孙飞
- 作品数：7 被引量：1H指数：1
- 供职机构：华南理工大学生物科学与工程学院更多>>
- 发文基金：中央高校基本科研业务费专项资金国家自然科学基金国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学天文地球更多>>
- 中国境内食蟹猴TrimCyp基因频率研究
- TRIM5α在绝大部分的旧大陆猴中扮演抗逆转录病毒的角色,具有HIV-1限制活性。在旧大陆猴中TRIMCyp融合基因是由CypA假基因cDNA序列以逆转录转座的方式插入至TRIM5基因的3′非翻译区形成,而且TRIMCy...
- 田帅蒙裕欢孙飞陈军辉杜红丽王小宁
- 基于人T2DM易感SNP位点筛查食蟹猴T2DM易感SNP标记
- 目的:2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)及其并发症的迅速蔓延已经成为严重威胁人类健康的世界性难题.食蟹猴T2DM模型可以模拟人类T2DM发病进程,这对T2DM的预防,治疗和新药开发具...
- 孙飞柳明玉蒙裕欢田帅陈军辉杜红丽
- 关键词：易感基因位点
- 文献传递
- 中国圈养食蟹猴TrimCyp基因频率
- 2013年
- TRIM5α在绝大部分的旧大陆猴中扮演抗逆转录病毒的角色，能够限制HIV-1的活性。TRIM Cyp融合基因是继TRIM5α后的另一个抗H1V-1因子研究热点。旧大陆猴的TRIMCyp融合基因是由CypA假基因cDNA序列以逆转录转座的方式插入至TRIM5基因的3’非翻译区形成，而且TRIMCyp融合基因在不同灵长类动物中具有地域、基因频率、基因型以及抗逆转病毒效应的差异。虽然食蟹猴TRIMCyp基因的频率在东南亚几个国家或地区已经被初步调查，但是，中国大陆食蟹猴养殖场的TRIMCyp基因频率还没有明确阐明。该研究对中国5个省11个养殖场共1594个食蟹猴（Macaca fascicularis）繁殖种群随机样本的TRIMCyp基因频率进行了筛查研究，发现各场频率略有差异，从7．65％～19．79％不等，显著低于已报道的菲律宾、马来西亚和印度尼西亚来源食蟹猴的TRIMCyp基因频率（34．85％～100％）。该原因可能是由于后者是建立于1978年的封闭群。对带有TRIMCyp融合基因的个体CypA测序发现带有NE单倍型的食蟹猴个体很少，NE单倍型频率（4．93％）显著低于东南亚三个国家食蟹猴的NE单倍型频率（11．1％～14．3％）纯合子。该研究为进一步开展食蟹猴HIV-1动物模型和发病机制提供了基础信息。
- 田帅蒙裕欢柳明玉孙飞陈军辉杜红丽王小宁
- 关键词：基因频率多态性
- 基于人2型糖尿病易感SNP位点筛查食蟹猴2型糖尿病易感SNP标记被引量：1
- 2014年
- 目的 2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)及其并发症的迅速蔓延已经成为严重威胁人类健康的世界性难题。食蟹猴T2DM模型可以模拟人类T2DM发病进程,这对T2DM的预防,治疗和新药开发具有重要意义。本研究以37个与人密切关联的T2DM易感位点为基础,探讨对应食蟹猴同源区域的这些位点与83个食蟹猴个体之间的关联性。方法先采用DNA池法初筛,然后对食蟹猴个体进行直接聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增测序,并利用DNAStar软件分析碱基之间的差异性,最后采用方差分析和F检验计算等位基因间的频率,并采用SAS的GLM模型进行基因型与空腹血糖值和糖化血红蛋白值之间的关联分析。结果在自发性T2DM组和对照组中,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点SNPmf-66A、SNPmf-66B、SNPmf-34A、SNPmf-34B、SNPmf-34C、SNPmf-56A、SNPmf-56B和SNPmf-56C的等位基因频率存在差异显著性(P<0.05),同时SNPmf-66A、SNPmf-66B、SNPmf-34A、SNPmf-34B和SNPmf-34C与空腹血糖之间也存在显著性关联性(P<0.05)。结论 SNPmf-66A、SNPmf-66B、SNPmf-34A、SNPmf-34B、SNPmf-34C可能对食蟹猴T2DM动物模型构建具有重要意义。
- 柳明玉孙飞蒙裕欢田帅陈军辉杜红丽
- 关键词：2型糖尿病食蟹猴易感基因位点
- 中国境内食蟹猴TrimCyp基因频率
- TRIM5α在绝大部分的旧大陆猴中扮演抗逆转录病毒的角色,具有能够限制HIV-1的活性.TRIMCyp融合基因是继TRIM5α后另一个抗HIV-1因子的研究热点,在旧大陆猴中TRIMCyp融合基因是由CypA假基因cDN...
- 田帅蒙裕欢柳明玉孙飞陈军辉杜红丽王小宁
- 关键词：基因频率多态性
- 利用DNA测序图筛查插入/缺失突变
- 2013年
- DNA测序技术是现代生物学研究的重要手段之一,虽然第2代高通量测序技术已经广泛应用,但是常规测序技术如Sanger双脱氧终止测序技术仍然不可替代。以20个食蟹猴基因组为模板,利用聚合酶链式反应扩增目的片段,PCR产物纯化后测序,对PCR产物测序信号弱或无信号、含poly结构、碱基缺失/插入等情况的峰图进行分析,提出基于PCR产物测序筛查插入/缺失突变的方法,以提高测序结果判定的有效性和准确性。
- 孙飞陈军辉柳明玉杜红丽
- 关键词：DNA测序聚合酶链式反应
- 食蟹猴2型糖尿病易感SNP标记筛查研究
- 二型糖尿病(Type2Diabetes Mellitus,T2DM)已成为威胁人类健康的重大问题，为更好地揭示2型糖尿病的发病机制及寻找潜在的治疗方案，相关的动物疾病模型是必不可少的工具。已有的基因组数据显示，食蟹猴的基...
- 孙飞
- 关键词：食蟹猴2型糖尿病单核苷酸多态性易感基因
- 文献传递
