刘小容
- 作品数：1 被引量：3H指数：1
- 供职机构：西南大学农学与生物科技学院更多>>
- 发文基金：贵州省科学技术基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 烟草橙蛋白基因的克隆与生物信息学分析被引量：3
- 2012年
- 为了获得烟草OR(NtOR)基因的全长序列和进一步揭示其在特色烟叶形成中的作用,采用同源克隆法从烟草品种K326中克隆了NtOR的全长cDNA和基因组DNA序列,GenBank登录号为JN379458和JN375578。生物信息学分析表明,NtOR基因组DNA全长5027 bp,cDNA为1188 bp,编码317个氨基酸残基。NtOR蛋白具有2个跨膜域、1个信号肽剪切位点、5个糖基化位点和11个磷酸激酶修饰位点,二级结构包含12个α-螺旋和20个β-折叠,亚细胞定位于质膜上。系统进化与BLAST分析表明,NtOR是SlOR和ViOR的垂直同源基因。GENEVESTIGATOR数据库的芯片结果显示,NtOR基因在子叶中的表达量最高,其次是成熟叶片、幼茎和花,其他组织器官的表达相对较弱。
- 雷波卢坤丁福章刘小容胡重怡潘文杰
- 关键词：烟草克隆生物信息学
