杨瑜 作品数:29 被引量:67 H指数:5 供职机构: 广州市胸科医院 更多>> 发文基金: 广州市科技计划项目 广东省自然科学基金 广州市医药卫生科技项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 更多>>
结核病传播链分子流行病学研究的病例选择方法初探 2017年 目的对以患者居住地为基础的结核病传播链分子流行病学研究的病例选择方法进行理论性评估。方法在本院建立的广州地区分枝杆菌菌株库中提取9234株结核分枝杆菌相应的患者信息资料,以患者居住地假定其间传播关系的有无,分析每条传播链中患者发病时间间隔及年龄组合情况。结果以县-乡镇-村-组等农村区划、市-区-社区-街道等城市区划为路线,发现387条假定结核病传播链,以2-5病例传播链为主,分别为210、100、35、23条,其它则包括6、7、8、11、12病例传播链,分别为6、7、4、1、1条。从传播链中患者居住地看,农村地区以同村为主,占农村区划传播链的89.39%(59/66),城市地区以同街道为主,占城市区划传播链的89.10%(286/321);传播链中患者发病时间间隔在半年、1年、1年半、2年、2年半、3年内及大于3年的传播条数分另为131、81、59、59、50、6和1;按少年(〈15岁)、青年(15-44岁)、中年(45-64岁)、老年(≥65岁)4个年龄段划分,不同性别跨1年龄段、同性别同年龄段、不同性别跨2年龄段、不同性别同年龄段、同性别跨1年龄段、同性别跨2年龄段、不同性别跨3年龄段的传播链条数分别为94、69、69、67、59、28、1条。结论以患者居住地为基础的传播链分析所获得的结核病传播链分子流行病学研究的病例比较符合现行结核病传播理论,在结核病传播链分子流行病学研究中切实可行。 吴玲 王楠 雷杰 竺澎波 孟繁荣 谢贝 杨瑜 牛群 谭守勇 邝浩斌 刘志辉关键词:结核病 传播链 分子流行病学 治愈的肺结核患者治疗前后血清蛋白双向电泳初步比较分析 被引量:1 2017年 选取2013年于广州市胸科医院治疗的初治肺结核,并经1个常规抗结核治疗疗程(6个月)治愈的42例患者作为研究对象,采用双向凝胶电泳技术(two dimension electrophoresis,2-DE)对研究对象治疗前、后的混合血清全组蛋白进行电泳分离,以PDQuest 8.0软件根据蛋白质点数、等电点(isoelectric point,PI)、相对分子质量(relative molecular mass,Mr)等进行差异蛋白描述性分析.结果显示,研究对象治疗前、后差异蛋白点共有15个,治疗后血清相对应差异蛋白有12个下调,3个上调,Mr为16 200~76 800,PI为5.0~6.8.由此可见,治愈的肺结核患者治疗前后血清中存在特异性的差异蛋白,差异蛋白可能作为结核病的重要诊断标志物或者治疗靶点. 杨瑜 谢贝 吴玲 孟繁荣 王楠 雷杰 张言斌 彭德虎 谭守勇 刘志辉关键词:血清 蛋白质组学 结核性胸腔积液的双向电泳蛋白组学分析 目的:对结核性胸腔积液组进行差异蛋白分析,尝试找出在结核性胸腔积液特征性表达的蛋白点,为建立准确、快速、经济、简便的新型结核性胸膜炎实验诊断.
方法:而探索.方法运用双向凝胶电泳技术对20例结核性胸膜炎、19例... 黄迪希 刘志辉 杨瑜 章志俊 黄盛晶 谭守勇关键词:结核性胸腔积液 双向电泳 蛋白质组学 结核性胸腔积液的双向电泳蛋白质组学 被引量:4 2016年 目的:对结核性胸腔积液进行差异蛋白分析,尝试找出在结核性胸腔积液特征性表达的蛋白点,探索准确、快速、经济、简便的新型结核性胸膜炎实验诊断方法。方法:运用双向凝胶电泳技术对20例结核性胸膜炎、19例恶性胸腔积液和6例漏出液进行蛋白电泳分离,PDQuest8.0软件分析蛋白的等电点、分子量范围、灰度值等,最后进行凝胶图谱比较分析,得到差异蛋白点。结果:结核组与漏出组产生13个差异蛋白点,其中结核性胸腔积液较漏出液上调的蛋白点9个,下调的有4个;结核组与恶性组产生11个差异蛋白点,其中结核性胸腔积液较恶性上调的蛋白点5个,下调的有4个,仅在恶性胸腔积液表达的蛋白点2个。结论:双向电泳技术可获得分辨率和重复率较高的结核性、恶性和漏出性胸腔积液蛋白质凝胶图谱,三者存在差异蛋白点。 黄迪希 刘志辉 杨瑜 章志俊 黄盛晶 谭守勇关键词:双向电泳技术 结核性胸腔积液 蛋白质组学 肺结核患者痰涂片抗酸染色检查结果与咳嗽咳痰时间及胸部X线影像学特征的相关性 被引量:8 2019年 目的 探讨痰涂片抗酸染色检查结果与肺结核患者就诊前咳嗽咳痰时间、胸部X线影像学特征之间的关联性,为深层次理解肺结核的传播影响因素提供科学依据。方法 查阅本院第一门诊部2006至2015年广州市结核病控制项目初诊患者登记本,统计咳嗽咳痰、胸片结果、痰检结果资料,以-、1+、2+、3+、4+痰涂片抗酸染色检查结果将肺结核患者分组,应用χ^2检验比较分析痰涂片显微镜检查结果与诊前咳嗽咳痰时间长短(无、<2周、≥2周)、有无空洞、病变肺野分布(1~6个)等的相关性。结果 共登记5235例肺结核患者,痰涂片抗酸染色显微镜检查4+、3+、2+、1+、-患者分别为304、213、305、973和3440例。经χ^2检验:⑴不同组间咳嗽咳痰时间无、<2周、≥2周的总体构成比不同或不完全相同,χ^2=284.170,P=0.000;Cramer氏V系数(下称“V”)、校正Pearson列联系数r'(下称“r'”)分别为0.16和0.28,涂片检查阳性等级与咳嗽时间长短呈正相关。⑵不同组间有无空洞的总体构成比不同,χ^2=868.661,P=0.000;V、r'分别为0.41和0.53,涂片检查阳性等级与空洞密切相关。⑶不同组间病变肺野分布(1~6个)的总体构成比不同或不完全相同,χ^2=524.543,P=0.000;V、r'分别为0.18和0.37,涂片检查阳性等级与病灶累及肺野多寡呈正相关。结论 肺结核患者痰涂片抗酸染色检查阳性等级与咳嗽时间长短、病变累及肺野多寡和病灶空洞有无均存在一定的关联性,且相关程度由弱到强。 李笑颜 刘玉美 宋涛 刘国标 孟繁荣 吴玲 杨瑜 王楠 雷杰 刘志辉关键词:咳嗽 胸部X线摄影 应用流式细胞术鉴定结核分枝杆菌利福平敏感性的研究 被引量:1 2019年 目的 探究流式细胞术(flow cytometry,FCM)检测结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)利福平(Rifampicin,RFP)药物敏感性的可行性。方法 对结核分枝杆菌临床分离全敏株与耐RFP株菌悬液用12.5μg/ml、25.0μg/ml、50.0μg/ml、100.0μg/ml的RFP液作用3 d、7 d或10 d后,经荧光素双醋酸酯(Fluorescein diacetae,FDA)染色;1.56μg/ml、6.25μg/ml、25.00μg/ml、100.00μg/ml的RFP液作用1 d、3 d、7 d后经碘化丙啶(Propidium iodide,PI)染色,采用FCM检测其平均荧光强度(Meanfluorescence intensity,MFI)值,并计算其敏感指数(实验管MFI/对照管MFI),依据受试者工作曲线(Receiveroperating characteristic curve,ROC)统计各药物浓度及处理时间下FCM FDA鉴定MTB RFP敏感性的诊断性能,选定基于FDA和PI的FCM法鉴别MTB RFP敏感性的最佳条件与区分MTB RFP敏感或耐药的敏感指数界值。分别对95株和78株MTB临床分离株进行基于FDA和PI的FCM药物敏感性测定并与比例法药敏实验进行比较。结果 基于FDA的FCM检测MTB RFP敏感性的最佳条件是12.5μg/ml的RFP处理7 d,敏感指数界值为0.75,检测结果准确度为88.4%,灵敏度为90.2%,特异度为87.0%,与比例法比较差异无统计学意义(χ^2=0.364,P=0.549)。基于PI的FCM检测,MTB RFP敏感性的最佳条件是1.56μg/ml的RFP处理1 d,敏感指数界值为1.12,检测结果准确度为84.6%,灵敏度为85.7%,特异度为83.7%,与比例法比较差异无统计学意义(χ^2=0.083,P=0.774 5)。结论 基于FDA或PI的FCM法均可应用于MTB临床分离株的RFP敏感性检测。 谢贝 孟繁荣 李华 刘志辉 王伟亮 王楠 邓丽 吴玲 雷杰 杨瑜 牛群 张言斌关键词:流式细胞术 结核分枝杆菌 利福平 碘化丙啶 中国氟喹诺酮耐药结核分枝杆菌gyr基因序列特征分析 被引量:4 2020年 目的明晰我国氟喹诺酮类药物耐药结核分枝杆菌株gyrA、gyrB基因突变的分子特征。方法以检索式"quinolones resistance AND Mycobacterium tuberculosis AND(China OR Hong Kong OR Tai Wan OR Macon)"和"结核AND喹诺酮耐药"分别在英文数据库(pubmed、Embase、SciFinder)和中文数据库(万方、中国知网、中国生物医学文献服务系统与维普期刊资源服务平台)中检索有关我国结核分枝杆菌喹诺酮类药物耐药基因突变的研究文献,对符合纳入标准的文献中氟喹诺酮耐药基因gyrA、gyrB进行突变位点和氨基酸变化类型等计数资料的信息提取和分析。结果 32篇外文和23篇中文文献纳入研究,3 641株氟喹诺酮类耐药结核分枝杆菌的gyrA基因得到分析,其中1 958株同时分析了gyrB基因。3 641株耐药菌中,2 830株检测到gyrA基因突变(突变率为77.73%),共47种突变类型,均为氨基酸错义突变,其中单位点、双位点突变的发生率分别为75.83%和1.92%,94、90、91位密码子突变率分别为49.33%(1 796/3 641)、19.14%(697/3 641)、5.80%(211/3 641),出现频率最高的突变类型依次为Asp94Gly、Ala90Val、Asp94Ala、Asp94Asn、Ser91Pro、Asp94Try;1 958株耐药菌中,175株发生gyrB基因突变(突变率为8.94%),其中56株的29个突变类型为gyrB单基因突变,其余119株36种突变类型与gyrA基因突变共同发生,占gyrB序列突变的68%。结论我国结核分枝杆菌氟喹诺酮耐药株gyrA基因突变以94、90、91位密码子单位点突变为主;gyrB基因突变位点较为分散,常与gyrA基因突变伴随发生。 孟繁荣 杨瑜 雷杰 王楠 李华 谢贝 邓丽 牛群 竺澎波 高俊文 刘志辉关键词:结核分枝杆菌 氟喹诺酮耐药 GYRA GYRB 血清中相关细胞因子表达水平变化对肺结核治疗效果的评估 被引量:10 2022年 目的分析血清中相关细胞因子表达水平变化在肺结核治疗效果评估中的检验效能。方法分别收集肺结核患者治疗前和治疗2月时血清,通过流式细胞术测量其中白细胞介素(IL)-1β、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-10、IL-12P70、IL-17、肿瘤坏死因子(TNF)-α、干扰素(IFN)-γ和IFN-α的表达水平。同时影像学监测病灶变化情况,较治疗前,治疗2月时病灶无变化及增大为无效组,病灶吸收为有效组。受试者工作曲线分析血清中各细胞因子治疗2月与治疗前浓度的比值(Ratio值)区分肺结核治疗无效和有效的界值和检验效能。进一步将不同细胞因子串联或并联后,分析其组合后的检验效能。结果(1)无效组和有效组患者的年龄和性别差异无统计学意义。总体而言,肺结核患者治疗两月后血清中IL-6、IFN-γ表达水平较治疗前降低,差异具有统计学意义(P=0.020、0.023),IL-10表达水平较治疗前升高,差异具有统计学意义(P=0.011)。有效组治疗两月后肺结核患者血清中IL-6表达水平较治疗前降低,差异具有统计学意义(P=0.033)。(2)TNF、IL-17、IL-1β、IL-4、IL-6、IFN-γ、IL-12P70、IFN-α和IL-8的Ratio值在判断肺结核治疗无效时的敏感度>80%,但特异度较低;IL-5和IL-10的Ratio值在判断肺结核治疗无效时的特异度>80%,但敏感度较低。(3)IFN-γ、IL-17和IFN-α三种细胞因子串联组合后,在判断肺结核治疗无效时的灵敏度84.00%,特异度70.97%,准确度76.79%;IL-6和IFN-α两种细胞因子串联组合后,在判断肺结核治疗无效时的灵敏度80.00%,特异度67.74%,准确度73.21%。结论对比治疗前,肺结核患者治疗2月后血清中部分细胞因子表达水平的变化有用于抗结核治疗效果监测的潜力。 李华 许婉华 龚兰 谢贝 杨瑜 刘志辉 吴玲 孟繁荣 王楠 王琪 张言斌关键词:肺结核 细胞因子 以居住地域为基础的广州地区结核病传播链分子流行病学初探 被引量:1 2020年 目的探讨MIRU-VNTR基因分型技术用于分析广州地区结核病传播关系的可行性。方法以结核患者居住地所属乡镇村组或社区街道相同为前提,假定居住所属地相同结核患者间存在传播关系,拟定广州地区结核病传播链。培养结核分枝杆菌临床分离株并提取DNA,通过PCR扩增进行29位点MIRU-VNTR基因分型分析,并计算HGDI分辨力指数。以基因型成簇与否评价传播链内结核患者间传播关系的有无。结果拟定了178条广州地区结核病传播链,复苏得到456株结核分枝杆菌临床分离株,提取获得其基因组DNA并扩增了29个VNTR位点,其组合HGDI分辨力指数为0.986。基因成簇性分析显示,有2条传播链内患者结核分枝杆菌临床分离株基因成簇,成簇率为1.10%。基因成簇性的2条传播链患者分别居住于同街道,发病时间间隔在2年以内,分别为9和14个月。结论29位点MIRU-VNTR基因分型技术可用于广州地区结核分枝杆菌基因型分析,能否用于结核病传播关系需要进一步深入研究。 竺澎波 王楠 孟繁荣 杨瑜 雷杰 牛群 谢贝 吴玲 李华 刘志辉 刘文关键词:结核 结核分枝杆菌 传播链 不同耐药型的结核分枝杆菌hspX基因序列与表达的比较 2023年 目的比较不同耐药型的结核分枝杆菌(MTB)热休克蛋白基因hspX序列与表达,初步探讨hspX与MTB的耐药是否存在相关性。方法选取4种一线抗结核药物全部敏感株(S)、同时对异烟肼和利福平耐药(MDR)和一种耐药[单耐利福平(MTB^(R+))、单耐异烟肼(MTB^(H+))、单耐链霉素(MTB^(S+))和单耐乙胺丁醇(MTB^(E+))]的菌株各10株,采用改良的十二烷基苯磺酸钠裂解法和TRIzol法分别提取各组菌株的DNA和RNA,使用特异性引物进行PCR和实时荧光定量PCR确定hspX基因的存在及其表达。对PCR产物进行测序以检查正向和反向的多态性,并用DNAman软件进行与标准株H37Rv序列比对。以敏感菌株(S)组为对照组进行两两对比分析不同耐药型的MTB菌株hspX表达的差异。结果PCR成功获得各组特异性的hspX基因,与H37Rv序列比对具有97%~99%的同一性,无存在明显差异;以相对定量2^(-ΔΔCt)法计算获得S、MDR、MTB^(R+)、MTB^(H+)、MTB^(S+)和MTB^(E+)菌株hspX的表达分别为0.98(0.89,1.23)、1.49(1.10,2.04)、1.41(0.55,2.80)、1.37(0.68,2.71)、0.91(0.59,1.62)和0.70(0.48,1.18)。以敏感菌株(S)组为对照组,不同耐药型菌株组与其比较,hspX表达差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论hspX基因在MTB中是保守的。在自然状态下,hspX基因在MTB的耐药性方面无明显相关性。 杨瑜 王楠 李华 吴玲 王琪 谢贝 刘志辉 孟繁荣关键词:结核分枝杆菌 热休克蛋白