宋静林
- 作品数：2 被引量：9H指数：2
- 供职机构：首都师范大学化学系更多>>
- 发文基金：北京市属高等学校人才强教计划资助项目更多>>
- 相关领域：化学工程理学更多>>
- 苯甲酰氨类HDAC2抑制剂的3D-QSAR及虚拟筛选研究被引量：2
- 2014年
- 本文应用传统比较分子力场分析法CoMFA,比较分子相似性指数法CoMSIA和Topomer CoMFA方法,对组蛋白去乙酰化酶2(HDAC2)的苯甲酰胺类抑制剂进行了构效关系和基于药效团的筛选研究。基于分子片段建模的Topomer CoMFA的交叉验证系数q^2为0.594,预测相关系数r^2_(pred)为0.973。基于对接活性构象叠合得到的CoMFA,CoMSIA的交叉验证相关系数q^2分别为0.634,0.561,预测相关系数r^2_(pred)分别为0.905,0.68。基于药效团模型011叠合的CoMFA,CoMSIA交叉验证相关系数q^2分别为0.588,0.592,预测相关系数r^2_(pred)分别为0.68,0.859。结果表明这5个3D-QSAR模型均具有良好的稳定性和预测能力。另外,由18个活性较高结构多样的分子建立了可靠的药效团模型。运用药效团模型011和016对NCI数据库进行筛选,将筛选得到的分子与HDAC2蛋白酶进行分子对接,并由PASS进行活性验证,最终得到了18个分子,且对接打分值都大于6,可作为新的HDAC2抑制剂。
- 齐娜宋静林相玉红张卓勇
- 关键词：药效团3D-QSAR
- 药物SAHA的潜在靶标预测及分子对接研究被引量：7
- 2013年
- 利用PharmMapper的反向药效团匹配方法对SAHA(伏立诺他)的潜在靶标进行筛选,虚拟筛选得到的HDLP,HDAC8等9个靶标已被实验研究证实。靶标所涉及的疾病与实验报道的SAHA的药理学活性一致,如抗癌、抗炎、抗肿瘤等作用。另外,预测出与老年痴呆、糖尿病、风湿性关节炎等疾病相关的SAHA的潜在靶标,进而利用分子对接技术对SAHA与潜在靶标的作用模式进行了研究。SAHA与潜在靶标的对接结果表明,它们在形状、电负性和疏水性方面匹配良好,能有效抑制靶标的活性。本实验研究表明,反药效团匹配和分子对接方法可作为预测药物潜在靶标的有效手段,为SAHA新的适用症的进一步研究提供理论指导。
- 宋静林相玉红赵玲玲张卓勇
- 关键词：SAHA分子对接
