秦兆宇
- 作品数:4 被引量:11H指数:3
- 供职机构:山东大学海洋学院更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 双向电泳中人血清蛋白样品不同处理方法的比较被引量:3
- 2009年
- 目的针对人血清双向电泳流程中样品制备的不同方法,本研究进行了系统的比较和分析。方法采用丙酮沉淀法,三氯醋酸沉淀法,三氯醋酸/丙酮沉淀法,蛋白纯化试剂盒,去白蛋白及免疫球蛋白试剂盒预处理血清样品;双向电泳分离;硝酸银染色;软件分析所得蛋白质斑点。结果对丙酮沉淀法,三氯醋酸沉淀法,三氯醋酸/丙酮沉淀法,蛋白纯化试剂盒处理血清所得到的2-DE图谱统计分析,得到平均蛋白质点数分别为1 802±12,1 648±10,1 727±13,1 670±14;对去除白蛋白及免疫球蛋白血清所得到的双向电泳(2-DE)图谱与丙酮沉淀血清所得到的图谱进行统计,得到平均蛋白质点数分别为1 212±16,1 258±12,并对其中差异蛋白进行了质谱鉴定。结论结果表明不同血清沉淀方法对血清的双向电泳各有优劣;血清去除白蛋白及免疫球蛋白之后,可以提高一些低丰度蛋白的检出,但会导致部分蛋白的丢失。
- 王班琴秦兆宇柏淑美刘芙军李芸刘师莲
- 关键词:双向电泳蛋白组学血清
- 生物体液差异蛋白质组学研究技术体系的建立
- 2008年
- 为探讨以2D-DIGE为核心的生物体液差异蛋白质组学技术体系,取2组不同生物学状态下的体液样本进行研究。每组包含一例人类多发性硬化样本和一例对照样本,共设3组平行实验。经冷丙酮沉淀法除盐提取蛋白并精确定量,分别用分CY5和CY2荧光染料按最小标记法对多发性硬化样本和对照组进行标记。另再取混合蛋白内用CY3标记。混合样品后分别在3块2D-gel上进行电泳,通过Typhoon 9400多功能荧光扫描仪及DeCyder 2-D差异分析软件进行DIGE分析。差异蛋白用MALDI-TOF/TOF进行鉴定,将所得结果录入Metarcore计算平台,进行蛋白质相关分析。结果表明,利用该方法研究不同生物学状态下的体液标本,结合网络图谱分析,可得到较多有意义的候选蛋白信息。
- 秦兆宇张小葵何峰刘师莲
- 关键词:生物体液差异蛋白质组学
- 白斑综合征中国对虾肝胰腺蛋白质组学研究的技术探索被引量:3
- 2007年
- 建立白斑综合征中国对虾肝胰腺蛋白质组学技术体系,以惠白斑综合征中国对虾的肝胰腺为研究对象,健康中国对虾肝胰腺为对照组,探索2种蛋白质组学差异蛋白的分离和鉴定的方法。采用双向凝胶电泳(4~7固相pH梯度干胶条,10%SDS-PAGE)分离蛋白质组,银染显色,图像分析软件比较分析,识别差异蛋白,胶上扣点,处理后通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MOLDI-TOF)得到肽质量指纹图谱,软件分析后应用Mascot数据库搜索软件鉴定蛋白。分别获得中国对虾患白斑病组及对照组正常肝胰腺蛋白质组表达图谱,分别识别出203和107个蛋白质点,筛选并尝试鉴定数个差异蛋白。对各方法步骤进行了技术探讨,对实验过程提出了一系列建议,建立了双向电泳及生物质谱方法研究中国对虾白斑病的蛋白质组学技术体系,该体系拓宽了对虾免疫生理研究的途径,以从蛋白质水平探讨对虾发病机制,寻找有效药物靶点。
- 秦兆宇刘师莲杨银荣刘芙君李建远宋春华
- 关键词:白斑综合症蛋白质组学双向电泳生物质谱
- 中国对虾肝胰腺蛋白质组学双向电泳技术体系的建立被引量:6
- 2007年
- 建立中国对虾肝胰腺蛋白质组学双向电泳技术体系。利用双向电泳技术,以中国对虾肝胰腺为研究对象,通过离心等手段提取蛋白,双向电泳分离,硝酸银染色,进行图谱分析。结果表明:从双向电泳图谱上获得蛋白质斑点。验证了用双向电泳技术研究对虾免疫及其他生理现象的可行性。通过建立中国对虾蛋白质组学双向电泳技术体系,可极大拓宽对虾免疫生理研究的途径,从蛋白质水平探讨对虾发病机制,寻找有效药物靶点,为生物信息学分析奠定了基础,提供了理论依据。
- 秦兆宇刘师莲宋春华张旭华
- 关键词:蛋白质组学双向电泳