宋明霞 作品数:4 被引量:9 H指数:1 供职机构: 吉林师范大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 吉林省科技发展计划基金 吉林省科技厅发展计划项目 更多>> 相关领域: 生物学 更多>>
哺乳动物抗菌肽的生物信息学预测与分析 被引量:1 2015年 抗菌肽(Antimicrobial peptides,AMPs)是能够抵抗病源微生物的小分子多肽,广泛分布于动植物、细菌、真菌等各种生物中,其在天然免疫中起着重要的作用。利用生物信息学方法,结合两大生物信息学门户网站ExPASy和NCBI,对截至2013年4月27日NCBI上所有的哺乳动物抗菌肽条目的上述性质进行了详细分类,并对其氨基酸长度、平均疏水性、跨膜结构、信号肽、亚细胞定位等特征进行预测及分析。 王艳 丁雪 赵晶 宋明霞 杜丰平 周晓馥关键词:生物信息学 绿色木霉和枯草芽孢杆菌对番茄幼苗促生效应的研究 被引量:7 2021年 为深入研究生防菌对植物促生作用的机理,提高作物产量,探究了绿色木霉和枯草芽孢杆菌对番茄幼苗的促生效应,并进一步探讨了两株菌的协同促生作用.采用灌根法共设置6种处理:绿色木霉处理、枯草芽孢杆菌处理、混合菌液处理、PD液体培养基处理、LB液体培养基处理、PD+LB液体培养基处理.通过盆栽实验,对不同处理下番茄幼苗的多种生理生化指标以及诱导土壤养分矿化的能力进行测量.结果表明,绿色木霉、枯草芽孢杆菌、混合菌液均对番茄幼苗有促生作用,其中混合菌液对番茄幼苗促生作用更加显著.因此,本研究为开发复合微生物菌肥提供了一种新的思路. 宋明霞 张晓婷 樊航 张紫瑶 周晓馥关键词:番茄幼苗 绿色木霉 枯草芽孢杆菌 促生效应 紫花苜蓿的抗菌肽基因Rev4遗传转化 2017年 抗菌肽是机体先天免疫的重要组成成分,是许多生物体抵抗外来致病菌侵袭的第1道屏障。Indolicidin是一个13氨基酸残基肽,从牛的嗜中性粒细胞的胞浆小颗粒分离而来,具有广谱抗菌性,Rev4是其人工设计的反向序列。利用经典叶盘法,以根癌农杆菌A.GV3850介导紫花苜蓿遗传转化,GUS瞬时表达检测转化体系建立成功;压力筛选后叶片基因组DNA的PCR成功检测到抗菌肽基因条带,PCR产物回收测序得到13株转化紫花苜蓿。 武慧 宋明霞 宁思淇 武翠玲 周晓馥关键词:紫花苜蓿 抗菌肽 植物AGO蛋白的结构预测分析 被引量:1 2015年 AGO蛋白家族(Argonaute protein family)是RNA诱导沉默复合物(RISC)的功能核心,参与小RNA介导的基因沉默.AGO蛋白由N末端、PAZ、MID和PIWI四个结构域组成.它和小RNA在植物中共同参与维持基因组的稳定、调控组织发育、DNA修复、对逆境的适应性应答以及在RNA层面对入侵核酸(转基因和植物病毒)的免疫.植物AGO蛋白在胚胎发育,细胞分化和转座子的沉默中具有重要作用.本文运用生物信息学的方法,结合生物信息学两大门户网站,对植物AGO蛋白的分类、平均疏水性、净电荷、不稳定系数等进行预测. 周晓馥 宋明霞 王晶 徐洪伟关键词:生物信息学