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陈玉梅
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
供职机构:
江苏省人民医院
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发文基金:
国家自然科学基金
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相关领域:
医药卫生
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合作作者
吴丽洁
江苏省人民医院
范燚
江苏省人民医院
李华
江苏省人民医院
李杏
江苏省人民医院
钱玲梅
江苏省人民医院
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2016
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1a,25(OH)2D3对心肌细胞生物钟基因表达的影响
2016年
目的探讨1a,25(OH),D,对心肌细胞生物钟基因Bmal!mRNA、Per2mRNA和Rev—erbamRNA表达的影响。方法分离培养7H龄SD大鼠乳鼠心肌细胞,并用免疫荧光法鉴定。原代心肌细胞培养72h后,设置1a,25(OH):D,5个终浓度梯度即0nmol/L、1nmol/L、10nmol/L、50nmol/L和100nmol/L处理心肌细胞2h,然后提取细胞RNA,实时荧光定量PCR(RT—PCR)检测生物钟基因(BmalI、Per2、Rev—erba)表达量变化,以确定1a,25(OH):D,最佳处理浓度。再将培养72h的原代心肌细胞分为3组,对照组:无血清培养基培养;血清休克组:含体积分数50%马血清的DMEM培养2h;1a,25(OH)2D3处理组:最佳1a,25(OH)2D3浓度培养2h。分别于7个时间点(0h、4h、8h、12h、16h、20h、24h)收集细胞,提取细胞总RNA,再采用RT-PCR分析心肌细胞生物钟基因(Bmall,Per2,Rev—erba)的转录水平。结果1a,25(OH):D,培养浓度为50nmol/L时,BmallmRNA表达水平最高,Per2和Rev—erbamRNA表达水平最低。与对照组相比,1a,25(OH):D,处理组和血清休克组均引起心肌细胞Bmall、Per2和Rev—erba基因呈日周期的节律振荡,且Bmall和Per2的表达模式呈相反的时相表达,在12h时Bmall的表达量出现在波峰,而nr2的表达量出现在波谷。Rev—erba的表达变化趋势在8h开始上升,在12~16h出现最高表达量。结论1a,25(OH)2D3可影响心肌细胞生物钟基因Bmall、nr2和Rev—erbamRNA表达。
陈玉梅
范燚
李杏
李华
吴丽洁
张奇军
程子杰
钱玲梅
关键词:
心肌细胞
生物钟
生物钟基因
长链非编码RNA-uc.167的生物信息学特征及其对小鼠心脏发育的时空表达规律
被引量:2
2016年
目的探索长链非编码RNA(1ncRNA)-uc.167基本生物学特征,及uc.167在小鼠心脏发育过程中的空间分布特征、时间表达规律。方法利用生物信息学软件ENCODE UCSC genomebrowser预测uc.167的基本结构和功能。取不同阶段(孕7.5、11.5、14.5、18.5d)的胚胎小鼠心脏,使用实时荧光定量(RT)-PCR方法检测uc.167及邻近基因在心肌组织中的表达情况,并采用原位杂交技术检测UC.167在心肌组织的分布情况。采用二甲基亚砜方法诱导P19细胞向心肌细胞方向分化,采用RT-PCR方法检测分化过程中(d0、d4、d6、d8、d10)UC.167及邻近基因的表达变化。结果人uc.167全长201bp,定位于基因组5q14.3(chr5:88179623-88179824,GRCh37/hgl9),根据lncRNA分类原则,属Intronic antisense lncRNA;uc.167主要表达于心室肌组织内;uc.167在小鼠胚胎发育过程的表达水平逐渐下调(7.5d:1.000±0.100,11.5d:0.714±0.107,14.5d:0.393±0.043,18.5d:0.125±0.013),而Mef2c的表达水平逐渐上调(7.5d:1.081±0.118,11.5d:2.340±0.351,14.5d:3.958±0.542,18.5d:9.361±0.722),二者呈相反趋势;在P19细胞向心肌细胞分化的过程中,UC.167呈现“先升后降”的表达模式,在胚胎样小体形成(d4)时表达水平达到最高,而后逐渐下调(d0:1.071±0.117,d4:4.714±0.501,d6:3.572±0.414,d8:2.550±0.314,d10:0.786±0.085),临近基因Mefee的表达变化与其呈相反趋势(d0:1.012±0.041,d4:0.353±0.037,d6:2.470±0.329,d8:6.706±0.682,d10:7.765±0.705)。结论UC.167可能在胚胎小鼠心脏发育中具有一定功能;HC.167可能通过负向调控其邻近基因Mef2c来发挥作用。
吴丽洁
宋桂仙
李杏
陈玉梅
范燚
李华
张奇军
钱玲梅
关键词:
生物信息学分析
心脏发育
长链非编码RNA
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