汪舟佳
- 作品数:39 被引量:143H指数:8
- 供职机构:中国人民解放军更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学生物学更多>>
- 基于RNA-Seq的羊种布鲁氏菌新转录本与非编码RNA鉴定被引量:10
- 2015年
- 目的对羊种布鲁氏菌的转录本进行测序,鉴定基因组中新的转录本和非编码RNA。方法提取羊布鲁氏菌的总RNA,去除rRNA后连接接头逆转录成cDNA,PCR扩增后进行测序,以羊布鲁氏菌16M的基因组序列为参照对测序得到的reads进行比对作图,通过生物信息学方法进行新转录本和非编码RNA的鉴定。结果测序数据分析显示,reads在基因组上覆盖度较好。与现有注释基因相比,有773个基因的5′或3′端在基因组的原有位置基础上发生了延伸,并发现了16个新的转录本。根据测序结果,共鉴定出241条候选的非编码RNA(sRNA),进一步的RT-PCR验证结果显示,预测的sRNA在体外条件下有表达。结论布鲁氏菌基因组中存在除了预测以外的新的转录本,布鲁氏菌中存在非编码RNA且在不同条件下有差异表达。
- 郭英飞王玉飞龚春丽杨明娟袁久云庄妤冰柯跃华杜昕颖汪舟佳陈泽良
- 关键词:布鲁氏菌RNA-SEQSRNA
- 布氏杆菌病致病因子及防治研究进展被引量:14
- 2008年
- 布氏杆菌是引起动物布氏杆菌病的病原。这类胞内病原菌表达一系列的因子,包括脂多糖类、毒力调节蛋白和磷酸卵磷酯等来保证其毒力。有些毒力因子是侵袭宿主所必须的,而其他的毒力因子对逃脱宿主的清除是必须的。它们允许布氏杆菌在复制泡内生存和增殖,逃脱宿主免疫系统的检测。了解其毒力可为疫苗研制提供依据,也可促使新的抗生素研制。在动物布病防治中生产兽用疫苗来预防该病,但还没有合适的疫苗防治人布病,可能是人布病复杂的病理生理学不同于动物模型。本文就布氏杆菌毒力因子以及如何操纵在宿主细胞中运输进行综述。
- 钟志军陈泽良黄克和乔凤王玉飞赵瑾汪舟佳徐杰曲勍黄留玉
- 关键词:布氏杆菌病致病因子
- 布鲁氏菌基因标记疫苗株的构建及鉴别PCR方法研究
- 布鲁氏菌病是一种在世界范围内都有广泛流行的危害严重的人畜共患病。世界统计资料表明,每年因布鲁氏菌病造成的经济损失近30亿美元,我国就新疆、青海两地,每年因布鲁氏菌病造成的直接经济损失达一亿元。而且它引起的人类波浪热、慢性...
- 汪舟佳
- 关键词:布鲁氏菌基因标记疫苗
- 布鲁菌外膜蛋白Omp31原核表达及抗原性分析被引量:6
- 2010年
- 克隆羊布鲁菌的外膜蛋白Omp31基因,在大肠埃希菌中表达、纯化,并对Omp31蛋白的抗原性进行分析。以羊布鲁菌的染色体DNA为模板,扩增Omp31基因,双酶切后克隆至pET32a上,在大肠埃希菌ER2566(DE3)中诱导表达,组氨酸结合树脂柱纯化,Western blot鉴定Omp31蛋白的抗原性。将Omp31克隆至载体pET32a,提取的重组质粒经PCR鉴定、双酶切鉴定和测序分析确定目的基因成功插入到了克隆载体中。将重组质粒转化于大肠埃希菌ER2566(DE3)中表达获得HIS融合蛋白,SDS-PAGE分析证明,表达产物为43 ku的融合蛋白。Western blot结果表明,表达的蛋白具有与布鲁菌外膜蛋白相同的抗原性。
- 徐杰王玉飞汪舟佳乔凤钟志军杜昕颖赵瑾曲勍高岚陈泽良
- 关键词:布鲁菌原核表达抗原性
- 布鲁氏菌减毒活疫苗株的比较基因组学研究被引量:4
- 2012年
- 目的探究布鲁氏菌减毒活疫苗株与亲本株的分子遗传差异。方法通过布鲁氏菌全基因组DNA芯片对4株减毒活疫苗株进行比较基因组学研究。结果通过比较基因组学研究,发现疫苗菌株中存在大片段基因缺失,同时发现一些基因以多拷贝形式存在。4株减毒活疫苗株分别缺失不同数目的功能基因,主要为胞内活动有关基因和功能未知基因(分别为31和45个)。较深入地认识了布鲁氏菌减毒活疫苗株基因构成上的差异。结论与亲本株相比,4株减毒活疫苗株缺失大量基因,构成了不同疫苗株差异的遗传基础。
- 钟志军徐杰于爽王玉飞周冬生乔凤曲勍汪舟佳杜昕颖陈燕芬黄克和马晓平陈泽良彭广能
- 关键词:布鲁氏菌减毒活疫苗比较基因组学
- 超级细菌NDM-1基因荧光定量PCR检测的引物、探针及其应用
- 本发明公开了一种超级细菌NDM-1基因的荧光定量PCR检测中的探针和引物及其应用。该引物和TaqMan探针是根据超级细菌NDM-1基因的保守区域设计的,用以定量检测待测样品中超级细菌的核酸拷贝数。具体来讲,所述引物的上游...
- 王玉飞陈泽良黄留玉杜昕颖汪舟佳宋宏彬袁静
- 文献传递
- 保护性抗原Omp25c在布鲁氏菌疫苗制备中的应用
- 本发明公开了布鲁氏菌的一种保护性抗原Omp25c蛋白及其在制备布鲁氏菌疫苗中的应用。实验结果表明,与野生型疫苗株相比,omp25c突变株毒力减弱,说明omp25c基因在疫苗株的毒力中发挥一定的作用。omp25c缺失株诱导...
- 王玉飞陈泽良曲勍钟志军徐杰汪舟佳杜昕颖孙岩松黄留玉
- 文献传递
- 布鲁杆菌Cu-Zn SOD和GroEL的克隆表达及细胞免疫特性比较分析被引量:3
- 2010年
- 目的分析比较布鲁杆菌两种外膜蛋白Cu-Zn SOD和GroEL的细胞免疫特性。方法以布鲁杆菌16M基因组为模板,PCR扩增Cu-Zn SOD和GroEL蛋白的基因序列。采用Gateway方法构建表达载体,在大肠埃希菌中诱导表达并纯化,用获得的纯化蛋白刺激减毒活疫苗S19免疫小鼠的脾细胞,并测定细胞上清中IFN-γ的水平。结果成功克隆表达了Cu-Zn SOD和GroEL蛋白,用这两种蛋白刺激S19免疫小鼠脾细胞后,细胞上清中的IFN-γ水平明显升高,并且GroEL刺激后的IFN-γ水平高于Cu-Zn SOD刺激后的IFN-γ水平。结论 GroEL和Cu-Zn SOD蛋白均具有细胞免疫反应特性,且GroEL的细胞免疫反应特性强于Cu-ZnSOD。
- 于爽徐杰付思美王玉飞白耀霞钟志军陈燕芬王同坤杨毅杜昕颖汪舟佳李竞黄留玉陈泽良
- 关键词:GATEWAY技术
- 用于检测埃博拉病毒的RPA试剂盒、其专用引物和探针及其用途
- 本发明提供了用于检测埃博拉病毒的RPA检测试剂盒、其专用引物、探针及其在埃博拉病毒检测中的用途。所述试剂盒、其专用引物和探针是给予埃博拉病毒NP基因保守序列设计的,所述埃博拉病毒NP基因保守序列具有SEQ?ID?NO.1...
- 陈泽良刘超杨明娟柯跃华汪舟佳黄留玉杜昕颖王雪松
- 文献传递
- 副溶血弧菌实时荧光定量PCR快速检测方法的建立被引量:8
- 2010年
- 目的建立一种快速检测副溶血弧菌的实时荧光定量PCR方法。方法根据副溶血弧菌tdh基因设计合成引物及TaqMan探针,利用阳性质粒和模拟标本建立副溶血弧菌实时荧光定量PCR检测方法。结果以副溶血弧菌DNA为模板克隆了tdh基因,得到阳性质粒。利用阳性质粒建立了定量PCR方法 ,得到标准曲线y=-4.9197x+58.72,决定系数(R2)为0.9864。此方法具有很好的特异性,在对15种肠道致病菌的检测中,只有副溶血弧菌基因组DNA的扩增结果为阳性。对粪便和食物模拟标本进行检测,敏感性均为102cfu/μl。此方法重复性较好,对4种浓度(105、104、103、102cfu/μl)的菌液各进行3次检测,结果均为阳性,且Ct值的变异系数<2%。结论建立了一种检测副溶血弧菌的荧光定量PCR方法 ,该法的敏感性和特异均较好,适用于快速、准确地检测食品和粪便中的沙门菌。
- 孙宏迪杜昕颖汪舟佳王玉飞宋宏彬孙岩松黄留玉杨振洲陈泽良
- 关键词:实时定量聚合酶链反应DNA探针