薛晶晶
- 作品数：24 被引量：23H指数：3
- 供职机构：中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 一种木薯MeANR-VIGS系统及其应用
- 本发明提供了核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示的木薯MeANR基因的沉默片段，以及采用所述沉默片段构建的木薯MeANR‑VIGS系统及其应用。本发明采用木薯MeANR基因的特异性沉默片段构建沉默体系，能够有效沉默目标...
- 安飞飞蔡杰罗秀芹薛晶晶韦卓文陈松笔朱文丽
- 木薯转录因子MebHLH72、MebHLH114及其在抑制亚麻仁苦苷合成上的应用
- 本发明提供了一种木薯转录因子的编码基因，其为转录因子MebHLH72基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示；或者其为转录因子MebHLH114基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO：2所示。采用本发明的MebHL...
- 安飞飞肖鑫辉蔡杰薛晶晶罗秀芹陈松笔
- 木薯不同发育期块根基因组DNA甲基化变化分析被引量：2
- 2018年
- DNA甲基化在植物的转座子沉默和基因表达调控中起着重要的作用。本研究以淀粉含量差异较大的两个木薯种质SC5和Cas36-12为研究材料,采用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术,通过LabChip GX Touch微流控毛细管电泳系统分析其块根发育过程中的甲基化变化情况。结果表明:14对选择性扩增引物在SC5和Cas36-12中分别扩增出345和339个甲基化条带,SC5三个发育期的甲基化率高于Cas36-12,且都超过50%。比较SC5和Cas36-12块根发育3个关键时期的甲基化变化情况,发现两份材料甲基化变化的整体趋势是一致的。形成期到膨大期主要以发生甲基化为主;而膨大期到成熟期主要以去甲基化为主。
- 薛晶晶陈松笔
- 关键词：DNA甲基化
- 一种缩短木薯再生植株周期的方法
- 本发明公开了一种缩短木薯再生植株周期的方法，包括以下步骤：无菌苗的获得、FEC的诱导、FEC扩繁、FEC诱导植株再生；本发明采用自来水流速400‑500mL/min对木薯嫩茎组织进行冲洗，优选为500mL/min，500...
- 罗秀芹韦卓文罗知妃安飞飞薛晶晶朱文丽蔡杰陈松笔
- 木薯栽培种ZM-Seaside和花叶变种块根蛋白组学分析被引量：2
- 2017年
- 为研究木薯栽培种ZM-Seaside(高产种质)和花叶变种(低产种质)块根产量差异的原因,从农艺性状和蛋白质组学角度对以上2个种质进行分析,为选育高产木薯品种提供理论依据。试验中采用旋光法测定淀粉含量;硝酸银滴定法测定氢氰酸含量;苯酚抽提法提取蛋白质;双向电泳技术分离蛋白质;Delta2D软件确定差异蛋白质点;质谱技术鉴定差异蛋白质点,结合KEGG数据库将其功能分类;利用Western blot技术对部分差异蛋白质进行验证;String在线软件构建蛋白质互作调控网络。结果显示,ZM-Seaside块根淀粉含量为29.18%,显著高于花叶变种的25.83%;两种木薯鲜薯薯肉氢氰酸含量均低于50 mg/kg,属可食用木薯种质。ZM-Seaside干物率为40.28%,显著高于花叶变种的37.16%。以花叶变种块根的全蛋白质为对照,ZM-Seaside的块根存在39个差异蛋白质点,其中上调表达23个,下调表达16个;经质谱技术成功鉴定到其中28个,其功能涉及到碳水化合物和能量代谢(7个)、分子伴侣(8个)、解毒和抗氧化(2个)、蛋白质合成(1个)、结构蛋白(3个)及未知功能蛋白质(7个)。STRING代谢网络显示:热激蛋白Heat shock protein和分子伴侣Molecular chaperone Hsp90-1互作关系最多,是整个互作调控网络的枢纽。推测这2个蛋白质是影响ZM-Seaside和花叶变种块根产量差异的关键蛋白质,这些蛋白质有可能成为选育高产木薯种质的标记蛋白质。
- 宋雁超安飞飞薛晶晶秦于玲李开绵陈松笔
- 关键词：块根蛋白质组
- 木薯糖转运蛋白MeSWEET18的克隆与功能分析
- 2023年
- 木薯(Manihot esculenta Crantz)是热带亚热带地区重要的粮食作物。而SWEET家族基因在植物运输糖类、生殖和发育、植物逆境、与病原体互作等方面发挥着重要作用。为了明确SWEET家族基因在木薯生长发育过程中的功能,本研究以木薯华南9号(SC9)作为实验材料,克隆糖转运蛋白基因MeSWEET18并进行生物信息学分析,通过酵母实验验证其糖转运能力;采用qRT-PCR分析该基因在木薯不同器官及不同发育时期的表达情况以及在非生物胁迫下的表达趋势。结果表明:MeSWEET18基因开放阅读框为714 bp,编码237个氨基酸,蛋白分子质量为25.94 kDa,理论等电点为6.57,不稳定系数为37.50,属于稳定类蛋白。MeSWEET18蛋白N端含有保守结构域MtN3_slv,C端含有PQ-loop super family保守结构域,且具有7个跨膜结构域,是典型的膜蛋白。ProtScale预测表明MeSWEET18蛋白属于亲水性蛋白。系统进化树分析发现MeSWEET18属于CladeⅣ亚类,与AtSWEET16、AtSWEET17亲缘关系最近;氨基酸序列同源分析显示,MeSWEET18和AtSWEET16的同源性达到53.23%,MeSWEET18和AtSWEET17的同源性达到56.05%。酵母功能互补试验显示MeSWEET18主要转运果糖。qRT-PCR结果表明,随着木薯的生长发育,MeSWEET18在膨大期的块根中表达水平最高,成熟期时急剧下降;而在叶片、叶柄和茎杆中的表达水平随着木薯的发育呈上升趋势,至成熟期达到最大值。黑暗条件下,蔗糖、葡萄糖和果糖溶液对SC9水培苗的处理结果显示,MeSWEET18受果糖影响明显。对SC9水培苗进行高盐(8 g/L NaCl)、干旱(100 mmol/L甘露醇)、氧化(10%H_(2)O_(2))和低温(15℃24 h,后降至4℃24 h)等非生物胁迫,结果发现,MeSWEET18在叶片、叶柄、茎杆和根等不同器官的表达出现不同程度的变化。推测MeSWEET18在木薯的非生物胁迫中起着重要作用。
- 薛晶晶安飞飞朱文丽罗秀芹
- 关键词：木薯功能分析非生物胁迫
- 白心与黄心糖木薯代谢物及相关基因表达分析被引量：1
- 2022年
- 【目的】木薯是世界十亿人的口粮,选育高营养型品种是木薯育种的重要目标之一。通过对白心和黄心糖木薯薯肉代谢物及基因表达分析明确其差异,为高营养型木薯品种改良提供理论依据。【方法】采用超高液相色谱(UPLC)分析薯肉β-胡萝卜素含量,气相色谱质谱联用技术(GC-MS)分析薯肉糖含量,液相色谱质谱联用技术(LC-MS)分析薯肉代谢物,并对差异代谢物进行通路富集分析,采用qRT-PCR对关键基因的表达进行分析。【结果】黄心糖木薯β-胡萝卜素含量、淀粉含量、半乳糖含量、果糖含量显著高于白心木薯,而蔗糖含量和海藻糖含量显著低于白心木薯,葡萄糖含量与白心糖木薯无显著差异。以白心糖木薯为对照,利用代谢组学方法检测到2 719种代谢产物,其中267种代谢物发生显著变化,其中黄心糖木薯中上调差异代谢物163个,下调104个,主要涉及能量代谢、脂肪酸代谢、氨基酸代谢、苯丙烷生物合成、淀粉和糖代谢以及类黄酮代谢。267种差异代谢物被注释到74个代谢通路中,其中59种差异代谢物显著或极显著影响18个代谢通路。前10位发生极显著改变的代谢通路分别是亚油酸代谢、α-亚麻酸代谢、ABC转运、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、丙酮酸代谢、氨酰tRNA生物合成、氧化磷酸化、碳代谢、乙醛酸和二羧酸代谢和TCA循环。与白心糖木薯相比,黄心糖木薯中淀粉合成相关基因表达上调,淀粉降解相关基因表达下调,β-胡萝卜素合成相关基因均上调。【结论】黄心糖木薯薯肉β-胡萝卜素、淀粉、半乳糖和果糖含量高,而白心糖木薯薯肉中蔗糖和海藻糖含量高。黄心糖木薯脂肪酸代谢途径、淀粉及半乳糖代谢途径、苯丙烷生物合成及类黄酮代谢更活跃,而白心糖木薯氨基酸代谢途径和能量代谢途径更活跃。
- 安飞飞罗秀芹薛晶晶陈松笔蔡杰
- 关键词：木薯代谢通路基因
- 木薯块根β-胡萝卜素与采后腐烂的相关性研究
- 2021年
- 选取14个不同木薯种质的块根放置0~12 d,进行采后生理性腐烂观察,并检测不同时间点β-胡萝卜素的含量。结果显示,木薯块根中β-胡萝卜素含量与其采后生理性腐烂有一定的相关性,即β-胡萝卜素含量相对较高的种质其耐采后腐烂能力相对较强,但是不完全正相关;随着放置天数的增加,抗腐烂能力呈先升高后下降的趋势,其中放置6 d时其β-胡萝卜素含量最高,随后块根的腐烂程度加重。
- 罗妙明陈松笔安飞飞薛晶晶蔡杰罗秀芹
- 关键词：木薯Β-胡萝卜素采后腐烂
- 木薯组培苗中叶绿素和类胡萝卜素含量分析被引量：4
- 2020年
- 以TM60444和SC9木薯(Manihot esculenta Crantz)组培苗根、茎、叶为材料,采用乙醇∶丙酮溶液萃取方法,利用紫外-可见分光光度计对两种木薯组培苗根、茎、叶中的叶绿素和胡萝卜素含量进行了测定,并对类胡萝卜素生物合成相关基因进行了定量分析。结果表明,两个品种叶绿素和胡萝卜素含量都是叶>茎>根;而类胡萝卜素含量是叶>茎≈根。
- 罗秀芹韦卓文杨龙薛晶晶
- 关键词：类胡萝卜素定量PCR紫外-可见分光光度计
- 转录组和代谢组联合分析阐释木薯叶片花青素合成机制
- 2024年
- 木薯是世界上第六大粮食作物,其块根富含淀粉但缺乏蛋白质、花青素、胡萝卜素等营养物质。为了探索木薯花青素生物合成机制,本研究选取了两种不同颜色木薯种质资源叶片(FL与PL)为材料,进行转录组和花青素靶向代谢组及其联合分析。转录组分析结果显示在FL和PL中6864个差异表达基因,其中包含4112个上调表达和2752个下调表达。代谢组分析结果显示26种显著差异代谢物在PL中显著高于FL,其中21种属于花青素类。联合分析结果显示,其中7个差异表达的基因与花青素生物合成相关,且花青素含量与差异基因的表达呈正相关,尤其是MeANS1的表达差异最大。本研究结果为阐明木薯花青素的生物合成机制提供了候选基因,同时也为提高木薯花青素含量奠定科学基础。
- 罗秀芹韦卓文蔡杰安飞飞安飞飞薛晶晶
- 关键词：木薯类黄酮花青素转录组差异表达基因
