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田进伟
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1
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供职机构:
哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院
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发文基金:
黑龙江省教育厅科学技术研究项目
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相关领域:
生物学
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合作作者
孙红梅
哈尔滨医科大学生物信息科学与技...
马晔
哈尔滨医科大学生物信息科学与技...
徐良德
哈尔滨医科大学生物信息科学与技...
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孙红梅
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现代生物医学...
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2012
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基于功能基因组数据整合方法研究前列腺癌风险基因
2012年
目的:利用生物信息学方法,将高通量基因表达数据与单核酸多肽(SNP)基因型数据进行整合分析,研究并注释前列腺癌风险基因。方法:本文基于EST、SAGE、基因芯片三类功能基因组数据整合的方法研究前列腺癌风险基因。首先,通过三类数据寻找前列腺癌中异常表达和差异表达基因。利用全基因组关联分析得到前列腺癌相关基因的SNPs。定位所得到的前例腺癌差异表达基因与SNPs到染色体,获取与SNPs在同一区段的差异表达基因,并通过各种数据库注释所得基因。结果:通过数据整合分析,最终得到前列腺癌风险基因84个,其中20多个基因已被证实与前列腺癌极其相关。结论:整合前列腺癌高通量表达数据与SNP基因型数据,能够快速有效的获得前列腺癌显著相关基因。此方法可以推广于其它癌症的研究。
马晔
田进伟
孙红梅
徐良德
关键词:
全基因组关联分析
SNP
基因表达
前列腺癌
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