曹洁
- 作品数:5 被引量:44H指数:4
- 供职机构:辽宁省海洋水产科学研究院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金辽宁省自然科学基金国家海洋公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 圆斑星鲽及相关种类线粒体DNA控制区结构分析被引量:15
- 2007年
- 采用PCR产物直接测序法测定了圆斑星鲽(Verasper variegatus)的24个个体的线粒体控制区(Control region)核苷酸全序列,并进行了结构分析。结果表明,圆斑星鲽线粒体控制区核苷酸全序列具有长度多态性,得到4种长度单元型,主要表现为控制区中的串联重复序列的长度不同。对鲽形目鱼类如鲽科的条斑星鲽(Verasper moseri)、黄盖鲽(Limanda feruginea)、马舌鲽(Reinhardtius hippoglossoides),美洲拟庸鲽(Heppoglossoides platessoides)和鲆科的牙鲆(Paralichthys olivaceus)以及鳎科的欧洲鳎(Soleasolea)、塞内加尔鳎(S. senegalensis)和沙鳎(S. lascari)的控制区的比较研究发现,鲽形目鱼类的线粒体控制区均存在相似的结构,即线粒体控制区可分为终止相关序列区(ETAS)、中央保守区(包括CSB-A、CSB-B、CSB-C、CSB-D、CSB-E、CSB-F)以及保守序列区(CSB1、CSB2、CSB3)和重复序列区(Repeat region)4个区域。通过与脊椎动物各个纲线粒体控制区序列的比较分析,发现只有鲽形目(包括鲆、鲽类和鳎类)鱼类和两栖纲的无尾类在CSB-3之后存在相似的串联重复序列。
- 赫崇波曹洁刘卫东周遵春葛陇利高祥刚王效敏
- 关键词:圆斑星鲽线粒体控制区串联重复序列结构分化
- SSR不对称PCR法分析虾夷扇贝遗传多样性被引量:7
- 2009年
- 采用微卫星引物的不对称扩增法(即不对称PCR-SSR方法),得到了较为准确的微卫星,运用8对微卫星标记对取自日本青森县的自然群体(QSX)、俄罗斯海参崴自然生群体(HSW)和大连旅顺口的自然群体(LSK)及大连的广鹿岛(GLD)、獐子岛(ZZD)、小长山(XCS)和凌水桥(LSQ)养殖群体进行遗传多样性分析。平均观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.51563~0.64583和0.67575~0.74535,其中QSX群体的平均杂合度最高,HSW群体的最低,各群体间的差异不显著,说明中国的扇贝的群体遗传多样性仍然处于一个很高的水平,种质资源较丰富。并对常规PCR和不对称PCR方法扩增微卫星的优缺点进行了探讨。
- 高祥刚曹洁刘莹刘卫东傅立元鲍相渤赫崇波
- 关键词:微卫星标记虾夷扇贝
- 圆斑星鲽mtDNA控制区结构被引量:1
- 2007年
- 对圆斑星鲽m tDNA控制区序列及鲽形目鱼类鲽科的条斑星鲽、大西洋黄盖鲽、马舌鲽,美洲拟庸鲽和鲆科的牙鲆以及鳎科的欧洲鳎、塞内加尔鳎、沙鳎控制区进行了比较分析。结果表明,圆斑星鲽的控制区序列可分为扩展终止相关序列区(ETAS)、中央保守区(CSB-A、B、C、D、E、F)、保守序列区(CSB1、CSB2、CSB3)和串联重复序列区(Tandem repeat region)。通过与其他脊椎动物线粒体控制区序列的比较,发现鲽形目的鲆、鲽类和鳎类与两栖纲的无尾类在CSB-3之后存在相似的串联重复序列。
- 曹洁刘卫东葛陇利高祥刚鲍相渤赫崇波
- 关键词:圆斑星鲽鲽形目线粒体控制区串联重复序列
- 利用mtDNA控制区序列分析斑点叉尾鮰的遗传多样性被引量:11
- 2007年
- 利用m tDNA控制区序列对1984、1997年引进的斑点叉尾鮰群体遗传多态性进行了分析。通过PCR产物测序法,测定了40尾斑点叉尾鮰线粒体DNA的一段包括部分Cytb基因、tRNAThr、tRNAPro、D-loop控制区和部分tRNAThe长度为1256 bp的核苷酸序列,经过比对分析得到7个序列单元型。7个单元型中共有13个碱基转换位点,全部发生在控制区,其序列相似度平均为99.58%。群体总的序列单元型多态性比例为17.5%,其中1997年群体的单元型多态性比例为35%,是1984年群体单元型多态性比例(15.0%)的2倍多。初步表明1984年引进的群体遗传多样性较低。
- 葛陇利赫崇波高祥刚陈姝君丛林林曹洁
- 关键词:斑点叉尾鮰线粒体DNA
- 辽宁沿海海蜇与沙海蜇遗传多样性的AFLP分析被引量:11
- 2009年
- 海蜇和沙海蛰均为腔肠动物门的大型食用水母,采用AFLP分子标记技术对辽宁沿海的海蜇野生群体、养殖群体和沙海蜇野生群体共90个个体进行了遗传多样性分析。10对引物共得到560个稳定扩增位点。3个群体的多态性位点比例为海蜇野生群体82.05%,海蜇养殖群体78.46%,沙海蜇野生群体74.10%;平均杂合度分别为0.2072、0.1850和0.2116,Shannon多样性指数分别为0.3248、0.2954和0.3262,海蜇野生群体与海蜇养殖群体和沙海蜇野生群体的遗传距离分别为0.0300和0.2702。分析结果表明,3个群体的遗传多样性均保持了相对较高的水平。
- 高祥刚曹洁董婧刘星赫崇波
- 关键词:海蜇沙海蜇AFLP分析