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马忠飞

作品数：7 被引量：21H指数：2
供职机构：中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所更多>>
发文基金：云南省应用基础研究基金云南省自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域：医药卫生生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 6篇医药卫生
  • 3篇生物学

主题

  • 4篇病毒
  • 3篇全基因
  • 3篇全基因序列
  • 3篇全基因序列分...
  • 3篇基因序列
  • 3篇基因序列分析
  • 3篇分离株
  • 2篇全基因组
  • 2篇基因
  • 2篇基因组
  • 2篇VP1基因
  • 2篇KM
  • 1篇疫苗
  • 1篇增殖
  • 1篇增殖研究
  • 1篇人二倍体细胞
  • 1篇连续传代
  • 1篇裂解
  • 1篇裂解疫苗
  • 1篇流感

机构

  • 7篇中国医学科学...

作者

  • 7篇马忠飞
  • 5篇马绍辉
  • 4篇刘建生
  • 4篇潘玥
  • 3篇邵聪文
  • 2篇廖国阳
  • 2篇陈俊英
  • 2篇吉玛
  • 2篇朱艳菊
  • 2篇张云昆
  • 2篇邓新强
  • 2篇叶君
  • 2篇李卫东
  • 2篇赵卫中
  • 1篇王东宝
  • 1篇杨耀云
  • 1篇孙强明
  • 1篇杨卉娟
  • 1篇宋绍辉
  • 1篇梁海孝

传媒

  • 3篇中华流行病学...
  • 2篇中国生物制品...
  • 1篇云南大学学报...
  • 1篇病毒学报

年份

  • 1篇2022
  • 1篇2014
  • 2篇2013
  • 2篇2012
  • 1篇2009
共 7 条 记 录，以下是 1-7
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排序方式：
云南省2009年埃可病毒6型分离株KM57—09全基因序列分析被引量：1
2012年
目的对云南埃可病毒6型（Ech06）分离株KM57—09全基因序列进行分析和研究，了解其遗传特性。方法设计针对Ech06引物，提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列。利用Mega5．05、RDP3和SimPlot3．5．1等生物学软件分析全基因序列。结果获得KM57—09全基因组核苷酸序列长度为7419bp，编码含2191个氨基酸残基的多聚蛋白；与其他Ech06参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为79．3％～80．2％和93．3％～94．4％，与原型株D’Amor核苷酸和氨基酸同源性分别为79．3％和93．6％。在基因组各个区段上，Ech06KM57—09分离株的2C和3A区，与HN-2-E25核苷酸同源性最高，分别为86-3％和85．0％，而其5’UTR、VP4、3D和3’UTR区则与CoxB5-Henan-2010核苷酸同源性最高，分别为91．7％、81．2％、89．7％和96．9％。在VP1区上，与中国其他省份分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为80．0％～96．0％和95．8％～99．0％，而与其他国家分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为77．6％～96．0％和95．2％-99．0％。进化分析发现Ech06可分为5个分支，中国分离株分属C和E分支，其中KM57—09属于E分支，且5个分支之间核苷酸的差异为15．6％～23．3％。3D基因序列种系进化分析以及RDP3和SimPlot3．5．1软件分析发现KM57—09序列在非结构区可能存在重组。结论Ech06可分为5个基因型，KM57—09分离株属于E基因型；中国大陆曾存在不同Ech06株传播链的流行。
朱艳菊潘玥陈俊英马忠飞邓新强刘建生马绍辉
关键词：全基因组
TritonX-100裂解流感病毒的研究被引量：7
2009年
在流感病毒高浓度条件下，寻找TritonX-100裂解流感病毒的适宜条件．在不同条件下用TritonX-100裂解WHO推荐用2007～2008年度流感病毒疫苗毒株制备的3个亚型的流感病毒，用电镜观察裂解程度，通过蔗糖密度梯度离心纯化抗原后免疫动物，以检测疫苗的免疫效果．结果表明当流感病毒的血凝效价是1：16382，裂解时间为24h时，TritonX-100在质量分数为1％可以完全地裂解B型，质量分数达到2％才可以完全裂解流感病毒H1N1和H3N2，这说明TritonX-100对A，B亚型毒株的裂解效果不同．由于每年都要更换毒株工人生产新的流感疫苗，因此应该对使用TritonX-100的裂解不同亚型的流感病毒条件进行研究，以保证裂解疫苗的质量．
宋绍辉李卫东廖国阳马娜杨佳梁海孝杨耀云马忠飞
关键词：流感病毒TRITONX-100裂解疫苗
柯萨奇B组1型病毒株MSH-KM9-09的分离鉴定及其VP1基因序列特征分析被引量：1
2012年
目的对2009年昆明市无菌性脑膜炎的病原柯萨奇B组1型病毒(Coxsackievirus B1,CVB1)分离株MSH-KM9-09进行鉴定,并分析其VP1基因的序列特征。方法采用RD细胞和Hep-2细胞对22份疑似无菌性脑膜炎患者脑脊液标本进行病毒分离,采用微量中和试验,经WHO肠道病毒组合血清及单价血清对分离株进行鉴定,RT-PCR法扩增病毒全长VP1基因,进行序列测定,并采用Mega 4.1等软件进行分析。结果所分离的毒株经微量中和试验定型为CVB1亚型,编号为MSH-KM9-09。经RT-PCR扩增获得834 bp的VP1基因,与国内CVB1分离株核苷酸和氨基酸序列的同源性分别在86.1%和97.8%以上,与国外CVB1分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为80.2%～83.2%和94.3%～96.0%;在系统进化树上,MSH-KM9-09株与国内分离株属于同一个分支,而国外分离株分属其他两个不同的分支。结论 MSH-KM9-09分离株为肠道病毒CVB1。
刘建生潘玥吉玛马忠飞叶君马绍辉
关键词：VP1基因
2009年云南省昆明地区柯萨奇病毒B5的遗传特性分析
2013年
目的对2009年中国云南省昆明地区柯萨奇病毒B5(Coxsackievirus group B5,CVB5)的部分VP1基因序列进行分析,以了解CVB5的遗传特性。方法收集2009年中国云南省昆明地区临床诊断为无菌性脑炎患儿的200份粪便标本,设计针对CVB的通用引物,利用半巢式RT-PCR扩增部分VP1基因。PCR产物直接测序后,采用Omiga和Mega 5.05等生物学软件进行核苷酸、氨基酸序列及系统进化分析。结果共分离出7株CVB5,其部分VP1基因之间的核苷酸和氨基酸序列同源性均较高,分别为92.7%～98.5%和93.6%～100.0%;与中国其他不同地区参考株的核苷酸序列同源性为80.1%～99.1%,其中与中国山东株98388-SD-CHN-1998同源性较低;与中国其他不同地区参考株的氨基酸序列同源性为84.4%～100.0%,其中与中国河南株CoxB5-Henan-2010和中国山东株98388-SD-CHN-1998之间同源性最低;与其他不同国家参考株比较,其核苷酸和氨基酸序列同源性分别在77.5%～89.1%和92.1%～96.3%之间;与原型株Faulkner的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为79.6%～80.9%和92.1%～95.4%。基因系统进化分析显示,分离的7株CVB5属于相对独立的1个分枝,中国流行株除98388-SD-CHN-1998外,构成1个分枝。结论 2009年中国云南省昆明地区CVB5流行株属于相同基因型。
邵聪文潘玥邓新强叶君马忠飞孙强明马绍辉
关键词：VP1基因
2009年云南省柯萨奇病毒B5：分离株A210／KM／09全基因序列分析被引量：10
2014年
目的分析柯萨奇病毒B5（CVB5）云南分离株A210／K2~I／09全基因序列及其遗传特性。方法设计针对CVB5引物，提取病毒RNA，RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列，利用Mega4．1、RDP3和SimPlot3．5．1软件分析全基因序列。结果CVB5A210／KM／09全基因组核苷酸序列长度为7372bp，编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白；A210／KM／09全基因组核苷酸及所推导的氨基酸与CVB5／CCl0／10同源性最高，其同源性分别为92．5％和97.3％；而与其他CVB5毒株如17Y、19CSF、20CSF、1954／85／US、2000／CSF／KOR、03001N、CoxB5／Henard2010、CVB5／SD／09和Faulkner核苷酸和氨基酸同源性分别为80．1％～92．5％和95．0％～97.3％；A210／KM／09与其他CVB5毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为75.3％～96.3％和85．3％～100．O％，其中与VP3、3D区段核苷酸的同源性最低。基于CVB5全长VPl基因序：列进行种系进化分析，可将CVB5分为A、B、C和D4个基因型，其中C基因型可再分为C1～C4基因亚型，D基因型可再分为D1～D4基因亚型。中国CVB5流行株主要聚集在C4基因亚型，国外流行株主要聚集在D1、C2亚型。结论A210／KM／09分离株为C4基因型。
刘建生邵聪文赵卫中张云昆吉玛朱艳菊马忠飞马绍辉
关键词：全基因组
甲型肝炎病毒H2快速复制株在人二倍体细胞中的增殖研究被引量：1
2022年
研究甲型肝炎病毒H_(2)快速复制株在人二倍体细胞中的生长特性,并缩短甲肝病毒的培养周期。将甲型肝炎病毒H_(2)株感染人二倍体细胞(KMB_(17)细胞株),采用高病毒感染复数(MOI)将病毒培养时间从26d缩短至10d后收获病毒,并通过连续传代进行适应研究,建立H_(2)株快速复制毒种库,在不同培养时间检测病毒抗原、感染性滴度,绘制病毒生长曲线,进行传代稳定性验证和病毒形态学的观察。甲肝H_(2)株快速复制病毒株在KMB_(17)细胞上培养10d后收获,连续传代从第5代至第9代,抗原含量均在512~2048之间,感染性滴度均在8.33 lgCCID_(50)/mL±0.125lgCCID_(50)/mL,H_(2)株快速繁殖至5代病毒和9代病毒在电镜下观察到多为成熟的实心颗粒。在5批次的重复试验中,病毒培养至10d、16d、22d时,收获的病毒感染性滴度无显著差异(P>0.005)。筛选后的甲型肝炎病毒H_(2)株的快速复制株缩短了甲肝病毒的培养时间,且保持较好的稳定性和重复性,具有重要的应用价值。
王东宝马忠飞刘泽宋盛波卢志敏施红进何陆涛李燕李卫东廖国阳
关键词：甲肝病毒连续传代
2009年云南省柯萨奇病毒B3型分离株A103／KM／09全基因序列分析被引量：1
2013年
目的分析2009年云南省脑炎患儿粪便标本分离的柯萨奇病毒B3型分离株A103／KM／09全基因序列，了解其遗传特性。方法设计针对柯萨奇病毒B3型引物，提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列，利用Geneious和Mega5．05软件进行核苷酸、氨基酸序列比对及其系统进化分析，应用RDP3和SimPlot3．5．1重组软件对序列进行重组分析。结果该分离株全基因组核苷酸序列长度为7389bp。其核苷酸和氨基酸序列与其原型株Nancy的同源性分别为81．0％和95．7％；与其他柯萨奇病毒B3型毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为81．0％～88．0％和95．7％～98．0％；进化分析发现CVB3可分为5个分支（I～V），核苷酸之间的差异为16．2％-24．3％；中国分离株属V分支，又可分为A～D亚分支，核苷酸之间的差异为4．3％～11．4％。并发现A103／KM／09株基因序列在非结构区可能存在重组事件。结论柯萨奇病毒B3型分为5个基因型，云南分离株A103／KM／09属于V—D亚型，而中国分离株已经发生一定进化。
杨卉娟刘建生张云昆马忠飞赵卫中潘玥陈俊英邵聪文马绍辉
关键词：全基因序列
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