张黎
- 作品数:5 被引量:12H指数:2
- 供职机构:江西农业大学动物科学技术学院更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 江西省猪细环病毒1型和2型流行情况调查及全基因组克隆与序列分析被引量:4
- 2016年
- 目前在我省许多地区猪群中是否存在TTSuV感染尚未见相关报道,为更好的了解猪细环病毒1型和2型在猪群中进化情况以及进一步研究其遗传变异,根据NCBI已发表的猪细环病毒两种基因型全基因组序列,在序列保守区域用设计特异性引物,采用聚合酶链反应(PCR)进行该病毒的检测及全基因的扩增。通过将扩增产物胶回收后进行T-A克隆,然后进行序列测定和同源性与系统进化分析。本试验检测出猪群TTSuV1型和TTSuV2型在猪群中的感染情况,全基因测序得到的序列确定为TTSuV1和TTSuV2全基因序列。对测得序列进行同源性分析与遗传进化分析,分析结果表明,分离株(JX TTSuV)与国内外不同地域TTSuV全基因组序列之间差异较大,同源性为67.8%~97.2%;进化分析表明,JX TTSuV与其他株TTSuV参考株亲缘关系远近各不相同,与日本分离株(AB076001)和巴西分离株(AY823991)亲缘关系较近。
- 田光玲何后军张黎王伟松叶丽娜吴靖蔡高峰
- 关键词:全基因组
- 猪细环病毒1型环介导等温扩增方法的建立被引量:1
- 2015年
- 猪细环病毒(Torque teno sus virus,TTSu V)是一种无囊膜,单链的DNA病毒,存在猪细环病毒1型和猪细环病毒2型2个亚型。为建立一种新型快速的TTSu V1检测方法。针对TTSu V1保守的非编码区域(untranslated regions,UTR)设计2对LAMP引物,并对反应体系和反应条件进行了优化调整,建立了TTSu V1 LAMP检测方法。结果表明该方法最佳反应条件为62℃1 h,病毒最低检出限可达9.2 copies/μL,特异性良好。LAMP反应是一种集特异性强,灵敏度高,反应速度快于一体的的基因检测方法,有望成为快速检测TTSu V1的手段之一。
- 张黎李凯田光玲李德峰何后军
- 关键词:灵敏度特异性
- 猪圆环病毒2型江西株的全基因组克隆和序列分析被引量:5
- 2017年
- 为了解江西地区猪圆环病毒2型(PCV-2)的流行和进化情况,根据GenBank上已发表的PCV-2全基因序列设计1对引物,PCR扩增后得到9条PCV-2全基因序列,并对其全基因序列核苷酸和蛋白序列进行分析,绘制遗传进化树。结果表明,江西地区流行的9株PCV-2中,基因组序列全长分为8株1 767bp和1株1 768bp,9株PCV-2的核苷酸同源性为94.7%~99.9%,与GenBank己发表的PCV-2分离株全基因组同源性介于94.3%~99.8%之间,而9株PCV-2的ORF1核苷酸序列同源性为96.9%~100.0%。ORF2和ORF3编码的蛋白氨基酸序列存在部分位点突变。遗传进化树显示为3种基因型:5株PCV-2b、3株PCV-2d、1株PCV-2a。本研究有助于江西地区PCV-2的监测和防制。
- 蔡高峰李凯张黎王伟松何后军
- 关键词:猪圆环病毒2型全基因组
- 猪细环病毒2型环介导等温扩增检测方法的建立被引量:2
- 2015年
- 为了能快速、特异的检测猪细环病毒2型(TTSuV2),本研究针对TTSuV2全基因序列的非编码区域和第1个开放性阅读框前端设计了2对引物,建立了TTSuV2的环介导等温扩增(LAMP)检测方法并对反应成分和条件进行了梯度摸索。试验结果显示,该LAMP检测方法最佳反应条件为64℃恒温90 min,可特异性检测TTSuV2,与猪细环病毒1型、猪圆环病毒2型、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒和猪博卡病毒无交叉反应,病毒最低检出限为100拷贝/μL。结果表明,建立的LAMP方法具有快速、特异且灵敏的特点,可在TTSuV2快速检测方面提供一定的技术支持。
- 张黎李凯田光玲李德峰王伟松何后军
- 关键词:环介导等温扩增
- 猪细环病毒2型ORF1截短基因的原核表达被引量:1
- 2015年
- 细环病毒(rITrV)又称输血传播病毒,是隶属于指环病毒科的一种环形DNA病毒。输血传播病毒于1997年由日本学者从一名输血后的肝炎患者血清中发现,人群感染率可达10%以上。1999年,美国学者在猪体内发现猪源细环病毒(TorquetenoSUSvirus,TTllSuV),之后世界各地陆续可见TTSuV病例的报道一。
- 张黎田光玲王伟松蔡高峰吴靖何后军
- 关键词:DNA病毒原核表达基因日本学者输血