王越
- 作品数:15 被引量:60H指数:5
- 供职机构:大连市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:大连市卫生局课题国家自然科学基金辽宁省自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 诺如病毒的病原特点和感染机制研究进展被引量:5
- 2019年
- 诺如病毒是最早被确定为引起胃肠炎的病原,但由于诺如病毒不易获得和无常规检测方法限制了人们对诺如病毒是重要病原的认识。近年,随着对诺如病毒的深入研究和新的检测技术的应用,逐渐提高了人们对诺如病毒影响的认识。就诺如病毒的病原特点和感染机制研究进展进行综述。
- 栾明春王越周林
- 关键词:诺如病毒病原特点
- 手足口病流行病学及防治的研究概况被引量:25
- 2016年
- 手足口病(hand foot and mouth disease,HFMD)是由多种肠道病毒引起的常见传染病,以婴幼儿发病为主。肠道病毒71型(EV71)与柯萨奇病毒A16(Cox A16)感染交替出现,成为手足口病的主要病原体,全球流行地区较为广泛,世界大部分地区均有此病流行报道,全年均可发病,5-10月为流行高峰期。因个别地方出现少数患儿中枢神经系统、呼吸系统和循环系统损害,经全力抢救无效死亡,引起社会各界广泛关注。目前,手足口病已经成为严重的公共卫生问题,应采取综合性防治措施,切实预防和控制手足口病的流行和爆发流行。
- 刘颖丽纪颖于蕾刘丹红王越解傲
- 关键词:手足口病流行病学分析传染病防控
- 一种基于高通量测序的病毒全基因组序列组装分析方法
- 本发明公开一种基于高通量测序的病毒全基因组序列组装分析方法,属于基因组序列组装分析方法技术领域。所述的方法是基于UNIX平台的开源软件对病毒基因组高通量测序下机序列数据进行组装分析,包括步骤:S1:准备参考基因组序列和待...
- 薄志坚栾明春郎兴莹王越
- 2016-2017年大连地区流行性角结膜炎病原流行特征被引量:7
- 2018年
- 目的探讨大连市腺病毒感染流行性角结膜炎的病原分布。方法选取大连市区三家医院眼科结膜炎患者眼结膜囊分泌物为样本,采用real-time PCR方法对腺病毒进行核酸检测。结果 243份标本中,121份为腺病毒阳性,其中27份3型阳性,61份8型阳性,24份19/37型阳性,1份3型和8型同时阳性,8份未分型。结论人腺病毒8型是大连市急性病毒性结膜炎的主要病原,3型、19/37型次之。
- 郎兴莹王越刘颖丽杨世宏刘丹红周林薄志坚
- 关键词:流行性角结膜炎腺病毒
- 大连市2014年-2017年监测年度流感病毒核酸检测结果分析被引量:16
- 2018年
- 目的了解大连市2014年-2017年监测年度流感病毒流行趋势和病原特征,为大连市流感预防控制工作提供基础。方法对大连市2014年4月1日-2017年3月31日2家国家级流感监测哨点医院的流感样病例(ILI)的鼻咽拭子标本采用实时荧光定量PCR方法进行核酸检测。结果共检测3 960份标本,阳性599份,阳性率为15.13%,高峰出现在每年冬季12月-次年3月,由各型流感病毒交替引起。5岁~14岁年龄组的核酸检测阳性率最高。检测样本中男、女比例为1.14∶1。结论 2014年-2017年大连市流感流行形式严峻,流感样病例百分比和阳性率较高;流感流行主要在冬春季,流行型别多样,主要以新甲型H1N1、季H3N2、BY系和BV系交替流行为主;15岁以下年龄组为主要的易感人群;不同性别感染率无差异。
- 王越郎兴莹孙楠韩焱刘丹红
- 关键词:流感核酸检测病原学
- 大连市伤寒沙门菌耐药性及耐药基因分析
- 2021年
- 目的检测多重耐药伤寒沙门菌对抗菌药物的敏感性及其耐药基因携带情况,为伤寒沙门菌引起的腹泻治疗提供科学依据。方法采用微量肉汤稀释的方法测定大连地区临床分离的78株伤寒沙门菌对12种抗生素的敏感性;用PCR方法检测TEM型β-内酰胺酶基因、catA和catB氯霉素乙酰基转移酶基因以及cmlA氯霉素外排泵蛋白基因、aac(6′)-Ⅰb和aac3-Ⅱ型氨基糖苷类修饰酶基因、qacEΔ1-sul1耐消毒剂和磺胺基因、多重耐药外排基因acrB等8种耐药基因。结果 78株沙门菌对12种药物有不同程度耐药(1.28%~74.35%)。得到9株多重耐药菌株,其中5株检出TEM型β-内酰胺酶基因;7株耐氯霉素的伤寒沙门菌菌株中,2株仅检出catA基因,1株仅检出catB基因,1株仅检出cmlA氯霉素外排泵蛋白基因,2株同时检出catA基因和cmlA氯霉素外排泵蛋白基因;2株检出aac-(6′)-Ⅰb基因,1株检出aac3-Ⅱ型氨基糖苷类修饰酶基因;4株检出耐消毒剂和磺胺基因qacEΔ1-sul1;6株检出多重耐药外排基因acrB。结论大连地区临床分离的伤寒沙门菌存在严峻的耐药现象,多种耐药基因存在于耐药伤寒沙门菌中,可能是导致菌株对多种抗菌药物耐药的原因。
- 肖冰王越郎兴莹司虹薄志坚
- 关键词:伤寒沙门菌耐药性耐药基因
- 利用转录组测序技术在大连地区发现类鼻疽伯克霍尔德菌感染病例
- 2024年
- 目的利用转录组测序技术直接检测疑似感染患者标本中的未知病原体,为感染的诊断、治疗和预警提供依据。方法对大连地区疑似感染的一名患者的标本进行RNA提取,直接用于RNA文库构建和测序,对测序获得数据进行生物信息学分析,与微生物数据库进行比对。为验证可疑病原体,对标本进行分离培养和特异性PCR扩增。结果经分析,该患者标本有2216条序列reads与类鼻疽伯克霍尔德菌同源,验证结果显示从标本中分离到鼻疽/类鼻疽伯克霍尔德菌,并从标本中特异扩增出类鼻疽伯克霍尔德菌的序列而未扩增出鼻疽伯克霍尔德菌的序列,提示患者体内存在类鼻疽伯克霍尔德菌感染。结论首次在大连地区检出类鼻疽病例。转录组测序技术可直接检测疑似感染患者体内未知病原体,可为传染病等突发公共卫生事件的预警、监测和处置提供有力手段。
- 栾明春王越郎兴莹薄志坚
- 关键词:转录组测序类鼻疽伯克霍尔德菌
- 2020-2023年大连地区诺如病毒胃肠炎疫情分子流行特征分析
- 2024年
- 本研究分析了2020-2023年大连市16起急性胃肠炎疫情中诺如病毒的基因型特征。收集2020-2023年大连市16起急性胃肠炎病例的粪便标本154份。采用实时荧光定量反转录PCR方法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ分型,并对阳性样本进行RNA依赖的RNA聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分序列进行RT-PCR扩增和测序,通过诺如病毒在线分型工具和人类杯状病毒分型工具进行比对确定诺如病毒分型,利用MEGA软件构建系统进化树。结果显示全部154份样品中,检测诺如病毒阳性106份,其中诺如病毒GⅠ组检出率3.77%(4/106),GⅡ组检出率96.23%(102/106)。16起疫情中15起由GⅡ型引起,1起由GⅠ型引起,无GⅠGⅡ混合感染,疫情以GⅡ型为主。2020/2021流行季和2022/2023流行季的主要流行株是GⅡ.2[P16],并且该基因型在不同年份变异不大。2021/2022流行季存在多种型别共存,无优势流行株。2020-2023年大连市诺如病毒胃肠炎疫情主要发生在11月至次年4月,场所主要是幼儿园和中小学。
- 王越郎兴莹于蕾薄志坚栾明春
- 关键词:诺如病毒基因分型分子进化
- 大连地区2022—2023年冬春季呼吸道感染病原谱分析被引量:1
- 2024年
- 目的了解大连地区2022—2023年冬春季呼吸道感染病原体分布情况,为呼吸道传染病防控提供实验室依据。方法收集2022年10月至2023年3月的流感样病例咽拭子标本,采用荧光定量PCR对每月的10份标本进行22种急性呼吸道感染常见病原体核酸检测,并对检测结果进行分析。结果60份标本中病原体阳性共54份(90.00%),分别检出12种呼吸道病原体,包括肺炎链球菌、流感嗜血杆菌、甲型流感病毒、呼吸道合胞病毒、新型冠状病毒、铜绿假单胞菌、人偏肺病毒、呼吸道腺病毒、肺炎克雷伯菌、人鼻病毒、肠道病毒、人博卡病毒,其中肺炎链球菌阳性31份,检出率最高(51.67%)。60份标本中同时检出2种以上病原体的有21份(35.00%),其中肺炎链球菌和流感嗜血杆菌同时阳性的10份,在混合感染标本中占比最高(47.62%)。按时间顺序,2022年10月至2023年3月各月检出率最高的病原体依次是肺炎链球菌、呼吸道合胞病毒、新型冠状病毒、肺炎链球菌、肺炎链球菌、甲型流感病毒,各月均有肺炎链球菌和流感嗜血杆菌检出。结论大连地区2022—2023年冬春季除了有新型冠状病毒和流感病毒流行外,还存在肺炎链球菌、呼吸道合胞病毒等多种病原体引起的单一病原感染和混合感染,其中混合感染占比较高。
- 栾明春郎兴莹王越韩焱滕雪张腾
- 关键词:呼吸道病原体
- 大连市一起由境外输入引起的本土新冠肺炎关联病例的病毒基因组特征分析
- 2022年
- 目的了解引起大连市本土新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)流行株的基因组特征和变异情况,追溯SARS-CoV-2来源。方法选取2022年8月20日—9月14日97例由境外输入引起的COVID-19关联病例的样本。采用SARS-CoV-2全基因组靶向扩增结合高通量测序技术(Ion Torrent测序平台)进行全基因组测序。分析SARS-CoV-2的基因组特征、核苷酸和氨基酸突变位点和基因分型。构建进化树,结合病例的流行病学资料,溯源SARS-CoV-2流行株。结果共获得97例SARS-CoV-2全基因组序列,基因组全长29735~29741 bp,平均测序深度1457×~50485×,测序覆盖率范围95.9%~100.0%。同NCBI数据库中的SARS-CoV-2参考基因组(NC_045512)序列相比,97例SARS-CoV-2全基因组序列共享75个核苷酸突变位点,22例在此基础上新增1~3个突变位点。75个共享突变位点类型包括:4个非编码区和7个基因编码区,其中基因编码区的70个突变位点,来自基因ORF1ab、S、ORF3a、E、M、ORF8、N。共享的氨基酸突变类型包括15个同义突变和51个非同义突变。97例SARS-CoV-2全基因组序列,Pangolin分型为BA.5.2.1.21(BF.21进化分支)型,Nextstrain分型为22B型,GISAID分型为GRA型。经与大连SARS-CoV-2基因库的序列比对,与8月9日境外输入的编号20220809-1和20220809-2病例共享75个核苷酸突变位点,高度同源。进化分析结果显示,此次SARS-CoV-2流行株与同时期日本大阪SARS-CoV-2流行株共同处于BF.21进化分支上,与病例20220809-1和20220809-2流行病学调查中的来源国日本一致。结论此次SARS-CoV-2流行株属于Omicron变异株(BF.21进化分支),来源于日本。
- 郎兴莹王越栾明春王欢滕雪刘颖丽薄志坚
- 关键词:新型冠状病毒高通量测序全基因组