朱亚夫
- 作品数：3 被引量：5H指数：1
- 供职机构：新疆农业大学农学院农业生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 海岛棉蔗糖合成酶基因克隆及生物信息学和表达模式分析被引量：4
- 2016年
- 蔗糖合成酶(Sucrose Synthase,EC 2.4.1.13,Sus)在植物不同组织及不同发育阶段起不同的作用,是参与植物糖类代谢调控的关键酶之一。本研究,我们利用目前已完全确定的亚洲棉(Gossypium arboretum L.)Sus基因7个成员(Ga Sus1-Ga Sus7,Gene Bank登录号JQ995522-JQ995528)进行同源克隆并通过q RT-PCR方法对不同纤维发育时期Sus表达模式进行了检测。得到的两个组配海岛棉(Gossypium barbadense L.)重组自交系(recombinant inbred line,RIL,F2:6)亲本材料5917(高比强度品种,平均比强度48.2 c N.tex-1)和Pima-7(低比强度品种,平均比强度37.6 c N.tex-1)的Sus g DNA序列。利用生物信息学方法对基因结构特征分析比较发现,5917、Pima-7与亚洲棉Sus编码区(CDS)中分别存在(Sus1与Ga Sus1:9,8;Sus2与Ga Sus2:25,8;Sus3与Ga Sus3:8,9;Sus4与Ga Sus4:40,41;Sus5与Ga Sus5:27,27;Sus6与Ga Sus6:16,16;Sus7与Ga Sus7:7,7)处单核苷酸多态性(SNP)位点。两个海岛棉品种间Sus1,Sus2,Sus3,Sus4 CDS中存在(1,21,4,1)处差异SNP位点,Sus5,Sus6,Sus7 CDS中无差异。海岛棉Sus CDS中核酸序列碱基置换虽改变了相应氨基酸组成,但氨基酸理化性质和蛋白质结构与功能均与亚洲棉相同未发生明显变化。海岛棉纤维发育过程中,Sus在纤维中的表达具有特异性。本研究在设立高、低比强度研究对象并比对8个纤维生育时期的基础上进一步发现Sus3在纤维次生壁加厚初期(20 DPA)开始大量表达到达峰值随后下降。高比强度海岛棉品种5917 Sus1除在纤维发育起始期(0 DPA^5 DPA)大量表达外,在纤维次生壁加厚后期和末期(30 DPA^35 DPA)表达量又重新升高,低比强度海岛棉品种Pima-7 Sus1无此回升现象且表达量远低于前者。研究表明,Sus3在纤维次生壁加厚初期起作用,Sus1作用于纤维次生壁加厚后期和末期,这两个Sus在纤维次生壁加厚期发挥重要的作用,可能与纤维比强度的形成和差异有关。
- 贾春平耿洪伟朱亚夫黄启秀曲延英陈全家
- 关键词：海岛棉蔗糖合成酶同源克隆
- 海岛棉Sus活性变化特征及时空表达模式与纤维比强度的关系被引量：1
- 2016年
- 以海岛棉(Gossypium barbadense L.)品种‘C6015’和‘新海29’(高比强度组)以及‘巴1248’和‘比马1’(低比强度组)为实验材料,利用果糖和UDPG比色法以及qRT-PCR方法,对2个实验组不同纤维发育时期蔗糖合成酶(EC 2.4.1.13,Sus)活性变化特征及其基因家族时空表达模式进行测定,并分析与纤维比强度的关系,探讨海岛棉纤维比强度差异形成的主要生理与分子机理。结果显示:(1)品种‘C6015’和‘新海29’的平均纤维比强度分别为47.5和44.7cN·tex-1,‘巴1248’和‘比马1’分别为31.2和32.6cN·tex-1,两实验组平均纤维比强度差异极显著。(2)纤维发育过程中4个海岛棉品种的Sus活性变化特征均呈单峰曲线,且低比强度组的峰值出现较早,但高比强度组的峰值以及后期活性极显著高于低比强度组。(3)海岛棉纤维发育过程中高表达的Sus基因有Sus1A、Sus1 D、Sus3A、Sus3 D、Sus6A、Sus6 D、Sus8 D,但各基因成员在纤维发育过程中具有表达特异性;其中两实验组的Sus3A基因都是在纤维次生壁加厚初期(花后20d)开始大量表达且达最大值后下降,说明Sus3A基因在纤维次生壁加厚初期起作用;Sus1A、Sus1 D基因在高比强度实验组的纤维次生壁加厚后期和末期(花后30d)相对表达量较高并有明显上升现象,而同期在低比强度实验组中相对表达量很低且无上升现象,说明Sus1A、Sus1 D基因作用于纤维次生壁加厚后期和末期。(4)两实验组的Sus活性水平及其基因家族各成员相对表达量高低与纤维次生壁加厚后期维持高活性时间的长短存在明显差异,表现为高比强度组>低比强度组;且两组Sus活性高低差异与Sus3A、Sus1A、Sus1 D基因的表达差异同步。研究表明,海岛棉Sus3A、Sus1A、Sus1 D基因的表达差异与纤维比强度的形成有关,可能是影响纤维比强度的关键基因。
- 贾春平耿洪伟倪志勇朱亚夫黄启秀曲延英陈全家
- 关键词：海岛棉纤维比强度
- 海岛棉纤维品质性状关联分析被引量：1
- 2017年
- 海岛棉纤维具有长、强、细等优点,利用纤维品质各性状进行关联分析研究,可以为今后分子标记辅助选择育种(molecular marker-assisted selection,MAS)提供理论指导。利用194个SSR(simple sequence repeats)标记,对214份海岛棉材料的基因组进行扫描,分析其群体结构,并利用TASSEL软件的MLM(mix liner model)模型对8个纤维品质性状进行关联分析。结果显示:(1)利用STRUCTURE群体结构软件分析,将214份海岛棉材料划分为4个亚群,主要分布于中国、美国及前苏联,说明其亚群的划分与来源地有一定的相关性。(2)利用MLM模型进行关联分析,结果显示检测到13个标记与8个纤维品质性状相关联,且在第13和17号染色体上标记较集中;其中部分标记同时与2个或多个性状相关,可能是性状相关或"一因多效"的遗传基础。
- 范李萍朱亚夫吴鹏昊王莉萍王欣怡陈全家曲延英
- 关键词：海岛棉纤维品质SSR
