刘铁
- 作品数：4 被引量：6H指数：2
- 供职机构：西南大学更多>>
- 发文基金：重庆市自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 从金凤蝶分离的一株微孢子虫的全基因组MITEs转座子鉴定与系统进化分析被引量：3
- 2014年
- 微型反向重复转座元件（MITEs）是一种非自主性DNA类转座子。从四川省雅安市野外的金凤蝶（Papiliomachaon Linnaeus）中分离到-株微孢子虫，简称PM-1。采用生物信息学分析方法，利用MITE—Hunter软件在PM．1基因组中鉴定出21个MITEs家族，命名为NpmMEl-NpmME21。其中有5个家族属于Stowaway—like类，1个家族属于Tourist-like类，2个家族属于Pegasus—like类，其余13个家族为新家族。比较家蚕微孢子虫（Nosema bombycis）已鉴定的MITEs转座子，发现PM-1分离株的NpmME20与家蚕微孢子虫的NbMEI属于同一家族，且在家蚕微孢子虫基因组中的拷贝数是PM-1分离株基因组中的30倍，表明该MITEs家族从2种微孢子虫共同祖先分化后，在家蚕微孢子虫基因组中经历了爆发式的扩增。对PM．1分离株NpmMEs各家族内拷贝序列两两间遗传距离的分析显示，NpmME1、NpmME8家族的遗传距离明显大于NpmME10、NpmME13、NpmME16家族，在家蚕微孢子虫中也有类似现象，暗示着前两者更为古老。进一步调查NpmMEs在PM．1基因组上的位置发现，NpmMEs转座子偏向于分布在基因侧翼非编码区，无基因内插入偏向；部分NpmMEs序列与基因起始密码子或终止密码子重叠，改变了基因的原有结构。研究结果有助于进一步阐释微孢子虫MITEs转座子的进化起源以及对基因组结构的影响。
- 刘铁许金山李田潘国庆何强李学燕周泽扬
- 关键词：微孢子虫家蚕微孢子虫
- 家蚕微孢子虫细菌人工染色体文库的构建被引量：2
- 2009年
- 细菌人工染色体(BAC)文库是进行生物基因组学研究的一个重要手段。以家蚕微孢子虫(Nosema bomby-cis)重庆分离株为材料,在前期构建的家蚕微孢子虫基因组框架图数据基础上,对构建家蚕微孢子虫BAC文库过程中的关键技术,如脉冲胶块(plug)的制备与处理、限制性酶的筛选、DNA的部分消化、酶切片段的选择、插入DNA片段与载体的摩尔比值等进行了研究,建立了构建家蚕微孢子虫BAC文库适宜的技术体系。构建的家蚕微孢子虫BAC文库由6 478个克隆构成,克隆片段平均大小约为50 kb,相当于家蚕微孢子虫基因组(15.33 Mb)的20倍,文库空载率较低,有利于深入开展家蚕微孢子虫基因组相关方面的研究。
- 杨柳潘国庆刘含登许金山李田刘铁张绍鹏周泽扬
- 关键词：家蚕微孢子虫基因组细菌人工染色体文库
- 一株寄生于金凤蝶的微孢子虫的鉴定及其基因组研究
- 从金凤蝶体内分离到的一株微孢子虫，其与家蚕微孢子虫的超微结构和基因组序列都极其相似。对该病原进行鉴定及基因组研究，不仅对防控金凤蝶微孢子虫病有重要的意义，也对研究家蚕微孢子虫的起源及进化具有重要的科学价值。本研究从该病原...
- 刘铁
- 关键词：微孢子虫功能基因组学
- 家蚕微孢子虫几丁质酶基因的比较基因组学分析被引量：1
- 2008年
- 几丁质是构成家蚕微孢子虫细胞壁的主要成分,广泛分布于原生生物、真菌、节肢动物和甲壳类生物之中,能够被几丁质酶(EC 3.2.1.14)水解。本文基于家蚕微孢子全基因组数据,采用生物信息学方法,鉴定获得家蚕微孢子虫几丁质酶基因,命名为Nb_chi。该基因有2个拷贝,其中一个Nb_chi_1长度为2 286bp,编码761aa,pI为6.35。含有一个信号肽以及一个Glyco_hydro_19结构域。另一个拷贝Nb_chi_2仅含552bp,183aa,仅含Glyco_hydro_19结构域部分,可能为一不完整的拷贝。系统进化分析显示,家蚕微孢子虫与其他种类的微孢子虫聚在同一个进化枝,均属几丁质酶第19族。本文为深入进行家蚕微孢子虫几丁质酶的功能研究奠定了基础。
- 刘铁胡军华潘国庆周泽扬
- 关键词：家蚕微孢子虫几丁质酶进化
