冯芬
- 作品数：3 被引量：0H指数：0
- 供职机构：内蒙古科技大学数理与生物工程学院更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术天文地球更多>>
- 秀丽线虫基因组中的回文序列分布
- 2017年
- 回文序列在基因组既可以作为基因表达调控的模体,也能引起基因组的不稳定而导致疾病.本文通过全基因组范围的回文识别,揭示回文在线虫基因组上的总体分布模式,并结合回文丰度和分布特征,探讨回文的生物学功能.结果发现:(1)基因组不同功能区域(如编码区、内含子、基因间区)中,回文在内含子中分布最多,基因间区次之,在编码区分布最少;(2)回文的相对丰度随着回文长度的增加而增加,这反映了基因组对不同长度回文的使用选择性;(3)总体而言回文GC含量随着回文长度的增加而降低,而且在不同的基因组区域(编码区、内含子和基因间区)中回文的GC含量有很大差异;(4)搜索转录因子结合位点模体与回文模体,发现转录因子结合位点富含模体与回文模体,且转录因子结合位点模体中有很明显的回文模体,表明回文可能作为转录因子结合模体而调控转录.
- 冯芬刘国庆
- 关键词：回文序列GC含量转录因子结合位点
- The Heterogeneous Distribution of Palindromes in the C.elegans Genome
- Background: Palindromic sequences are important DNA motifs that are related to the gene regulation, DNA replic...
- 冯芬刘国庆
- 关键词：PALINDROMERELATIVEABUNDANCE
- Nucleosome organization around pseudogenes in the human genome
- Background: Pse.udogene, disabled copy of functional gene, plays a subtle role in gene expression and genome e...
- 刘国庆冯芬赵秀娟崔向军蔡禄
- 关键词：PSEUDOGENENUCLEOSOMEOCCUPANCY
