杨洋
- 作品数:12 被引量:25H指数:3
- 供职机构:上海交通大学医学院附属仁济医院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家科技重大专项上海市科学技术委员会重点实验室专项资金项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学建筑科学自动化与计算机技术更多>>
- 基于人工染色体的DNA信息存储前沿进展被引量:1
- 2021年
- 作为信息存储的替代材料,DNA体现着高信息存储密度和长期稳定等特性。来自天津大学的元英进教授团队最近在酵母菌内完成了从头设计并合成一条人工染色体用于编码两张图片和一段视频数据的研究。这项成果建立了体内组装编码的人工染色体的数据存储策略,可以实现一次写入、稳定复制和多次读取,从而体现出低成本海量数据分发的巨大优势。
- 杨洋樊春海
- 关键词:人工染色体合成生物学
- 队列研究中多因素调整人群归因危险度的估计及其应用被引量:11
- 2013年
- [目的]介绍多因素调整人群归因危险度(PARP)估计方法及其在队列研究中的应用。[方法]利用2002~2006年建立的上海市男性健康队列(SMHS),在拟合多因素Cox风险比例模型基础上,以男性肺癌为例估计其常见危险因素的PARP。文中分别介绍了PAR在未调整和调整混杂因素情况下的估计方法,以及95%可信区间的计算。数据分析通过SAS程序来实现。[结果]上海市男性健康队列共61500名对象,截止2010年12月31日,共发生肺癌507例。调整其他因素对肺癌影响后,吸烟、酗酒、慢性支气管炎史、肺癌家族史对肺癌的多因素调整人群归因危险度及其95%可信区间分别为64.31%(54.95%~72.13%)、8.46%(3.82%~12.97%)、6.43%(1.13%~11.56%)、3.43%(1.15%~5.62%),其他生活方式因素中水果摄入不足、身体消瘦分别可解释18.33%(0.93%~34.60%)和3.16%(0.42%~5.84%)的上海市区男性肺癌的发生。[结论]上海市区男性肺癌的发生很大程度上归因于吸烟、酗酒、身体消瘦、水果摄入不足等不良生活方式因素。多因素调整人群归因危险度是一个重要的流行病学指标,尤其对指导病因复杂的慢性疾病预防和控制的公共卫生实践非常重要,值得推广应用。
- 谢丽张焕玲唐认桥杨洋郑苇舒晓鸥项永兵
- 关键词:人群归因危险度肺癌队列研究
- 可特异性清除靶分子的框架核酸纳米捕获器
- 本发明公开了一种可特异性清除靶分子的框架核酸纳米捕获器。本发明利用DNA纳米桶、正二十面体或截顶正二十面体(足球状)等DNA折纸结构,修饰与靶分子特异性结合的清除元件,从而得到可特异性清除靶分子的框架核酸纳米捕获器,该核...
- 杨洋陈晓刘敦方鲍宏亮
- 一类DNA纳米框架及其功能化修饰方法和在靶向细胞递送与细胞改造中的应用
- 本发明公开了一种DNA纳米框架及其功能化修饰方法和在靶向细胞递送与细胞改造中的应用。本发明的DNA纳米框架为具有内外拓扑特性的自封闭空间三维立体结构,结构外表面可进行多种修饰(例如核酸适配体、病毒表面蛋白、多肽、胆固醇等...
- 杨洋施茜黄奎鲍宏亮鲍敏
- 光镊与DNA纳米技术在膜生物学研究中的应用
- 2023年
- 生物膜是生命活动中信号传导和物质运输的平台。近年来,多学科的交叉应用为膜蛋白介导的膜融合与分裂、囊泡形成与分泌,以及脂质代谢的调控机制等膜生物学研究带来了新的信息。例如,单分子光镊力谱方法通过精准、定量地检测蛋白与膜的相互作用,为在时空维度上理解这一生物过程的复杂调控机制提供了强有力的手段。此外,DNA纳米技术通过构建纳米尺度可编程的自组装结构,提供了可精确修饰与功能化的分子器件。经过疏水修饰的核酸纳米器件可以作用于磷脂膜或生物膜,进而对膜进行表面改性、诱导形变、控制理化参数以及跨膜通信等调控操作。该领域的进步将为细胞生物学机制研究、分泌囊泡的分析检测、人工脂质体的制备优化、新型分子载具开发以及新型药物开发提供特色的工具手段,并构建新颖的体系平台助力合成生物学、化学生物学以及分子医学的发展。
- 林小娜石丽君叶杨王云云马璐杨洋边鑫
- 关键词:光镊生物膜脂质体膜蛋白
- 一种仿病毒DNA多面体框架结构及其制备方法与应用
- 本发明记载了一种仿病毒DNA多面体框架结构,其为正二十面体框架结构,每条边由4条DNA双螺旋组成,且其具有外层结构和内层结构,其中,外层结构的顶点处各边之间由5个T的单链DNA桥接,内层结构的顶点处各边之间由1个T桥接。...
- 杨洋徐芸芸施茜
- Meta分析中剂量反应关系的分析方法及其应用被引量:6
- 2015年
- 目的 介绍Meta分析中的剂量反应关系分析方法的应用.方法 首先介绍了Meta分析中的剂量反应关系分析方法,再通过利用咖啡与前列腺癌发病风险关系的研究文献为例,具体说明剂量反应关系分析方法.结果 利用实例说明广义最小二乘估计法和限制三次样条法在Meta分析剂量反应关系中的应用,数据分析由Stata软件中的“GLST”、“MKSPLINE”等命令来完成.共检索到12项关于饮咖啡与前列腺癌发病风险的队列研究文献,包括39 943名病例数和577 458名对象;12项病例对照研究文献,包含7 909名病例和9 461名对照.分析结果表明,每天多饮一杯咖啡,罹患前列腺癌风险降低为原来的0.992 (95% CI:0.986~0.999),有临界统计学意义.结论 当暴露为连续变量时,Meta分析中提供剂量反应关系的结果能够更好地呈现暴露因素不同剂量水平与结局之间的关系,使结果更丰富,值得在肿瘤或慢性病流行病学研究中推广应用.
- 马骁杨洋王莹莹赵龙刚孙江伟谭玉婷项永兵
- 关键词:META分析剂量反应关系咖啡前列腺癌
- 基于核酸纳米框架空间三维芯片的自定义长单链DNA的制备方法与信息存储的应用
- 本发明公开了一种基于核酸纳米框架空间三维芯片的自定义长单链DNA的制备方法与信息存储的应用。本发明以一种DNA框架纳米结构作为三维空间芯片,利用芯片内精确的空间位点定义彼此连接的序列顺序,通过设计桥接链将2‑30条任意序...
- 杨洋王圣文陈晓黄奎鲍宏亮杨栋磊王鹏飞
- 中国胆囊癌外科治疗现状与病理学特征多中心回顾性研究(附4345例报告)被引量:4
- 2021年
- 目的探讨中国胆囊癌病人的外科治疗模式、病理学特征和预后。方法收集中国13个省市的26家医院自2010年1月至2017年12月收治的4345例胆囊癌病人临床资料,分析中国胆囊癌病人的地区、性别、年龄分布;基于病人的诊疗记录与检查结果对手术病人肿瘤的可切除性进行评估,分析可切除性肿瘤病人的外科治疗模式,参照术前检查、手术记录和术后病理学检查结果评估可切除性肿瘤手术治疗是否达到根治标准,分析行根治性手术胆囊癌病人的病理学特征。结果4345例胆囊癌病人中,男性1664例(38.23%),女性2681例(61.77%)。行外科手术治疗的病人3129例(71.01%),其中可切除性肿瘤2074例(66.28%)。在可切除性肿瘤2074例病人中,仅1133例(54.63%)在术前即诊断为胆囊恶性肿瘤,1002例(48.31%)行根治性切除,1072例(51.69%)未达根治标准。胆囊癌根治性切除病人的病理学检查结果中,736例(73.45%)为腺癌,348例(34.73%)为低分化癌,376例(37.52%)伴肝侵犯,152例(15.17%)伴神经浸润,96例(9.58%)伴血管内癌栓,78例(7.78%)伴周围脂肪组织浸润,89例(8.88%)伴周围器官受累,328例(32.73%)活体组织病理学检查淋巴结阳性。获得生存随访资料的2357例手术治疗病人术后中位生存期为16.17个月,多因素Cox回归生存分析结果显示肿瘤TNM分期(P<0.001)、肿瘤分化程度(P<0.001)、肝脏侵犯(P<0.001)、R0切除(P=0.003)均为术后生存期的独立预后因素。结论中国胆囊癌术前诊断率有待提高;胆囊癌外科治疗模式亟待规范;病理学检查报告中反映的多个因素与胆囊癌病人预后密切相关,其描述的规范化对指导胆囊癌病人的精准治疗有重要意义。
- 孙旭恒任泰耿亚军杨佳华李永盛刘法涛李茂岚李茂岚吴向嵩刘赟王许安陈炜陈炜李可为陈涛何敏王辉杨林华姜皓王贵阳王贵阳蒋程恺边睿宋晓玲李洋宋晓玲李霖刘立果杨洋王泽宇杨洋杨洋刘珂李国强苗慧洁严思远崔旭雅杨波张凌宵颜伟康杨波童山石李一鸣刘照南龚伟董平王雪峰顾钧龚伟董平王雪峰顾钧邵子雨袁瑞研包润发张飞顾剑峰朱春富钱叶本马强顾剑峰朱春富孙备崔云甫李兵刘昌军孙备崔云甫李兵曹宏王昆华郑林辉蔡鸿宇
- 关键词:胆囊恶性肿瘤外科治疗病理特征预后
- DNA纳米技术与合成生物学被引量:3
- 2022年
- 合成生物学突破了经典生物学“格物致知”的研究范式,开启了“建物致知”“建物致用”的研究时代。合成生物学是以系统生物学为基础,结合工程学设计,运用现代生物学技术方法,通过构建新的生物体系以揭示生命规律和开发颠覆性技术的交叉学科。以DNA为主要建筑材料进行纳米尺度结构自组装的DNA纳米技术,具有高度可设计性、精确可寻址性、生物亲和性、模块化组装等独特优势,已经成为合成生物学重要的支持技术。本文介绍了利用DNA纳米结构实现核酸、蛋白质、磷脂等生物大分子的有序装配;构建仿生细胞元件(例如核孔、人工膜通道、网格蛋白),生物过程(例如膜融合、脂质转移、成管过程)和生化体系(例如RNA挤出纳米工厂、体外病毒衣壳蛋白合成和凝血系统);及其在药物递送、肿瘤治疗等领域的应用。此外,未来的研究有望通过DNA纳米结构来更好地合成、模拟和调节天然生物体系。例如,如何一定程度恢复和利用DNA纳米结构携载遗传信息的能力;如何提高结构设计复杂性的同时,兼顾人工体系的简单性和生产的高效性;如何扩大生产规模,降低成本;如何在细胞中生产结构并组装。同时,临床应用层面仍有许多亟待解决的问题,比如增加药物的搭载效率,增强结构的靶向性,维持机体中结构稳定性,以及通过修饰进行免疫治疗。DNA纳米技术在合成生物学具有广泛的应用前景,将有助于认识生命本质、模拟生命过程、建立人工体系、开发改变未来的技术。
- 施茜吴园园杨洋
- 关键词:合成生物学