程加富
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：江西科技师范学院生命科学学院更多>>
- 发文基金：江西省高等学校教学改革研究课题更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于表达序列标签的萝卜ACA36基因簇鉴定被引量：1
- 2009年
- 利用国际公用的表达序列标签(EST)数据库资源,运用生物信息学分析方法,在萝卜(Raphanus sativus)一条表达序列标签中发现一个新的snoRNA基因簇.此基因簇含有一个box H/ACA siloRNA基因和两个box C/D snoRNA基因,分别命名为RsACA36、RssnoR66和RsSNORD88.ACA36可形成典型的box H/ACA snoRNA双茎环二级结构;snoR66和SNORD88都具有典型的C盒与D盒保守元件,末端存在反向互补序列;三个snoRNA都含有能和核糖体RNA互补配对的反向互补序列.
- 徐玲程加富胡娜殷秋平
- 关键词：核仁小分子RNA表达序列标签生物信息学
- 植物一个新box H/ACA snoRNA的鉴定及功能分析
- 2010年
- 通过生物信息学方法对拟南芥基因组序列进行搜索,发现两个新的非编码小分子RNA基因,分别命名为AthsnoR206 a和AthsnoR206b。它们相距约170nt,位于蛋白质基因间隔区。MFOLD二级结构预测这两个RNA均具有典型的box H/ACAsnoRNA"发夹-铰链-发夹-尾巴"结构,符合box H/ACA snoRNA的判定标准;两个RNA分子的反义序列一致,可以判定它们为同一基因的两个拷贝。分析预测snoR206的两段反义序列分别指导拟南芥rRNA小亚基U1717位点和大亚基U2181位点的假尿嘧啶化修饰。在其它13种包括单子叶植物和双子叶植物在内的植物搜索到14个snoR206同源分子,其中12个发现于表达序列标签中,表明该snoRNA在植物中表达且广泛存在。具有双功能的snoR206在人和酵母中的部分功能同源分子分别为U70和snR32,表明其祖先分子在进化过程中存在分子重组。
- 程加富徐玲胡娜殷秋平
- 关键词：拟南芥BOXSNORNA分子进化
