄,在MS+6-BA 0.5mg/L+2,4-D 0.5mg/L预培养基上预培养3d后,在添加NAA 0.05mg/L+6-BA 2.0mg/L的分化培养基中芽苗再生频率最高,GY1和GY2的下胚轴芽再生频率分别为45.2%和41.7%。初步建立了甘蓝型油菜高油品系的下胚轴再生体系,为高含油量油菜遗传转化奠定了基础。 王俊生 范小芳 谭光轩 李成伟关键词:甘蓝型油菜 黄籽油菜 高含油量 下胚轴 一种植物诱导育种目标植物变异的育种方法 本发明公开了植物育种技术领域的一种植物诱导育种目标植物变异的育种方法,该植物诱导育种目标植物变异的育种方法的具体步骤如下:S1:对诱导植物种子进行加压处理;S2:栽种种子并进行日常管理;S3:在植株幼苗期进行剪枝,并嫁接... 王俊生 刘红占 孙忠科 胡利宗 范小芳 王晓娟文献传递 一种油菜化杀组合转为萝卜细胞质不育三系组合的方法 本发明公开了一种油菜化杀组合转为萝卜细胞质不育三系组合的方法,把萝卜质不育基因转移到化杀组合的母本,选育出优良的萝卜质雄性不育系和保持系,同时把萝卜质不育恢复基因转入化杀组合的父本中,选育出萝卜质不育油菜恢复系,从而可以... 王俊生 刘红占 范小芳 胡利宗 阮先乐 李超琼 王雪琴 赵锦慧文献传递 甘蓝型油菜萝卜质雄性不育恢复系的选育 被引量:5 2011年 为了获得甘蓝型油菜萝卜细胞质雄性不育(Cytoplasmic male sterility,CMS)高含油量双低品质恢复系,以Ougra-CMS不育胞质杂交种Oug-F1(S(Rfrf))为不育基因和恢复基因供体,高含油量双低亲本D89-44(N(rfrf)为受体,通过杂交、多代回交以及最后自交对恢复基因进行了定向转育。在F1代和每一回交世代中,首先以不育基因特异引物P2和恢复基因特异引物P5在苗期进行辅助选择,对选出的S(Rfrf)基因型单株在最大花蕾长度为1~2mm和临开花期分别喷施7mg/L和5mg/L的化学杂交剂SX-1各一次,诱导其完全生理型雄性不育,并与受体系回交。经过连续4代回交选择后得到S(Rfrf)植株并自交,把恢复基因(Rf)定向导入高含油量轮回亲本中。结果表明,应用化学杂交剂SX-1可诱导S(Rfrf)基因型植株产生完全的雄性不育性,同时,通过优化分子标记辅助选择体系,建立了高效、快速跟踪甘蓝型油菜萝卜细胞质不育恢复基因的方法,提高了杂交效率;获得了与受体亲本农艺性状一致、品质性状接近一致且含有萝卜细胞质不育恢复基因的恢复系S(RfRf),暂命名为D89-44-Rf,从而为甘蓝型油菜超高含油量杂种的选育奠定了基础。 王俊生 范小芳 谭光轩 李成伟关键词:甘蓝型油菜 萝卜细胞质雄性不育 恢复系 分子标记辅助选育 高产优质杂交油菜新品种周油589选育 2014年 周油589细胞质雄性不育三系杂交种是周口师范学院以自育细胞质雄性不育系H5A为母本、D89-44为父本配制的优质高产、多抗性油菜新品种,2009年选育定型。该品种在2010-2012年度河南省油菜区域试验和2012-2013年度生产试验中表现出高产、稳产、优质、多抗以及高含油量等特点,于2014年1月24日通过河南省品种审定委员会审定(审定编号:豫审油2014003)。 王俊生 李成伟 谭光轩 范小芳关键词:优质杂交油菜 选育 细胞质雄性不育系 三系杂交种 番茄RGA4蛋白与马铃薯Rpi-blb1蛋白的同源比较分析 2015年 为获得番茄抗晚疫病广谱性基因信息,采用同源电子克隆法,基于番茄蛋白序列数据库,以马铃薯晚疫病广谱抗性蛋白Rpi-blb1为种子序列,获得番茄疾病抗性蛋白RGA4,并进行基因电子定位和基因结构、模体、二级结构、基因进化及基因电子表达等分析,以证明两者的进化关系。结果表明:番茄RGA4蛋白(XP_004245923.1)序列具有NB-ARC和LRR8两个保守结构域,定位于第8条染色体SL2.40区间,相应基因位于8号染色体序列的57228847-57232935 bp区间,长度为4 089 bp,由2个外显子和1个内含子组成,编码988个氨基酸序列,该蛋白为不稳定分泌球形蛋白;番茄RGA4蛋白和马铃薯Rpi-blb1蛋白在二级结构分布、基因序列组成、基因定位等方面相似性较高,可确定两者为垂直同源关系,但在基因进化和模体组成方面存在差异,可能导致两者功能上的不同。研究结果可为番茄晚疫病广谱抗性基因克隆及其利用提供理论依据。 武安泉 王俊生 阮先乐 范小芳 陈龙关键词:番茄 晚疫病 生物信息学分析 甘蓝型黄子白花油菜恢复系RW16的选育与应用 被引量:2 2012年 以显性白花油菜W62为母本与显性黄子油菜H440杂交、回交,经多代连续定向选择育成了甘蓝型油菜(Brassica napus L.)双低恢复系RW16,具有黄子和白花的特性。该恢复系具有较好的抗性和良好的品质性状,其芥酸含量平均为0.84%,硫甙含量平均为26.71μmol/g,含油量平均为46.78%,符合国家优质标准,属于高含油量油菜品种。该恢复系产量一般配合力良好,配制的杂种F1代子粒暗黄色,植株花色乳白,含油量和产油量杂种优势明显,普遍高于对照秦优7号。 王俊生 范小芳 李成伟 谭光轩关键词:NAPUS 白花 恢复系