赵盼盼
- 作品数:6 被引量:8H指数:2
- 供职机构:河南师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金河南省高校科技创新团队支持计划博士科研启动基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 提高CRISPR/Cas9系统靶向编辑效率方法的研究进展被引量:2
- 2017年
- 近年来,CRISPR/Cas9系统经过一系列改造后已成为继锌指核酸酶ZFNs和TALENs后的新型高效定点编辑的新技术,目前,该技术已成功应用于人类细胞、斑马鱼、小鼠以及细菌的基因组精确编辑,但是该技术在农作物等植物中的应用还比较受限,且其脱靶效应等问题还有待解决。本文首先简要综述了CRISPR/Cas9系统的发展历程、结构组成和作用机制及其在农作物中的应用,进而综述了近年来探索出的提高CRISPR/Cas9系统靶向编辑效率的方法。最后,对基因组编辑技术在农作物和作物育种上的应用进行了展望。
- 赵盼盼王丽袁园园常卫东王林嵩
- 关键词:农作物
- 棉花类结瘤素MtN21基因家族生物信息学分析被引量:2
- 2016年
- 结瘤素基因主要参与豆科植物根瘤的形成。非结瘤植物中也存在类结瘤素基因,主要调控植物的生长发育。Mt N21(Medicago truncatula NODULIN 21)基因家族属于类结瘤素基因家族,仅少数成员已被鉴定。以拟南芥(Arabidopsis thaliana)Mt N21家族为参考,对棉花(Gossypium hirsutum)Mt N21基因家族进行了生物信息学分析,发现棉花与拟南芥的Mt N21基因同源性较高,有共同的跨膜结构域Eam A和PLN00411;棉花中仅含PLN00411结构域的Mt N21蛋白等电点低于含Eam A结构域的蛋白;亚细胞定位主要在质膜、液泡膜和叶绿体,少数在细胞核;Mt N21蛋白具有膜内侧的磷酸化位点。研究结果表明,棉花Mt N21为跨膜蛋白,具有转运活性,可能在棉花生长发育和病原体免疫方面发挥一定的作用。
- 袁园园王丽赵盼盼王林嵩
- 关键词:生长素保守结构域进化分析
- lncRNA在食管鳞癌中的研究进展被引量:2
- 2017年
- 食管鳞癌(Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)是消化系恶性肿瘤中最致命的类型之一。长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)由于在多种水平参与基因表达调控,影响细胞增殖、分化、代谢和凋亡,其作用备受关注。首先简要介绍lncRNA的结构,并对近年来有关lncRNA在食管鳞癌中的研究进行综述。lncRNA通过表观遗传修饰、剪接调控和共表达网络等调控食管鳞癌相关基因表达,影响食管鳞癌发生发展,并有可能作为食管鳞癌的诊断和预后标志物以及治疗靶点。而lncRNA的二级结构预测有助于推进lncRNA的研究。
- 常卫东王丽赵盼盼王俐峰王林嵩
- 关键词:食管鳞癌长链非编码RNA
- 生长素原初响应基因GhAUX1调控棉花的营养生长
- <正>棉花是我国重要的纤维作物,合理控制其营养生长对棉纤维的产量和品质至关重要,而植物激素则是棉花营养生长调控的关键。生长素在植物的生长发育过程中扮演着重要的角色,且与多种植物激素存在互作,其信号转导组分Aux/IAA蛋...
- 王丽赵盼盼袁园园常卫东王俐锋王林嵩
- 关键词:棉花生长素赤霉素
- 文献传递
- 拟南芥类结瘤素基因At1g01070的生物信息学分析被引量:2
- 2017年
- 类结瘤素基因在非结瘤植物生长发育中承担着重要的功能,但仅少数基因的功能被鉴定.本研究对拟南芥类结瘤素MtN21(Medicago truncatula NODULIN 21)家族成员At1g01070进行了生物信息学分析及亚细胞定位验证.结果表明,At1g01070有两种可变剪切体,编码两种蛋白At1g01070.1和At1g01070.2,前者比后者在N端多47个氨基酸,它们的分子量分别为40KD和35KD,等电点分别为9.2和8.9;均含有2个MtN21蛋白的特征结构域EamA(药物/代谢物转运结构域),At1g01070.1比At1g01070.2多一个PLN00411结构域,且其靠近N端的EamA结构域较后者长;三级结构均由7个α-螺旋和一些不规则卷曲组成,分别含有10个和8个疏水跨膜区,均含13个磷酸化修饰位点,亚细胞定位预测主要定位在质膜;进化上,与琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)亲缘关系最近;亚细胞定位结果显示At1g01070.1定位在质膜,与预测结果一致.推测At1g01070在植物体内可能参与物质运输.
- 王丽袁园园赵盼盼常卫东王俐锋王林嵩
- 关键词:生物信息学分析亚细胞定位
- Aux/IAA家族基因GhAux1沉默促进棉花幼苗的生长被引量:1
- 2019年
- 为明确Aux/IAA家族基因GhAux1在棉花幼苗生长发育中的功能,利用病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术构建了重组表达载体pTRV-GhAux1,转化农杆菌并注射到棉花幼苗子叶,采用qRT-PCR检测GhAux1沉默效率,并对GhAux1沉默植株的表型、内源生长素(IAA)含量和赤霉素(GA4)含量以及GA合成关键酶基因的表达进行了分析。结果表明,成功建立了VIGS体系,注射含pTRV-GhAux1的菌液后15d,GhAux1在沉默植株中的表达量仅为空载体对照的26%;注射含pTRV-GhAux1的菌液后24、27、30d,GhAux1沉默植株的株高较空载体对照分别显著增加了18%、27%、20%,其中注射后27d达到极显著水平;注射含pTRV-GhAux1的菌液后21、24、27d,GhAux1沉默植株的节间内源GA4含量比空载体对照分别增加了33%、20%、33%,且GA合成关键酶基因GhGA20ox1、GhGA20ox2和GhGA3ox1的表达量均显著或极显著增加,而IAA含量仅在注射后27d显著增加。表明GhAux1参与IAA与GA的互作,可调控GA合成途径下游基因的表达,抑制棉花幼苗的生长。
- 王丽王俐锋赵盼盼李用芳王太霞李景原
- 关键词:棉花AUX/IAA赤霉素