余进德 作品数:10 被引量:10 H指数:2 供职机构: 西南林业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 文化科学 更多>>
7个候选内参基因在樟叶越橘不同组织中的表达及稳定性分析 2023年 【目的】筛选樟叶越橘不同组织部位基因表达分析的最适内参基因。【方法】基于樟叶越橘三代转录组测序数据,筛选出PP2A-1、PP2A-2、EIF-4A-1、EIF-4A-2、60S-1、60S-2和ARP-1共7个候选内参基因;利用qRT-PCR技术对目标基因在樟叶越橘不同组织(嫩叶、成熟叶、花芽、花、绿色果实、红色果实、绿果果梗和红果果梗)的表达水平进行检测,应用geNorm、NormFinder和BestKeeper 3种方法分析评估基因表达的稳定性,通过RefFinder方法综合评价以筛选出樟叶越橘不同组织的最适内参基因;以樟叶越橘绿原酸合成途径中苯丙氨酸解氨酶基因(PAL)的组织表达情况验证内参基因稳定性评价结果的可靠性。【结果】樟叶越橘的不同组织中,60S-2基因表达的稳定性居于首位,其次是PP2A-2基因,ARP-1、60S-1和EIF-4A-2基因表达的稳定性居中,EIF-4A-1基因表达的稳定性最差。应用60S-2内参基因分析获得的樟叶越橘不同组织中PAL基因表达量与绿原酸含量的变化趋势一致,表明PAL基因参与了樟叶越橘体内绿原酸的合成。【结论】供试的7个候选基因中,能在樟叶越橘不同组织最稳定表达的内参基因是60S-2。研究结果为后续其他功能基因在该植物不同组织中的表达研究提供了最适内参基因选择参考。 蒲芝雨 杨玉菊 张安勉 李国泽 余进德 赵平 丁勇关键词:内参基因 实时荧光定量PCR UGPase与USPase编码基因在滇杨正、倒扦插苗中的组织特异性表达 2022年 细胞壁对植物生长发育发挥着重要调控作用,而UDPG是植物细胞壁合成的主要前体物质,主要来源于UGPase和USPase催化葡萄糖-1-P和UTP生成。利用生物信息学软件和在线网站对滇杨PyUGPase-A、PyUGPase-B和PyUSPase基因编码蛋白进行预测和分析,同时以1年生滇杨正、倒扦插苗为材料,测量其主枝长度和主枝粗度,并对3个目标基因在茎尖、嫩叶、成熟叶、茎和根中表达量进行RT-qPCR分析,探究PyUGPase和PyUSPase基因在滇杨正、倒扦插苗中的组织特异性表达规律,从而为揭示PyUGPase和PyUSPase基因调控细胞壁合成进而调控滇杨生长的机制提供依据。结果表明:PyUGPase-A、PyUGPase-B和PyUSPase基因全长和编码的氨基酸分别为1410 bp和469个氨基酸、1410 bp和469个氨基酸、1875 bp和624个氨基酸;3个蛋白均不存在信号肽和跨膜结构域,且均定位于细胞质内的一种亲水稳定性蛋白酶;PyUGPase和PyUSPase基因编码的氨基酸序列和其他植物UGPase和USPase基因编码的氨基酸序列相似性达85%以上。倒扦插苗的主枝长度和粗度均低于正扦插苗,但差异不显著。PyUGPase-A和PyUGPase-B基因在2种类型扦插苗的成熟叶中表达量相对较高,但在倒扦插苗的嫩叶中上调表达;而PyUSPase基因在正、倒扦插苗的根中表达量较高,且在5个组织中均呈现下调表达。 姜辅瑞 纵丹 吴治洋 张晓琳 余进德 何承忠关键词:滇杨 扦插苗 麻疯树油质蛋白JcOle14.3基因克隆及序列分析 被引量:7 2016年 作为最丰富的油体结合蛋白,油质蛋白在油体的发生到分解消失过程中起着重要的生物学功能。本实验应用生物信息学和分子生物学技术分离克隆了麻疯树Jatrophacurcas全长593 bp的油质蛋白JcOle14.3基因序列,无内含子结构。JcOle14.3基因转录的m RNA包含了完整的开放阅读框,推测编码由137个氨基酸残基组成、相对分子质量为14.3 k D的稳定、两性的油质蛋白JcOle14.3。JcOle14.3理论等电点为9.65,正电荷残基(Arg+Lys)总数为10个,负电荷残基(Asp+Glu)总数为6个;不稳定系数为25.90,属于稳定性蛋白;其二级结构的主要构件为α-螺旋、随机卷曲和延伸链。根据高级结构预测结果推测JcOle14.3含有N-末端两亲性结构域、中间疏水性结构域以及C-末端两亲性结构域。C-末端两亲性结构域包含1个α-螺旋结构域,中间疏水性结构域包含由3个α-螺旋构成的跨膜结构域,并具有oleosin蛋白特征性的高度保守的脯氨酸结模体,推测在oleosin蛋白与单层磷脂层和油体锚定结合上起着重要的作用。该研究为后期JcOle14.3的异源表达和功能研究奠定了基础。 宋健 熊宏 余进德 刘小烛 丁勇关键词:麻疯树 油体 基因克隆 麻风树油质蛋白JcOle16.6基因克隆及序列分析 被引量:2 2016年 分离克隆麻风树油质蛋白基因家族成员Jc Ole16.6基因的DNA序列(Gen Bank序列号为JX073622.1)。Jc Ole16.6基因全长601 bp,没有内含子,转录的Jc Ole16.6 mRNA具有468 bp的完整开放阅读框,编码含155个氨基酸残基、分子量为16.6 ku、等电点为9.99的Jc Ole16.6蛋白(Gen Bank序列号为AFP19884),属于植物油体结合蛋白油质蛋白家族的新成员。Jc Ole16.6属于稳定的两性蛋白质,具有3个结构域,即N端约30个氨基酸残基组成的含1个α-螺旋的亲水性结构域,肽链中间约78个氨基酸残基组成的含3个α-螺旋的高度疏水性跨膜结构域,C端约47个氨基酸组成的含1个α-螺旋的两亲性结构域。N端亲水性结构域和C端两亲性结构域分布于油体朝向胞浆一面,中间疏水跨膜结构域分布于油体半单位膜内,存在于中间疏水跨膜结构域中的由3个脯氨酸和1个丝氨酸组成的Pro-Knot高度保守结构域在Jc Ole16.6蛋白与油体半单位膜准确定位和稳定维持油体结构方面起着重要作用。研究结果为Jc Ole16.6基因表达调控和生理功能等研究奠定了基础。 熊宏 陈海涛 宋健 余进德 丁勇关键词:麻风树 种子 油体 基因克隆 一种基因编辑用显微注射针拉针仪 本实用新型公开了一种基因编辑用显微注射针拉针仪,涉及基因工程技术领域,包括箱体,箱体的内腔底部固定连接有放置板,箱体的顶端贯穿有第一螺杆,第一螺杆的顶端固定连接有第一转盘,第一螺杆与箱体之间为转动连接,第一螺杆的外表面螺... 余进德 赵宁 冯小飞滇杨组织培养再生及遗传转化体系建立 被引量:1 2024年 【目的】建立高效的滇杨Populus yunnanensis离体叶片再生及遗传转化体系,有助于滇杨基因工程育种研究。【方法】以滇杨叶片为外植体,研究不同植物生长调节剂组合对叶片愈伤组织和不定芽诱导及生根的影响,从而获得滇杨再生组培苗;进一步以农杆菌Agrobacterium tumefaciens介导法探讨菌液吸光度、侵染时间和共培养时间等对滇杨遗传转化效率的影响。【结果】滇杨愈伤组织诱导的最适培养基为1/2 MS+0.005 mg·L^(−1)噻苯隆(TDZ)+0.010 mg·L^(−1)萘乙酸(NAA),诱导率达91.7%;不定芽诱导的最佳培养基为1/2 MS+0.002 mg·L^(−1) TDZ+0.010 mg·L^(−1) NAA,诱导率为75.0%;生根最适培养基为1/2 MS+0.010 mg·L^(−1) NAA+0.100 mg·L^(−1)吲哚乙酸(IBA),生根率高达96.7%,平均生根数为2.57条。利用pBI121-GUS载体转化滇杨,最适转化菌液吸光度D(600)为0.2,侵染时间为5 min,共培养时间为2 d;在分化过程中,抑制农杆菌生长的头孢霉素(Cef)最佳质量浓度为200 mg·L^(−1),抗性筛选中最佳培养基的卡那霉素(Kan)质量浓度为20 mg·L^(−1)。对再生植株进行β-D-葡萄糖苷酸酶(GUS)组织化学染色和PCR鉴定,获得20株阳性植株,转化阳性率为45.45%。【结论】本研究成功建立了滇杨离体叶片再生和遗传转化体系。 张晓琳 纵丹 李嘉其 杨玲 余进德 何承忠关键词:滇杨 叶片 愈伤组织 一种用于微生物检测的培养器 本实用新型公开了一种用于微生物检测的培养器,涉及微生物培养器械技术领域,包括培养器和用于减缓冲击的弹性环,所述培养器的底部两侧对称活动安装有万向轮,所述培养器的中端前侧固定连接有检测调控器,所述培养器的顶部两侧对称铰接有... 冯小飞 赵宁 陈玉惠 余进德 毛祥忠一种单分子基因测序仪 本实用新型提供了一种单分子基因测序仪,涉及测序仪技术领域,包括:防护箱,防护箱内部轴心处连接有隔板,隔板,隔板将防护箱内部隔离为放置室和保存室,放置室内部设置有测序仪本体,保存组件,保存组件设置于保存室内部,用于对基因样... 余进德 赵宁 冯小飞林科类专业《生物化学》课程教学改革与实践 被引量:2 2017年 为了使生物化学课堂教学更好地适应社会及地方经济对林业人才培养的需要,项目组开展了林科类专业《生物化学》课程教学改革与实践的研究,在生物化学教学内容、教学方法和学法指导等方面进行了一系列改革与尝试,合理的教学内容和新型的教学方法激发了学生的学习兴趣,也使学生逐步养成了发现问题、提出问题、解决问题的学习习惯,为应用型林业科技人才的培养奠定了良好的基础。 李靖 任梅蓉 贾璐 余进德 陈玉惠关键词:生物化学 教学改革 一种微生物培养装置 本实用新型公开了一种微生物培养装置,涉及微生物技术领域,包括底板,底板的顶部固定连接有培养箱,底板的前侧贴合连接有滑板,底板的底部两侧对称固定连接有环形板,底板的下表面中部开设有方形槽,方形槽的顶部贯穿培养箱并贴合连接有... 冯小飞 赵宁 陈玉惠 余进德 毛祥忠