郭鑫
- 作品数：12 被引量：24H指数：3
- 供职机构：中国热带农业科学院热带生物技术研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 干旱胁迫下木薯AP_2转录因子的荧光定量PCR分析被引量：2
- 2014年
- 为研究木薯的两个AP2基因在干旱胁迫下的表达模式,对木薯品种华南5号进行干旱胁迫处理,提取各个时间点离区部位的RNA,以其反转录的cDNA为模板,应用SYBR GreenⅠ荧光定量PCR检测AP2转录因子基因的差异性表达。结果表明,目的基因的熔解曲线都只出现一个峰,说明引物特异性强,且各基因的扩增效率与参照基因Actin接近,试验结果可用2-ΔΔCT计算法进行分析。经分析,两个AP2家族成员在干旱胁迫下均诱导表达,其表达模式不完全相同且存在一定的相关性,这与之前做过的基因芯片杂交结果相符。
- 李雅韵廖文彬王斌杨义伶郭鑫杨子彭明
- 关键词：干旱胁迫荧光定量PCR
- 逆境信号下木薯MeMYC2转录因子表达及功能分析被引量：3
- 2021年
- MYC2是茉莉酸信号途径中的关键节点基因,在植物生长发育及逆境信号响应过程中发挥重要作用。本研究基于木薯基因组数据库序列,以木薯‘cv.60444’品种为材料,采用RT-PCR方法同源克隆得到MYC2基因(数据库No.Manes.17G016000),命名为MeMYC2.1。MeMYC2.1基因开放阅读框(ORF)全长2055 bp,无内含子,氨基酸序列中包含典型的bHLH保守结构域;序列比对分析发现MeMYC2与蓖麻MYC2具有较高同源性。外源施加植物激素水杨酸(SA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、过氧化氢(H2O2)以及低温胁迫下,木薯叶片中MeMYC2.1的表达被显著诱导。进一步克隆获得MeMYC2.1基因上游1500 bp启动子序列,利用在线数据库PlantCare分析发现,MeMYC2.1启动子序列中不仅含有响应茉莉酸的顺式元件CGTCA/TGACG,还含有低温响应元件LTR及ABA响应元件ABRE。以上研究结果表明,MeMYC2.1可能是植物激素茉莉酸(JA)、脱落酸(ABA)响应低温物胁迫分子网络中的一个节点基因,对其功能的深入研究将有助于探讨JAs在植物低温胁迫应答中的作用机制。
- 于晓玲郭鑫李淑霞阮孟斌彭明
- 关键词：木薯茉莉酸低温胁迫
- 木薯MYB转录因子MeMYB2特性及功能分析被引量：2
- 2021年
- MYB转录因子是植物最大的转录因子家族之一,其部分成员在植物非生物胁迫响应过程中发挥着重要的调控作用。通过转录组数据分析,筛选到了多个木薯干旱胁迫相关的MYB类基因,本研究针对其中的1个MYB转录因子MeMYB2展开研究。MeMYB2蛋白N末端与AtMYB60蛋白的N末端氨基酸序列具有95%以上的相似度,但其C末端氨基酸序列与AtMYB60只有30%左右的相似度。编码该蛋白的基因在木薯成熟叶片中优势表达,并且其表达受干旱胁迫负调控。MeMYB2蛋白主要定位于细胞核中,且在酵母中具有明显的转录自激活活性,其转录激活结构域在蛋白C末端247~267位点之间的20个氨基酸残基内。利用酵母双杂交系统从木薯cDNA文库中筛选到了8个与MeMYB2互作的蛋白,其中的2个蛋白与气孔运动和光合作用有关。MeMYB2-RNAi转基因木薯成熟叶片的失水率显著低于野生型木薯成熟叶片,说明MeMYB2转录因子负调控木薯叶片失水率,推测其可能具有调控气孔运动的功能。
- 杨静园阮孟斌郭鑫彭明
- 关键词：木薯干旱胁迫
- 木薯干旱胁迫响应基因MeGSTU7自然变异分析
- 2015年
- 在2个木薯品种中检测MeGSTU7基因在不同干旱胁迫阶段的表达量变化,并克隆测序了60个木薯品种的基因区DNA序列,分析基因核苷酸多态性及其自然变异,并将核苷酸多态性与干旱胁迫表型关联分析,挖掘优等位变异。结果表明,干旱胁迫条件下,2个品种的MeGSTU7的表达量均上调。MeGSTU7基因区核苷酸变异丰富,共有23个SNP位点,A/G突变为主;外显子区总计10个同义突变,12个非同义突变;外显子区在品种资源群体中有4种主要单倍型,所有的单倍型分为两大类,分子进化分析表明,MeGSTU7的外显子区的两端受到很强的正选择作用;Q+K+MLM混合线性模型关联分析结果表明,1个Indel和2个SNP与干旱胁迫下地上部鲜重耐旱系数显著关联,并筛选得到了优等位变异。
- 邓德力王斌曾长英郭鑫彭明
- 关键词：谷胱甘肽转移酶木薯自然变异单倍型
- 木薯响应低温胁迫转录因子MeMYB2的功能分析
- 木薯（ManihotEsculentaCranz）是大戟科（Euphorbiaceae）木薯属（Manihot）灌木状多年生植物，属于重要的粮饲兼用型作物和能源作物，具有耐旱和耐贫瘠的优良特性。世界木薯主栽区位于南北回归...
- 郭鑫
- 关键词：木薯低温环境花青素合成
- 木薯干旱胁迫响应CC类谷氧还蛋白基因的筛选与体外表达分析被引量：3
- 2017年
- CC类谷氧还蛋白(CC-type glutaredoxins)是高等植物中所特有的一类谷氧还蛋白,模式植物中的研究表明,CC类GRX可以与TGA转录因子互作,在植物器官发育及响应环境胁迫过程中起重要的调控作用。基因差异表达分析结果表明,木薯中有多个CC类GRX基因在叶片中的表达受干旱胁迫的诱导。为了进一步研究木薯中CC类GRX蛋白与TGA的互作,本研究选择了其中的Me GRX058和Me GRX785这两个基因作进一步体外蛋白表达分析。理化性质及二级结构预测分析表明Me GRX058和Me GRX785蛋白分子量均在11 k D左右,具有谷氧还蛋白以及CC类谷氧还蛋白典型的结构域。通过构建酵母表达载体及植物表达载体,利用HA-Tag和GFP分别对Me GRX058和Me GRX785蛋白进行标记,在酵母和转基因木薯中进行表达,随后对融合蛋白的表达进行了Western blot检测。结果表明Me GRX058和Me GRX785成功在酵母和转基因木薯中表达,为进一步筛选它们的互作蛋白、研究其结构与功能做铺垫。
- 王雪阮孟斌王斌郭鑫于晓玲彭明
- 关键词：木薯体外表达WESTERNBLOT
- 木薯MeUGT85K4 基因的克隆和功能分析
- 2021年
- 木薯UDP-糖基转移酶隶属于糖基转移酶大家族,负责催化糖基化反应,参与木薯亚麻苦苷的合成,在干旱胁迫的木薯叶片中大量累积。为了研究木薯UDP-糖基转移酶的功能,本研究从木薯栽培种‘SC124’中克隆了编码其的一个UDP-糖基转移酶基因,将其命名为MeUGT85K4。该基因基因组DNA全长1604 bp,包含2个外显子和1个内含子,CDS区全长为1452 bp,氨基酸序列具有氰醇Beta-葡糖基转移酶保守结构域。经过RT-qPCR(Real-time quantitative PCR detecting system)检测发现MeUGT85K4基因在一年生木薯的根、花、茎和果中高表达,在叶、块根和种子中低表达。MeUGT85K4基因可响应干旱、脱落酸(ABA)、PEG(Polyethylene glycol 6000)处理,且在处理后不同时间的木薯的根和叶中上调表达。通过构建pGBKT7-MeUGT85K4诱饵载体,从木薯干旱和低温混合库中筛选到6个与MeUGT85K4互作的候选蛋白,包括IAA-amino acid hydrolase ILR-like 6(MeIL)、Mitochondrial transcription termination factor(MeMTERF)、Lipid-transfer proteinsfamily(MeLTP)和Copper binding proteins(MeCBP)共4个已知蛋白和2个未知蛋白,其中,MeLTP在干旱胁迫条件下的木薯叶片中下调表达,而MeCBP在干旱胁迫条件下的木薯叶片中上调表达,以上结果表明MeLTP,MeCBP和MeUGT85K4可能共同参与木薯干旱响应。本研究为下一步研究木薯抗旱分子机制提供参考依据,为木薯抗旱遗传改良提供新基因资源。
- 赵平娟郭鑫林晨俞张秀春王海燕彭明
- 关键词：木薯功能分析
- 一个新的木薯AP2转录因子促进叶柄离区分化影响叶片脱落的分子机制
- 廖文彬王海燕杨义伶王斌郭鑫李雅韵
- 该课题来源于国家自然科学基金面上项目，木薯具有优良抗旱特性的重要原因之一是干旱能诱导木薯离区分化形成而脱落一部分叶片以适应新的干旱环境。乙烯信号是调节离区分化的重要途径。我们从木薯离区中克隆到一个AP2转录因子，从细胞、...
- 关键词：
- 关键词：木薯基因表达
- 番茄SlJAZ11的表达分析及互作蛋白的筛选与验证被引量：2
- 2023年
- 茉莉酸(JA)参与调节植物生长、发育和防御等多种重要生物过程,其中JAZ蛋白作为抑制子,在茉莉酸介导的生物和非生物胁迫响应过程中起到重要作用。为研究SlJAZ11的功能,本研究分析了水杨酸(SA)、茉莉酸等激素以及病原菌侵染处理后SlJAZ11的表达模式。结果表明,SlJAZ11能够响应水杨酸、茉莉酸及丁香假单胞菌(Pst DC3000)的诱导。通过酵母双杂交筛选番茄cDNA文库,获得了14个SlJAZ11潜在的互作蛋白。进一步采用酵母双杂交点对点验证和双分子荧光互补技术(BiFC)对候选的SlENT、SlOOLG与SlJAZ11间的互作关系进行验证,发现SlENT和SlJAZ11存在互作。对SlENT的表达模式进行分析,发现其表达被SA和Pst DC3000显著抑制,而MeJA能显著诱导其表达,表明SlJAZ11可能通过与SlENT互作来调控JA介导的番茄抗病性。本研究可为阐明SlJAZ11功能与作用机制奠定良好的分子基础。
- 高苗苗郭鑫郭鑫黄思源李建君庞春娜陈银华陈银华
- 关键词：番茄茉莉酸酵母双杂交
- 木薯FER基因家族的全基因组鉴定和表达分析
- 2024年
- 植物铁蛋白(Ferritin, FER)既能存储铁,又能响应各种非生物胁迫。该研究基于全基因组水平对木薯(Manihot esculenta)的FER基因家族进行分析,结果表明,从木薯中共鉴定到4个FER基因,根据系统发育树将木薯FER基因划分为2支,所有成员均包含Euk_Ferritin的功能结构域并位于叶绿体内。木薯FERs基因位于LG7~LG10染色体上;基因共线性分析表明,共有3对潜在的复制基因对,无串联重复事件;Ka/Ks值表明,MeFER同源基因经过了纯化选择;该家族含有响应激素和胁迫诱导的顺式作用元件;q RT-PCR分析表明,MeFER基因的表达具有组织特异性,MeFER4基因响应多种胁迫,且在干旱胁迫下响应最为显著。该研究为木薯FER基因家族的功能研究奠定了基础。
- 李建君郭鑫林晨俞王文娟高苗苗陈银华于晓惠
- 关键词：木薯生物信息学分析非生物胁迫
