侯晓慧
- 作品数:3 被引量:2H指数:1
- 供职机构:河北农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金河北省自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 牛Meg8基因的克隆、组织表达及印记状态分析
- 基因组印记是一种表观遗传现象,来自亲本的等位基因或染色体在发育过程中产生专一性的加工修饰,导致后代细胞中两个亲本来源的等位基因有不同的表达活性,具有这种亲本差异性表达现象的基因称为印记基因。Dlk1-Dio3区域是在哺乳...
- 侯晓慧
- 文献传递
- 牛Gtl2基因cDNA序列分析及启动子预测被引量:1
- 2011年
- 利用RT-PCR和RACE方法,克隆得到了牛Gtl2基因cDNA全序列,生物信息学分析表明:该序列有8个外显子,含有一个最长645 bp的开放读码框,但没有发现与Kozak规则相匹配的翻译起始序列。Gtl2基因在物种间具有保守性,尤其是第1个外显子表现出了较强的保守性。基因进化树分析表明,牛Gtl2基因与绵羊Gtl2基因的亲缘关系最近。使用启动子预测,在线软件对牛Gtl2基因的5′侧翼序列进行分析,得出了潜在的启动子区域,这些区域含有TATA,CAAT框和GC框,并存在一些转录因子结合位点,而且在5′侧翼区域发现有3个CpG岛。转录因子结合位点和CpG岛可能与牛Gtl2基因的转录及其表达调控有关。
- 苏红侯晓慧李世杰
- 关键词:生物信息学分析启动子转录因子结合位点
- 牛Meg8基因5′末端的克隆及生物信息学分析被引量:2
- 2011年
- 利用RACE方法从奶牛中克隆得到了Meg8基因的5′端cDNA序列(GenBank登录号:HQ407410~HQ407413),序列比对发现该基因存在4种可变剪接体。选取牛Meg8基因的5′侧翼区作为研究对象,生物信息学在线分析发现:在人、绵羊、鼠、猪、狗和马这几个物种中,牛Meg8基因5′侧翼区与绵羊相似性最高,为80.45%;该区域内存在2个SINEs、1个Si mple repeat,未发现CpG岛;可能存在2个启动子位点,位于牛Meg8基因的Exon1前3 402~4 118 bp和1 200~1 367 bp处,并富含Sp1、SRY、CdxA、GATA-1、MZF1等多个潜在的转录因子位点。Meg8基因5′侧翼区密集存在的转录因子可能与基因的转录起始有关。可变剪接体及侧翼区域的诸多转录因子可能是Meg8基因行使调控功能的原因,本研究结果将为阐明该基因的功能及其调控机理提供分子基础。
- 侯晓慧苏红李世杰
- 关键词:可变剪接启动子转录因子结合位点