王林
- 作品数：4 被引量：8H指数：2
- 供职机构：天津科技大学计算机科学与信息工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划天津市科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术自然科学总论更多>>
- 快速的致病基因分析方法
- 2017年
- 目前通过IBD定位研究致病基因首先需要检测IBD片段,然后利用得到的IBD关系进行关联检测来定位致病基因,但是寻找IBD片段需要较长时间。提出了一种新的算法FADG,通过分析IBS和IBD的关系找出候选IBD片段,然后定义评价函数分别对病例组和对照组进行分析,差异最大的SNP位点就是致病位点。通过对GAW15提供的类风湿关节炎模拟数据的五个主要的致病位点和GS生成的模拟数据进行分析,实验结果与数据给定的致病位点一致;与已有的方法进行对比表明该算法在能找到正确位点的基础上效率较高;最后选择了RA数据中两条染色体分别进行permutation测试,验证算法得到致病位点的可信度,进一步排除所得结果假阳性的可能性。
- 孙志伟单渊博蔡润身王林
- 关键词：全基因组关联研究病例对照研究
- 基于支持向量机的蛋白质相互作用界面热点残基预测
- 2015年
- 针对蛋白质相互作用界面中的热点残基是局部紧凑地聚集着,而现有的基于机器学习的热点残基预测方法仅从目标残基中提取特征,并没有考虑目标残基的局部空间结构信息,以及如何进行特征提取并获得非冗余的特征子集等问题,为准确识别蛋白质相互作用界面的热点残基,提出结合蛋白质相互作用界面残基的空间邻近残基信息提取多类特征,并利用随机森林来进行特征提取,最后利用支持向量机来预测热点残基的方法.计算实验表明,该预测方法可以有效地用来发现热点残基.
- 畅卫功李灏王林杨海波
- 关键词：支持向量机
- 基于不确定寿命的不可修冷贮备系统可靠性分析被引量：4
- 2016年
- 针对无大量样本存在的不可修冷贮备系统,假设各部件寿命为相互独立的非负不确定变量,建立了3类不可修冷贮备系统可靠性的基本数学模型,即转换开关完全可靠情形的不可修冷贮备系统、开关寿命0-1型的不可修冷贮备系统以及开关寿命连续型的不可修冷贮备系统.分别对这3类不可修冷贮备系统进行可靠性分析,给出此3类冷贮备系统可靠度及平均寿命的具体数学表达式,并给出了数值算例.
- 刘颖马瑶王林
- 关键词：可靠度平均寿命冷贮备系统
- 运用绿色荧光蛋白探讨肉葡萄球菌双精氨酸分泌途径被引量：4
- 2014年
- 根据肉葡萄球菌(Staphylococcus carnosus)TM300的基因组序列设计引物,经PCR扩增得到其tufA基因的启动子Peftu片段与大肠杆菌–葡萄球菌穿梭载体pBT2-Tat-GFP连接,构建了穿梭质粒pBT2-ETG.结果表明,穿梭质粒pBT2-ETG成功地转入大肠杆菌与肉葡萄球菌宿主中稳定表达具有活性的绿色荧光蛋白GFP,并被转运到肉葡萄球菌宿主的细胞壁,为进一步研究肉葡萄球菌双精氨酸(Tat)转运系统正确分泌其他外源蛋白奠定了实验基础.
- 高强许保银程逸冰王林张朝正田萍萍
