位正鹏
- 作品数:3 被引量:38H指数:2
- 供职机构:中国海洋大学水产学院海水养殖教育部重点实验室更多>>
- 发文基金:山东省科技计划项目教育部重点实验室开放基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 基于COI序列的翡翠股贻贝Perna viridis线粒体遗传特性分析及其近缘种间的系统关系探讨被引量:8
- 2009年
- 应用通用引物COIL 1490和COIH 2198对翡翠股贻贝Perna viridis的性腺和体细胞线粒体DNA进行PCR扩增,获得661bp长度的COI基因片段,经过比对性腺与体细胞的COI片段,发现雄性性腺与体细胞COI基因均为一个单倍型,即体内只有一种线粒体DNA类型,没有发现双单性遗传现象,雌、雄性腺的COI基因片段变异率很低(0.31%)。应用PAUP构建NJ树、MP树以及贝叶斯法构建了贝叶斯树,对股贻贝属3种间的系统关系进行了分析,结果表明,翡翠股贻贝P.viridis、P.canaliculus和P.perna之间的分化与分歧年代的估算是相吻合的。
- 位正鹏孔晓瑜吴相云喻子牛
- 关键词:VIRIDIS
- 6种舌鳎亚科鱼类ITS1序列长度多态性及系统分析被引量:29
- 2008年
- 利用核糖体第一内转录间隔区(ITS1)对舌鳎亚科(Cynoglossinae)6种鱼类进行系统分析,发现舌鳎亚科ITS1区具有明显的序列长度多态性(404—744bp),序列长度分为三种类型,分别为404—405bp、462—463bp以及741—744bp,同一长度类型的不同种类间序列高度相似,平均遗传距离分别为0.00248、0.00217和0.00169,而不同类型间序列差异显著,平均遗传距离最小为0.38453。分析表明,序列长度多态性可能与物种分化时间有关。采用NJ(neighbour-joining)法及MP(maximum parsimony)法构建分子系统树,结合形态学特征及GenBank中的线粒体DNA序列进行分析,表明紫斑舌鳎(Cynoglossus purpureomaculatus)与短吻三线舌鳎(C.abbreviatus)可能为同物异名。另外,舌鳎属(Cynoglossus)的中华舌鳎(C.sinicus)与须鳎属(Paraplagusia)的日本须鳎(Paraplagusia japonica)聚为一支,舌鳎属中三线舌鳎亚属(Areliscus)的长吻红舌鳎(C.lighti)与拟舌鳎亚属(Cynoglossoides)的少鳞舌鳎(C.oligolepis)聚为一支,与形态分类学的观点不一致,值得进一步研究。
- 徐晖李军孔晓瑜肖志忠李玉龙张艳春时伟位正鹏喻子牛
- 关键词:ITS1长度多态性系统发生关系
- 翡翠贻贝(Perna viridis)线粒体COI片段序列特性和香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)线粒体基因组全序列研究
- 由于在双壳贝类中/(M. trossulus, M. edulis,M. galloprovincialis, M. californianus,菲律宾蛤仔,罗纹贻贝/(Geukensia demissa/),以及珠蚌科...
- 位正鹏
- 关键词:香港巨牡蛎翡翠贻贝线粒体基因组
- 文献传递