戴婷婷
- 作品数:20 被引量:81H指数:5
- 供职机构:南京农业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国博士后科学基金江苏省博士后科研资助计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 大豆北方茎溃疡病菌的检测靶标及其LAMP引物组合物和应用
- 本发明属于基因工程领域,公开了大豆北方茎溃疡病菌的检测靶标及其特异性LAMP引物组合物和应用。大豆北方茎溃疡病菌的检测靶标序列Tef,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,该靶标序列特异性的LAMP引物组合物,正向内引...
- 郑小波沈浩戴婷婷王源超张海峰
- 文献传递
- 一种基于LAMP技术检测大豆尖镰孢菌的方法及使用的引物组合物
- 本发明公开了一种基于LAMP技术检测大豆尖镰孢菌的方法及使用的引物组合物。一种基于LAMP技术检测大豆尖镰孢菌的引物组合物,由大豆尖镰孢LAMP分子检测的四条特异性引物FIP、BIP、F3、B3,以及两条用于加快反应速度...
- 郑小波陆辰晨戴婷婷王源超张海峰
- 等温扩增技术快速检测棕榈疫霉被引量:6
- 2016年
- 【目的】棕榈疫霉是农林业生产上的一种危害严重的病原菌,建立棕榈疫霉的快速分子检测技术对于预测疫病发生情况、及时采取有效的防治方法控制疫病的传播和流行、减少经济损失具有重要意义。【方法】采用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),建立了以基因间隔区(intergenic spacer,IGS)为靶标的快速、简单、特异和灵敏的棕榈疫霉菌的检测方法。以IGS基因为靶序列,利用环介导等温核酸扩增技术,设计了多组LAMP引物,同时建立并优化了LAMP反应体系与条件,最终筛选出1组扩增反应结果较好的LAMP引物,采用该组引物进行特异性、灵敏度和实际应用的验证。在扩增前加入染料羟基萘酚蓝(HNB)作为反应指示剂,根据HNB的颜色变化判定反应结果。【结果】整个检测过程在等温64℃条件下仅需80 min即可通过肉眼直接目测试验结果。在特异性试验中,通过HNB显色只有在棕榈疫霉菌株中能观察到天蓝色的阳性反应,而在其他疫霉、腐霉和真菌的供试菌株仍为紫色的阴性反应;在灵敏度试验中,PpIGS-LAMP技术检测灵敏度达到10fg.μL^(-1)目标菌纯DNA;在实际应用中,PpIGS-LAMP技术能够快速检测出采自田间的木薯根部土壤中目标菌和人工接种发病木薯组织样品的目标菌。【结论】本研究在国内外首次采用环介导等温扩增技术检测棕榈疫霉,建立了1种快速、高灵敏度、高特异性、可视化的棕榈疫霉的LAMP检测方法。建立的棕榈疫霉菌的LAMP检测方法在80 min内可完成待检样品的检测过程,显著缩短检测时间,降低基层部门的检测成本,为棕榈疫霉引起疫病的检疫和所致病害的快速诊断提供了新的检测技术。
- 戴婷婷吴小芹
- 关键词:环介导等温扩增
- 大豆南方茎溃疡病菌的检测靶标及其LAMP引物组合物和应用
- 本发明属于基因工程领域,公开了大豆南方茎溃疡病菌的检测靶标及其特异性LAMP引物组合物和应用。大豆南方茎溃疡病菌的检测靶标序列Tef-α,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,该靶标序列特异性的LAMP引物组合物,正向...
- 郑小波沈浩戴婷婷王源超张海峰
- 文献传递
- 可视化环介导等温扩增技术检测Phytophthora tentaculata被引量:3
- 2015年
- 为了能在植物发病早期快速、准确地鉴定出Phytophthora tentaculata引起的疫病,控制疫病的传播和流行,减少其造成的经济损失,笔者以Ypt1基因为靶序列应用环介导等温核酸扩增技术(loop-mediated isothermal am-plification,LAMP),建立了一种基于颜色判定的简单、快速和灵敏的P.tentaculata检测方法。结果表明:在等温条件下(64℃)进行核酸扩增反应80 min,反应后经2%琼脂糖凝胶电泳和扩增前加入染料HNB(羟基萘酚蓝)作为反应指示剂验证扩增结果,在特异性实验中,P.tentaculata菌株能够扩增到梯形状的条带,同时HNB显色观察到天蓝色的阳性反应,而从其他疫霉、腐霉和真菌供试菌株中均没有观察到这些现象。在灵敏度试验中,PtYpt1-LAMP技术最低检测限为1 ng/μL。
- 戴婷婷康振烨吴小芹
- 关键词:PHYTOPHTHORA环介导等温扩增
- 基于Ypt1靶标的大豆疫霉环介导等温扩增技术的研究被引量:1
- 2015年
- 大豆疫霉侵染大豆引起的根腐病是大豆生产上的毁灭性病害之一。本研究以Ypt1基因作为靶标,利用环介导等温扩增(LAMP)技术,设计了特异性检测体系,整个过程仅需60 min,即可通过肉眼直接目测检测结果。反应后经浊度仪验证浊度变化、琼脂糖凝胶进行电泳验证和在扩增前加入染料HNB(羟基蔡酚蓝)作为反应指示剂验证扩增结果。特异性检测中,111个大豆疫霉菌株均能产生浊度曲线和扩增到梯形状的条带,同时HNB显色观察到天蓝色的阳性反应,而其它疫霉、腐霉和真菌供试菌株中均没有观察到这些现象;在灵敏度检测中,PsYpt1-LAMP技术最低检测限达到100 pg·μL^(-1),比普通PCR技术的最低检测限高出10倍;在田间应用方面,PsYpt1-LAMP检测技术明显提高了检测效率。本研究建立的LAMP检测体系可用于口岸和田间对大豆疫霉的快速检测。
- 戴婷婷郑小波吴小芹
- 关键词:大豆疫霉环介导等温扩增技术
- 用于检测大豆疫霉的LAMP引物组合物及其应用
- 本发明属于基因工程领域,涉及用于检测大豆疫霉的LAMP引物组合物及其应用。所述的引物组合物由序列为SEQ ID No.1所示的正向内引物FIP、序列为SEQ ID No.2所示的反向内引物BIP、序列为SEQ ID No...
- 王源超戴婷婷董莎萌郑小波
- 疫霉菌环介导等温扩增技术快速检测的研究
- 疫霉属包括很多疫霉种,能够在全世界范围内引起农作物、观赏植物、林木作物的重要病害。由于疫霉菌引起的病害症状与其他病菌引起的症状相似,而且其分离和培养较困难。叶碟诱集与形态学鉴定等传统方法是生产上常用的检测技术,但是费时费...
- 戴婷婷
- 关键词:疫霉菌环介导等温扩增技术特异性灵敏度
- 文献传递
- 大豆疫霉的检测靶标序列A3apro及其特异性LAMP引物组合物和应用
- 本发明属于基因工程领域,涉及大豆疫霉的检测靶标序列A3apro及其特异性LAMP引物组合物和应用。大豆疫霉的检测靶标序列A3apro,核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。针对A3apro设计的特异性的LAMP引物组合...
- 王源超戴婷婷董莎萌郑小波
- 大豆拟茎点种腐病菌的检测靶标及其PCR引物组合物和应用
- 本发明属于基因工程领域,公开了大豆拟茎点种腐病菌的检测靶标及其PCR引物组合物和应用。大豆拟茎点种腐病菌的检测靶标序列Tef,核苷酸序列如SEQ?ID?NO.1所示,该靶标序列特异性的普通PCR引物组合物,上游引物FP如...
- 郑小波沈浩戴婷婷王源超张海峰
- 文献传递