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HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究被引量：1: 2009年; 1RT1蛋白是一个HIV-1逆转录酶核心蛋白,是抑制剂药物分子的作用靶点.非核苷类抑制剂MKC分子是1RT1蛋白中的配体分子.采用量子力学密度泛函理论,B3LYP计算方法,结合6-31G(d,p)基组,逐个计算MKC分子与其周围半径0.7 nm结构范围内的34个氨基酸残基相互作用和结合能,发现在1RT1蛋白中103Lys残基是MKC分子的结合作用位点,结合能值为-46.73 kJ.mol-1.该结合位点的发现将为进一步设计和寻找抗HIV-1逆转录酶抑制剂药物分子提供一些理论基础.; 王宁邓圣荣金毅徐四川何耀莹; 关键词：HIV-1 结合位点 DFT

CIONO2＋Cl^-→NO3^-＋Cl2反应的溶剂化: 2008年; 气相反应CIONO2＋Cl^-→NO3^-＋Cl2 ，存在一个深达-55．3kJ／mol的势能阱，低温时阻止该反应产生产物NO3^-和Cl2。本文采用B3LYP／6—311＋＋G（d，P）理论方法，研究该化学反应中水分子溶剂化作用，探讨溶剂化过程反应机理。研究结果显示，水分子溶剂化作用使该反应势能阱消失，反应快速产生产物NO3-和Cl2。; 迟绍明王宁方芳邓圣荣马丽英徐四川; 关键词：密度泛函理论溶剂化

在星际媒介中合成H_2NCH_2CN分子的理论研究(英文)被引量：2: 2007年; 在早期地球原始化学生命起源过程中,氨基酸是重要的必需的生物化合物,生成肽和蛋白.为了探究一个可能的新的氨基酸起源,采用密度泛函理论(B3LYP)在6-311++G(d,p)基组水平上研究了在星际媒介条件下在气相中和在模拟的冰颗粒表面上的化学反应:CH2NH分子和两个异构体分子HNC/HCN通过Strecker合成生成H2NCH2CN(氨基乙氰,一个重要的苷氨基酸前置分子).在研究体系中,CH2NH、HCN、HNC和H2O分子存在于星际密集分子云中,且早于地球广泛存在.研究证明,这些分子之间在星际媒介条件下和在冰颗粒表面上通过Strecker合成路线很容易生成H2NCH2CN.所以,H2NCH2CN分子在宇宙的星际密集分子云中是广泛存在的.还讨论了H2NCH2CN分子在新的氨基酸起源中所起的作用,以及在通过“原始汤”生命起源理论解析早期地球生命起源中可能所起的作用.; 徐四川王宁; 关键词：早期地球生命起源密度泛函理论

ADP核糖基转移酶蛋白活性位点的研究: ＜正＞ADP 核糖基转移酶影响肿瘤发生和生命老化。体外和体内研究表明抑制 ADP 核糖基转移酶则可降低 DNA 修复功能,增强放疗和化疗对肿瘤的治疗效果。ADP 核糖基转移酶是一个潜在的治疗癌症靶点。所以,研究 ADP ...; 徐四川王宁邹成亮王琳马丽英邓圣荣经山; 文献传递

H2NCH2C（OH）NH→H2NCH2CONH2质子转移反应从头计算研究: ＜正＞2-氨基乙酰亚胺酸（H2NCH2C（OH）NH）分子是氨基乙腈（H2NCH2CN）Strecker水解反应生成甘氨酸的中间体分子,它的质子转移反应涉及到氨基酸起源的研究。采用量子力学从头计算,MP2计算方法和CCS...; 邓圣荣马丽英王宁单香丽张令霞徐四川; 关键词：质子转移 MP2 PCM; 文献传递

NO3^-＋Cl2→ClONO2＋Cl^-反应势能面和势能阱被引量：2: 2008年; 采用密度泛函理论B3LYP方法和6-311+G(d)基组,计算构建离子-分子气相反应NO3-+Cl2→ClONO2+Cl-的三维势能面.三维反应势能面证明该反应没有过渡态和势能垒,但是存在一个深达-55.0kJ/mol的势能阱(以氯气分子和硝酸根离子相隔无穷远为参量).在势能阱底部,有个化合物(O2NOClCl)-称为势阱化合物,依赖于势能阱而稳定存在.理论红外光谱预测低温红外光谱能检测该势阱化合物.低温条件下,该反应由热力学控制,反应产物是势阱化合物(O2NOClCl)-.当温度升高,该反应由动力学控制,势阱化合物(O2NOClCl)-不稳定,发生分解反应,重新生成NO3-和Cl2.研究结果可用来解释低温时ClONO2与Cl-气相反应不能产生Cl2的原因.; 迟绍明王宁马丽英方芳田国才李国宝徐四川; 关键词：势能面化学动力学

采用密度泛函理论系统表征苷氨酸构象体的研究(英文)被引量：1: 2007年; 采用密度泛函理论,B3LYP/6-311+G**模型化学,计算绘制苷氨酸分子内三个键转动产生的三个自由度的势能面,用于准确和系统表征苷氨酸所有的构象异构体.从势能面上,取得了总共14个苷氨酸构象异构体,其中包括取得一个新的苷氨酸构象异构体.研究所有的苷氨酸构象异构体之间相互转换,并且探讨了苷氨酸构象异构体的对称性问题.; 徐四川经山邹成亮王宁信文瑜; 关键词：对称性 DFT

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王宁