刘琳 作品数:15 被引量:135 H指数:7 供职机构: 首都师范大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家教育部博士点基金 北京市自然科学基金 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 交通运输工程 轻工技术与工程 更多>>
不同水稻品种种子固有细菌群落的多样性 被引量:17 2012年 种子固有细菌是植物内生细菌的重要来源,对植物的健康以及接种细菌的定殖能产生重要影响。该文以杂交水稻(Oryza sativa)种子为研究对象,比较研究了不同品种水稻种子中固有细菌群落的多样性。利用799f和1492r这对引物成功地从水稻种子中扩增出固有细菌16SrDNA片段;通过构建16SrDNA文库和扩增核糖体RNA基因酶切分型(ARDRA)的方法,对杂交水稻‘丰优611’(‘丰源A’ב远恢611’)、‘金优611’(‘金23A’ב远恢611’)和‘金23A/09H013’(‘金23A’ב09H013’)3个组合的子代及其各自亲本的种子固有细菌群落结构的多样性进行了研究。构建的7个克隆文库中,每个文库含有200–300个克隆,30–40个操作分类单元(OTU),对ARDRA分型得到的代表序列进行分析,在16SrDNA文库中发现多种细菌类群,包括α变形杆菌(α-Proteobacteria)、β变形杆菌、γ变形杆菌、放线菌(Actinobacteria)、厚壁菌(Firmicutes)和拟菌(Bacteroidetes),优势菌属是泛菌属(Pantoea)和芽孢杆菌属(Bacillus)。不同品种的水稻种子固有细菌群落结构不同,而杂交子代种子中的优势菌与亲本种子中的优势菌在种类和数量上都具有一定的相关性。此外,子代种子中丰度5%以上的细菌也能在各自父本或母本中检测到。 邹媛媛 刘琳 刘洋 赵亮 邓启云 吴俊 庄文 宋未关键词:群落多样性 杂交水稻 亲本 子代 PCR-DGGE技术及其在植物微生态研究中的应用 被引量:12 2009年 植物中微生物种类较为丰富,在植物微生态系统中发挥重要作用。变性梯度凝胶电泳(denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)技术作为研究微生物物种多样性和种群动态变化的分子检测工具之一,广泛应用于植物微生物群落多样性和群落动态变化研究中。概述了DGGE技术的原理,及其在植物微生物生态学中的应用以及在该领域研究中导致DGGE偏差的因素和相应解决方法,对DGGE检测结果的分析提供参考,为进一步研究植物微生物相互作用提供帮助。 刘琳 刘洋 宋未薄荷根内生及根际细菌多样性探究 被引量:7 2010年 采用传统的培养方法和基于分子生物学技术的非培养方法对我国常用中药之一的薄荷植物的根内生及根际细菌进行研究,从而了解其中细菌群落的多样性。对分离得到的细菌菌株进行16S rDNA扩增和系统发育分析,结果表明,利用培养方法与非培养方法分离得到薄荷根内生细菌及根际细菌一些共有的细菌种类,但前者优势种群为g-变形杆菌,后者优势种群为芽孢杆菌,说明土壤细菌,特别是根际细菌是植物内生细菌的重要来源,但植物对其内生细菌具有选择压。首次报道了薄荷根内和根际具有丰富的微生物群落多样性,为进一步探索植物根系微生态环境中微生物群落的形成和生态功能提供了基础信息。在今后探讨植物与微生物相互作用关系时,有必要考虑土壤环境,特别是根际对其的影响的同时,更加重视植物与其相关联的细菌种类的选择作用。 梁越 刘洋 田兆丰 邹媛媛 左山 刘琳 冯雪 张静 张飞云关键词:薄荷 根际细菌 群落多样性 基于16S rDNA的系统发育分析在微生物进化关系中的应用 被引量:19 2008年 系统发育树的构建是现代生命科学研究中的重要技术,是分析未知菌种与其他菌种的亲缘关系,为进一步了解生物的进化关系的重要依据。对系统发育树的构建进行了详细的介绍,并对其在微生物进化研究中的具体应用进行了阐述。 刘琳 刘洋 刘红娟关键词:RDNA 系统发育树 人参细胞器核糖体小亚单位DNA的PCR扩增与序列测定 被引量:6 2008年 采用CTAB法提取了人参(Panax ginseng)根基因组DNA,根据植物叶绿体16S rDNA和线粒体18SrDNA与细菌16S rDNA序列具有高度同源性,用扩增细菌16S rDNA的一对通用引物(8f,1492r)扩增了人参细胞器核糖体小亚单位DNA。对扩增产物进行了克隆与测序,经多序列比对,扩增片段分别与已知植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA具高度同源性,表明该对引物可以用来扩增绝大多数植物细胞器核糖体小亚单位DNA,可以作为鉴定植物叶绿体16S rDNA和线粒体18S rDNA的一种基本实验技术。 邱服斌 刘琳 宋未关键词:人参 RDNA RDNA PCR 植物种子际微生态学研究进展 被引量:9 2008年 种子际(Spermosphere)是植物微生态系统的重要组成部分,在种子萌发的短暂时间内富于微生物群落的形成和功能的瞬时演替特性。萌发种子分泌物的瞬时演替释放对种子际固有和接种微生物的群落多样性、增殖和活性具有调控作用;种子际微生物的趋化性对于微生物的定殖和对病原菌的拮抗能力以及生物防治效果有重要影响;在种子际微生态学研究中,应注意把握种子际分泌物释放的短暂时间框架和测试条件的统一性;将微生物传统培养方法和非培养方法相结合,该领域的深入研究将为根际微生物的起源以及有益微生物接种剂的合理应用提出新的见解和科学依据。 刘琳 刘洋 邱服斌 张晓霞 宋未关键词:微生物群落 杂交水稻种子固有细菌群落多样性探究 被引量:12 2009年 采用传统的分离培养方法和分子生物学技术对我国高产杂交水稻(OryzasativaL.)金优611种子固有细菌进行研究,从而了解其中可培养细菌群落的多样性。对分离得到的91株细菌进行16SrDNA扩增、ARDRA分型和16SrDNA系统发育分析,结果表明,分离得到的91株细菌分属于10个属16个种。其中γ-变形杆菌(Gammaproteobacteria)(53.85%)占据优势地位,其次为α-变形杆菌(Alphaproteobacteria)(20.88%),其它分属放线菌门Actinobacteria(15.39%)及厚壁菌门Firmicutes(9.88%)。其中的泛菌属(Pantoea sp.)和鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas sp.)、假单胞菌属(Pseudomonas sp.)、微杆菌属(Microbacterium sp.)为分离到的优势种群,且在种子这一特殊的生存空间中有4株潜在的新种存在。首次报道了杂交水稻金优611种子具有丰富的微生物群落多样性,为进一步探索植物种子际微生态环境中微生物群落的形成和生态功能提供了基础信息。 刘琳 刘洋 宋未关键词:杂交水稻种子 群落多样性 脱落酸对植物抗逆性影响的研究进展 被引量:44 2008年 脱落酸(ABA)是一种重要的植物激素,受到生物胁迫和非生物胁迫的调控,在植物对胁迫环境抗逆性中发挥重要作用。综述了近些年来国内外有关ABA生理功能抗逆性研究的一些最新进展,重点介绍ABA在植物干旱、高盐、低温、病虫害等逆境胁迫反应中起重要作用,在植物保护和农林业生产中的应用有重要意义。 刘红娟 刘洋 刘琳关键词:脱落酸 抗逆性 胁迫 杂交水稻(Oryza sativa L.)种子固有细菌群落多样性探究 采用传统的分离培养方法和分子生物学技术对我国高产杂交水稻(Oryza sativa L.)金优611种子固有细菌进行了研究,从而了解其中可培养细菌群落的多样性。对分离到的91株细菌进行16S rDNA扩增、ARDRA分型... 刘琳 刘洋 宋未关键词:杂交水稻种子 群落多样性 系统发育 优势种群 文献传递 蛋白质组学在农业生物科学研究中的应用 被引量:5 2008年 蛋白质组学是后基因组时代的新兴研究领域,详细介绍了蛋白质组学的原理和方法在农业生物科学研究中的最新应用进展,提出了蛋白质组学技术目前所面临的问题,并展望了今后的发展前景。 刘洋 刘琳 晏月明 宋未关键词:蛋白质组学