黄晓锋
- 作品数：1 被引量：2H指数：1
- 供职机构：甘肃农业大学动物医学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 甘肃省猪香港病毒的巢式PCR检测及VP1基因序列的系统发育分析被引量：2
- 2015年
- 猪香港病毒(PHoV)于2008年在我国香港首次发现,属细小病毒新成员。本研究自甘肃省兰州、张掖、天水市养猪场和屠宰场采集血液样品147份,针对PHoV的VP1基因保守区(GenBank No.EU200677)设计2对引物,用巢式PCR(nPCR)检测PHoV。结果,甘肃省生猪PHoV总阳性率为38.10%(56/147)。其中,12周龄以上猪的阳性率(55.56%)显著高于6周龄以下猪(25.00%)(P<0.05);三地区间的阳性率差异不显著(P>0.05)。从56份阳性样本中挑选具地域代表性的12份,对VP1扩增片段测序(GenBank注册号:JQ177084~JQ177095),并和GenBank中的所有VP1序列一起进行系统发育分析。结果表明,12个VP1片段序列之间的相似性为95.2%~99.0%。其中,JQ177093、JQ177085和JQ177089构成一个独立的分支;其余9株和来自GenBank的12株参考序列均处于另一分支。9株中,JQ177095、JQ177087和JQ177091构成一个亚分支,紧邻罗马尼亚野猪株(JF738366);JQ177086、JQ177090和JQ177094构成第二个亚分支,紧邻香港株HK3;JQ177088、JQ177092和JQ177084构成第三个亚分支,紧邻香港株HK5。12株PHoV的VP1基因片段序列与香港株HK1~HK6的总体相似性为96.7%~99.7%,与罗马尼亚野猪株为95.2%~99.0%。本研究结果表明,源于罗马尼亚野猪株和香港株的PHoV均在甘肃省猪群中高水平流行。
- 黄晓锋潘阳阳许芳曾巧英
- 关键词：巢式PCR基因序列系统发育分析
