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对于未知来源个体进行族群推断的自动分析系统被引量：14: 2018年; 建立一种基于概率算法、聚类分析和主成分分析的DNA族群推断系统(DNA Ancestry Analyzer Version1.0,简称DAA v1.0),用于对未知来源个体进行族群推断。DAA v1.0基础部分用Python语言、R语言、C语言编写;前端部分用node.js语言、HTML语言、css语言编写。DAA v1.0可对未知来源个体的族群进行推断,与已有分析方法相比,结果的一致性为100%,运算效率提升了600%。该系统可界面化、自动化地计算DNA来源人的群体匹配概率和似然比值、群体成分,绘制群体归类图,在人类遗传学、法医遗传学等领域有重要的应用价值。; 刘京李盛江丽赵蕾赵雯婷丰蕾刘海渤季安全李彩霞; 关键词：法医遗传学生物信息学

一种磁性有机磷农药分子印迹纳米微球制备方法及其应用: 本发明公开了一种新型磁性纳米有机磷农药分子印迹固定相的制备方法。首先以胶体沉淀法制备Fe<Sub>3</Sub>O<Sub>4</Sub>磁性颗粒，再用硅烷偶联剂γ-甲基丙烯酰氧基丙基三甲氧基硅烷对其表面进行包覆制得Fe...; 陈建虎刘海渤贾刚张凌怡; 文献传递

基于毛干蛋白质组的族群推断技术的建立与验证被引量：4: 2019年; 毛干是一种案件现场常见的生物物证,由于核DNA含量极少且高度降解,难以采用现有的短串联重复序列(short tandem repeat,STR)检验方法进行个人识别鉴定,目前仅使用线粒体DNA检验进行母系亲缘关系的判定,利用率非常低.毛干中蛋白质非常稳定,而且具有遗传多态性,表现为基因组中的非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,ns SNPs),转录翻译后形成蛋白质序列中的单氨基酸多态性(single amino acid polymorphisms,SAPs).充分利用毛干蛋白质中蕴含的遗传信息,为案件提供线索和证据,是实际公安业务的迫切需求,具有重要的应用价值.本文选取了104份中国汉族的毛干样本进行蛋白质组的检测,共获得了703个SAP位点,位于460个蛋白质上,共推导出552个nsSNP位点.进一步筛选在所有样本中检出率超过15%的位点,获得了88个nsSNP位点,使用毛干样本对应的口腔拭子DNA对88个ns SNP位点进行一代测序验证.为评估发现的nsSNP位点对于人群的区分能力,以千人数据库(1 000 Genome Project)为参考数据库,采用聚类分析和群体匹配概率等方法对检测的19份毛干样本进行人群来源推断.结果显示,通过检测毛干蛋白质组中的ns SNP可以实现东亚、欧洲、非洲三大洲际人群的区分.; 丰蕾江丽李姗飞张建刘海渤季安全叶健王桂强李彩霞

74重SNP族群来源推断体系准确性验证研究被引量：4: 2019年; 目的:验证74重单核苷酸多态性位点(SNP,Single Nucleotide Polymorphism)复合扩增体系用于全球十个区域亚人群(撒哈拉以南的非洲、北非、欧洲、西南亚、南亚、北亚、东亚、东南亚、大洋洲、美洲)推断的准确性。方法:基于Agena Mass ARRY平台构建74重SNP复合扩增体系,检测176份盲测样本和10份已知族群的对照样本,使用全球57个人群3628份个体SNP分型作为参考人群库,使用项目组自主研发的族群来源推断自动分析系统(DNA Ancestry Analyzer Version 1.0,以下简称DAA V1.0)计算176份盲测样本和10份对照样本的群体匹配概率(AMP,Population Assignment Match Probability)、似然比(LR,Likelihood Ratio)和族群成分,综合分析三个结果进行推断。结果:176份盲测样本的族群推断结果与样本信息一致性为92.34%,10份对照样本族群推断结果与样本信息一致性为100%。结论:该74重SNP复合扩增体系能够准确推断未知个体洲际人群和亚人群来源,在实际案件中可应用,为案件侦查提供更详细的科学线索。; 马咪刘京胡胜张涛周浩冯保强刘海渤李蓓李彩霞; 关键词：单核苷酸多态性

27重SNP复合扩增技术推断犯罪嫌疑人族群1例被引量：3: 2018年; 1案例1.1简要案情某年1月,新疆生产建设兵团某师辖区内发生一起故意杀人案,嫌疑人作案手段凶残,死者被锐器刺穿颈动脉和气管,导致失血性休克死亡。; 马咪刘京江丽赵蕾王博超虎建华张涛周浩冯保强刘海渤李彩霞; 关键词：法医遗传学复合扩增

27重SNP种族推断体系在案件中的应用被引量：1: 2019年; 应用公安部物证鉴定中心研发的27重SNP种族推断体系,对一起爆炸案件现场的检材进行种族来源推断,成功获得了该现场检材DNA的种族信息,其属混合人种,具有82%欧洲成分和11%东亚成分。该案循此侦查,查找到了嫌疑人的重要线索。本案所用推断体系可在常规DNA实验室应用,无需特殊仪器设备,可操作性强,所需DNA量小,适用于大部分检材。针对有些案件现场生物检材STR分型未能比中嫌疑人,使用该体系进行种族推断,可进一步挖掘现场检材蕴含的遗传信息,刻画嫌疑人,缩小侦查排查范围,为案件定性提供依据。; 张涛冯保强周浩马咪孙启凡刘海渤; 关键词：DNA SNP

27重SNP种族推断体系准确性验证研究被引量：14: 2015年; 目的验证所构建27重SNP复合检测体系,用于东亚、欧洲、非洲及其混合人群种族推断的有效性和正确性。方法国内7家单位的实验室提供盲测样本316份,由本中心实验室利用构建的27重复合SNP检测体系,使用毛细管电泳对样本进行检测。结果 316份样本检测结果与样本的已知祖先来源的一致性为99.37%。结论该体系可以有效区分洲际人群的祖先来源,为案件侦查提供重要的科学线索。; 刘海渤孙启凡陈健刚魏以梁李越唐晖程宝文李平迪力.夏提张涛马泉赵兴春李彩霞; 关键词：法医物证学 SNPS 复合扩增

族群来源推断自动分析系统的应用研究被引量：1: 2018年; 通过祖先信息位点(AIMs,Ancestry informative markers)推断未知个体祖先来源已成为法医遗传领域的重要研究内容。由于祖先来源推断数据分析方法复杂,分析人员除了掌握Python、R等计算机语言外,还需熟练运用structure、R、Forensic Intelligence v1.0等软件才能完成数据分析。族群来源推断自动分析系统(DNA ancestry analyzer Version 1.0,以下简称DAA v1.0)的研发有效简化了族群推断数据分析和结果解读过程。本研究通过对DAA v1.0系统与传统数据分析方法在新疆兵团案件应用中的准确性和效率进行比较,发现两种分析方法在案件中的4份检材与4份对照样本推断结果的准确性均为100%,但DAA v1.0自动分析系统比传统数据分析方法简单快速,效率是传统方法的8.7倍。; 马咪刘京张涛张涛江丽周浩赵蕾刘海渤李彩霞; 关键词：法医遗传学 SNPS

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刘海渤

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