朱婕
- 作品数:41 被引量:155H指数:6
- 供职机构:海南大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 小麦抗病性研究的AFLP分析体系的建立被引量:3
- 2007年
- 利用小麦抗白粉病材料,通过对AFLP反应体系中几个主要条件的优化,建立了适合于小麦抗病性研究的AFLP反应最佳体系.实验结果表明,40μL酶切连接反应体系中,用于酶切的基因组DNA为500 ng,20μL预扩增反应体系中Mg2+终浓度为1.5 mmol/L,引物量为30 ng时,其预扩增结果最好,这为下步选扩实验提供了实验条件;同时对扩增产物的银染检测方法进行了探索,获得了最佳的银染方案,所获图谱条带清晰,无背景干扰,便于分析.
- 赵红梅岳昌明朱婕王振英
- 关键词:小麦银染
- 栽培小麦Brock中与新抗白粉病基因紧密连锁的AFLP分子标记筛选与分析(英文)被引量:1
- 2008年
- 本研究用225对引物对农艺性状优良但对白粉菌敏感的栽培小麦京411、抗白粉病栽培小麦Brock以及京411与Brock配制的近等基因系进行AFLP分子标记筛选,结果发现只有2对引物组合Pst+GAC/Mse+TCT(P1)和Pst+AGC/Mse+ACC(P2)在上述抗感材料中表现出多态性,分别扩增到2个特异片段,将特异片段克隆并测序发现,P1扩增的特异片段长268bp,P2扩增的特异片段长227bp,命名为AFLP标记P1268和P2227。用106个京411×Brock的F2单株进行连锁性分析表明,P1268和P2227与抗白粉病基因的遗传距离分别为3.6和1.9cM,与Brock中的抗白粉病基因呈紧密连锁。该两个AFLP标记对小麦抗白粉病基因的积累和分子标记辅助选择育种有重要意义。
- 王轶朱婕赵红梅雷盯函王振英彭永康解超杰孙其信刘志勇杨作民
- 关键词:AFLP近等基因系白粉病
- 两个油梨品种转录组SSR特征比较分析及其分子标记开发被引量:1
- 2020年
- 本研究通过对‘哈斯’(Hass)与‘福尔特’(Fuerte) 2个油梨品种转录组中SSR位点特征进行比较分析,设计引物并验证其多态性,为油梨开发新的SSR分子标记提供数据基础。利用MISA软件分别从油梨品种‘Hass’和‘Fuerte’的转录组数据中发现SSR序列6 449个和6 312个。统计结果显示,二核苷酸重复类型数量最多,占‘Hass’和‘Fuerte’SSR总数的48.44%和48.32%,AG/CT为出现频率最高的核苷酸重复基元,在‘Hass’中共2 477个(38.41%),在‘Fuerte’中共2 478个(39.26%);各核苷酸重复类型在5次重复中出现的次数最多,‘Hass’品种中为1 539次,占比为23.86%,在‘Fuerte’中为1 543次(24.45%);两个品种最优势的10个微卫星类型相同;‘Hass’品种特有重复基元26种,‘Fuerte’品种特有重复基元32种。用Primer 3.0软件为‘Hass’、‘Fuerte’油梨转录组SSR序列成功设计出13 686、13 398对引物。随机选择25对引物对8份油梨种质资源进行多态性检测,分别得到11和10对多态性引物,多态性比率分别为44%和40%。本研究结果表明,两个油梨品种微卫星分布特征基本一致,油梨转录组可作为开发SSR分子标记的有效来源,得到的大量SSR标记可为油梨的遗传多样性分析、亲缘关系鉴定及分子标记育种提供理论依据。
- 郭俊朱婕谢尚潜张叶叶蓓蕾郑丽燕凌鹏
- 关键词:转录组分子标记
- 空心菜WRKY基因家族成员鉴定与表达分析被引量:4
- 2023年
- 为了更好地了解植物特有的WRKY转录因子在调控空心菜(Ipomoea aquatica)花青素生物合成途径中的作用,利用课题组前期发表的高质量基因组数据,对空心菜WRKY基因家族成员(IaWRKY)进行了全基因组鉴定与表达分析。结果显示,空心菜拥有82个IaWRKY基因。其中,80个IaWRKY基因可以分为3组(Ⅰ组,Ⅱ组和Ⅲ组)。另有2个IaWRKY基因(IaWRKY10和IaWRKY75)没有与拟南芥WRKY基因(AtWRKY75)聚类在一起。此外,Ⅱ组可以进一步分为5个亚组。motif分析显示,同一亚组的IaWRKY蛋白具有相似的motif分布模式。基因结构分析显示,大多数IaWRKY基因拥有3个外显子。染色体定位分析显示,IaⅢWRKY基因不均匀分布在15条染色体和4条Scaffold上。启动子序列分析显示,IaWRKY基因具有多种顺式作用元件。RNA-seq与RT-qPCR结果分析显示,IaWRKY26基因在紫色茎秆空心菜中的转录本丰度是绿色茎秆空心菜中的30倍以上。本研究为探索植物花青素合成机理提供了重要的基因资源。
- 张宇欣刘征张唐权郝园园成善汉汪志伟朱婕马武强包文龙
- 关键词:空心菜WRKY转录因子生物信息学
- 中国辣椒(Capsicum chinense)对象耳豆根结线虫的抗性鉴定及机理研究被引量:2
- 2022年
- 根结线虫(Meloidogyne spp.)是一类高度专化性的杂食性植物病原线虫。目前,世界上已报道的根结线虫种类有98种,我国危害农作物最为严重的根结线虫有6种,包括南方根结线虫(M. incognita)、北方根结线虫(M. hapla)、爪哇根结线虫(M. javanica)、花生根结线虫(M. arenaria)、拟禾谷根结线虫(M. graminicola)和象耳豆根结线虫(M.enteroloblii)。象耳豆根结线虫寄主范围广、致病力强,选育抗病品种是防治该线虫最为经济有效的手段。由于象耳豆根结线虫在辣椒生产中造成的危害越来越大,急需筛选高抗象耳豆根结线虫的辣椒种质,为抗病育种工作提供物质前提。本研究采用苗期接种鉴定法,对27份中国辣椒(Capsicum chinense)接种象耳豆根结线虫,60 d后开展抗病性鉴定工作。从根结指数和卵粒指数可以看出,不同种质材料在抗病性上存在显著差异。L529-10-1-2-1的根结指数和卵粒指数均最大,L550-1-3的根结指数最小,L518×L535的卵粒指数最小,可推测L529-10-1-2-1对象耳豆根结线虫的抗病性最弱,L550-1-3和L518×L535抗病性最强。结合隶属函数值和聚类分析,将27份供试辣椒种质分为抗病、低抗、感病和高感4类。其中抗病种质16份,隶属函数值在1.60以上;低抗种质4份,隶属函数值在1.26~1.51之间;感病种质5份,隶属函数值在0.64~0.93之间;高感种质2份,隶属函数值在0.42以下。选取高抗的L501M-1M和高感的L529-10-1-2-1接种象耳豆根结线虫,并在接种后0、3、6、9、12、15、20、25、30 d观察线虫侵染量和根系木质素含量。发现L501M-1M根系中的根结线虫数量远远少于L529-10-1-2-1,且L501M-1M中根结线虫的发育受到了阻滞。L501M-1M和L529-10-1-2-1在接种前木质素含量均较低,而接种后抗感种质木质素含量均有所上升,且L501M-1M的木质素含量明显高于L529-10-1-2-1,从而推测木质素与中国辣椒的象耳豆根结线虫抗性存在一定关联。该结果将�
- 田潇潇姜秉政曹振木刘子记凌鹏谢尚潜朱婕
- 关键词:象耳豆根结线虫中国辣椒抗病性鉴定
- 小麦抗叶锈病基因Lr9的分子标记及其检测被引量:5
- 2013年
- 1B·1R易位系、高分子量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)、多酚氧化酶(Polyphenol oxidase,PPO)活性、黄色素含量等因素都对小麦加工品质有重要影响,慢锈基因Lr34既抗叶锈,又抗条锈、白粉和秆锈病。为了明确这些基因在黑龙江小麦品种中的分布,并为优质抗病小麦分子标记辅助育种提供材料和方法,本研究利用高分子量谷蛋白亚基Dx5、By8、1B·1R易位系、PPO、PSY基因和Lr34位点的特异性分子标记对黑龙江省不同地区的169份小麦品种进行鉴定。结果表明,Dx5亚基的频率为43.2%,By8亚基的频率为30.8%,1B·1R易位系的频率为4.7%,Ppo-A1b的频率为33.1%,Psy-A1b的频率为33.7%,含Lr34位点的频率为24.9%;不含1B·1R易位系、同时又具有Dx5和By8、Ppo-A1b、Psy-A1b及Lr34位点的品种只有2份,占1.2%。
- 刘子记梁永朱婕李根桥杨作民孙其信刘志勇
- 关键词:小麦叶锈病分子标记
- 辣椒新细胞质雄性不育线粒体基因组的测序及分析被引量:4
- 2022年
- 细胞质雄性不育(cytoplasmic male sterility,CMS)被广泛应用于作物杂交种的生产。CMS通常由线粒体基因组中新的开放阅读框(open reading frame,ORF)所控制。本研究对细胞质雄性不育系种质HNUCA00HG的线粒体基因组进行了测序和分析,得到其基因组大小为564124 bp,比已经发表的不育系138A(504210 bp)和FS4401(507452 bp)分别长59915和56673 bp。共注释出77个已知功能基因,包括39个编码蛋白基因,33个编码tRNA基因和5个编码核糖体RNA基因。比较基因组和系统发育分析表明,这三个不育系的线粒体可能来自同一个祖先,但相互间存在明显差异。与HNUCA00HG线粒体相比,FS4401线粒体缺少两个已知的功能基因rps7和rps14,而138A不育系缺少rps7、rps14、atp4、atp8和mttB。初步预测了五个ORFs(ORF133a,ORF110a,ORF107a,ORF109a和ORF111a)为HNUCA00HG潜在的不育候选基因。因此,进一步解析辣椒细胞质雄性不育和杂交种培育提供了重要资源。
- 李彩朝Gagoshidze Zakaria金威恒张晓宁傅慧珍朱婕成善汉朱国鹏汪志伟
- 关键词:辣椒线粒体基因组
- 辣椒CCR1基因启动子的克隆及瞬时活性表达分析被引量:1
- 2022年
- 肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素生物合成途径中的关键限速酶,本研究从三个不同辣度的辣椒品种‘美国厚肉圆椒’、‘琼海小米椒’、‘海南黄灯笼’基因组中克隆了CCR1基因的启动子,序列长度分别为2075、2102、2082 bp,序列AT含量都占71%,符合真核植物启动子特征。启动子分析软件PlantCARE预测CCR1基因启动子的序列除含有启动子基本核心元件CAAT-box以及TATA-box外,还包括一些激素、光照、生物胁迫及真菌诱导响应等顺式作用元件。瞬时转化烟草可以驱动GUS基因表达,具有启动活性。本研究结果为阐明CCR基因参与辣椒木质素合成的调控机制及启动子转录作用机理研究奠定进一步的理论基础。
- 吴丹张丽平张威孙佩霞朱婕汪志伟邓勤成善汉
- 关键词:启动子
- 小麦抗白粉病基因pm42的EST连锁图谱构建和比较基因组学分析被引量:10
- 2011年
- 目的基因精细遗传连锁图谱的构建是图位克隆的基础,小麦功能基因精细遗传连锁图谱的构建依赖于比较基因组学分析。水稻和短柄草(Brachypodium distachyon)基因组序列是小麦比较基因组学分析和功能基因精细遗传定位的重要工具。本研究利用小麦、短柄草和水稻的基因组共线性关系对小麦抗白粉病基因pm42进行比较基因组学分析,明确了pm42基因所在2BS基因组区域与短柄草第1染色体和水稻第3染色体直系同源基因组区域的对应关系,开发出与抗白粉病基因pm42连锁的EST-SSCP(expressed sequence tag-single strand conformation polymorphism)标记CD452782和BF201235,以及EST-STS(expressed sequence tag-sequence tagged site)标记CJ674042、EB513371和CV771633,构建了pm42基因EST标记遗传连锁图谱,CJ674042、BF201235、CD452782和CV771633位于pm42近端粒侧,距离pm42的遗传距离分别为1.9、12.0、19.7和25.7cM;EB513371位于pm42近着丝粒侧,与pm42的遗传距离为14.6cM。整合原有的作图数据,构建了pm42基因的高密度比较基因组学遗传连锁图谱,pm42被定位于3.3cM的区间,该区间对应于短柄草66kb的基因组区域及水稻69kb的基因组区域。该结果为抗白粉病基因pm42高密度精细遗传连锁图谱构建、分子辅助选择和基因聚合奠定了基础。
- 刘子记朱婕华为杨作民孙其信刘志勇
- 关键词:小麦抗白粉病基因比较基因组学二穗短柄草共线性
- 甜椒抗象耳豆根结线虫种质资源筛选被引量:1
- 2021年
- 象耳豆根结线虫(Meloidogyne enterolobii)对甜椒造成的危害越来越严重,而广泛用于育种的根结线虫抗病基因对象耳豆根结线虫逐渐失去抑制作用,急需挖掘新的抗象耳豆根结线虫种质资源。本试验对31份甜椒种质接种象耳豆根结线虫,60 d后进行抗病性鉴定。利用根结指数、卵粒指数、病情指数、繁殖系数和生殖指数5个病情指标,采用隶属函数值法,对供试种质的象耳豆根结线虫抗性进行综合评价,筛选出抗性较强的甜椒种质06SCa69-S、06SCa52-1、06SCa67M、06SCa66M、06SCa78-2等。
- 苗悦姜秉政曹振木成善汉汪志伟包文龙朱婕
- 关键词:甜椒象耳豆根结线虫抗性鉴定