刘振浩
- 作品数:2 被引量:11H指数:1
- 供职机构:上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学天文地球更多>>
- 金钱鱼抗缪勒氏管激素基因克隆及其在性腺发育不同时期mRNA表达水平的分析被引量:10
- 2015年
- 为了解抗缪勒氏管激素基因(AMH)在金钱鱼性腺发育中的作用,本研究利用RACE技术克隆了AMH的cDNA序列全长,为2 324 bp(Gen Bank登录号:KP718479),其开放阅读框为1 631 bp,编码543个氨基酸。同源性分析显示金钱鱼AMH与花鲈相似性最高,为71.16%,与斑马鱼相似性仅为29.83%。系统进化树分析表明,该基因与鲈形目紧密聚为一支,与金钱鱼进化地位一致,说明AMH在进化中有一定保守性。氨基酸结构分析表明其1-28为信号肽序列,69-426为AM H-N区域,444-543为TGF-β结构区。实时荧光定量研究表明,金钱鱼成鱼中AMH基因在精巢中表达量显著高于其他组织,在肝和卵巢中也有表达。性腺不同发育时期分析表明,AMH基因在精巢发育Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ期均维持高水平表达,IV期表达水平有所降低,H.E染色结果显示这一时期精巢发育逐渐成熟,推测该基因在精巢发育和精子产生过程中有重要作用。在卵巢中,AMH在Ⅰ、Ⅱ期卵巢发育初期表达量较低,在Ⅲ、Ⅳ期卵母细胞大生长期及卵黄积累期表达量升高,推测其在卵母细胞的发育和功能维持上发挥作用。提示AMH基因在金钱鱼精巢、卵巢发育过程中均发挥重要作用。
- 曾文刚刘振浩李红张俊彬
- 关键词:金钱鱼
- 金钱鱼线粒体基因的SNP检测分析被引量:1
- 2018年
- 通过Hi-seq 2000高通量测序(high throughput sequencing,Hi-seq)获得金钱鱼的转录组数据,利用获得的转录组数据进行金钱鱼线粒体基因单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)的鉴定和分析。根据生物信息学的应用方法,对RNA-seq数据进行分析和筛选,得到金钱鱼线粒体基因组90个位点上的93个SNP。其中,在9个蛋白编码基因(ND1、ND2、COⅡ、ATP6、ND4L、ND4、ND5、ND6、Cytb)上均有SNP位点,而基因COⅠ、COⅢ和ATP8上未有检测到,并且蛋白编码基因上有5个SNP为非同义突变。本研究对SNP的测定和分析将为金钱鱼亲缘地理学和母系遗传进化等研究引入新的见解。
- 王武刘振浩张俊彬
- 关键词:金钱鱼高通量测序线粒体基因组单核苷酸多态性