邱立华
- 作品数：6 被引量：16H指数：3
- 供职机构：云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省应用基础研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 水牛胃型LYZ c基因多态性及功能生物信息学分析
- 2017年
- 胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了比较基因组学和生物信息学分析。在水牛群体内共发现9个SNP位点,分别为c.87G>T、c.196G>A、c.228G>A、c.336G>C、c.351T>C、c.396C>T、c.423C>T、c.424G>A和c.438C>G,其中SNP87、SNP196、SNP336和SNP351仅存在于河流型水牛中,其他5个SNP为河流型和沼泽型水牛共享;SNP196和SNP424为异义替换,引起p.G66S和p.V142I氨基酸替换,但它们对水牛LYZ c的功能没有影响。在水牛胃型LYZ c基因中,共定义7种单倍型,确定了3种LYZ c变异体,其中变异体Buffalo1、Buffalo 2为两类水牛共享,Buffalo 3为河流型水牛独有。水牛这3种变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致。水牛与普通牛胃型LYZ c蛋白的上述特征也极相似,但水牛胃型LYZ c的等电点比普通牛更低。结果揭示水牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。
- 范新阳张永云邱立华陈涛周芳廷哈福苗永旺
- 关键词：水牛C基因生物信息学分析
- 盐津乌骨鸡mtDNA D-loop区遗传多样性及其保种效果分析被引量：5
- 2020年
- 为阐明盐津乌骨鸡的群体遗传背景和评估、监测其保种效果,采用PCR产物直接测序对保种群样品进行了mtDNA控制区的变异检测,并结合已发表的云南其他地方鸡数据进行了群体遗传学分析。结果表明,在所检测的2005年样品中,共发现40个核苷酸变异位点,其中32个为简约信息位点,8个为单一信息位点;共定义27种单倍型,单倍型多样度为0.939,核苷酸多样度为0.01595,群体内遗传距离为0.016;包含A、B、C、E、F和G等6个母系世系,所占比例分别为35.44%、3.80%、6.33%、10.13%、6.33%和37.97%。在所检测的2018年样品中,发现24个核苷酸多态位点,其中5个为单一信息位点,19个为简约信息位点;共发现到13种单倍型,单倍型多样度为0.847,核苷酸多样度为0.01118,群体内遗传距离为0.011;包含A、B、E和G等4个母系世系,所占比例分别为31.67%、10.00%、50.00%和8.33%。研究结果提示,两种样品群体遗传组成存在较大差异,2018年保种群遗传多样性水平比2005年的显著下降,群体中母系世系减少,存在较大比例外来鸡种的基因渗入,保种效果欠佳。
- 王荣琼孙利民胡瑀滕晓红滕晓红邱立华
- 关键词：盐津乌骨鸡线粒体DNA控制区
- 那米鸡早期生长发育规律研究被引量：7
- 2021年
- 【目的】研究那米鸡的生长发育规律。【方法】选用Gompertz、Logistic和Von Bertalanffy 3种常用的非线性曲线模型对那米鸡0~210日龄体质量进行了生长曲线拟合与分析。【结果】那米鸡体质量的累积生长曲线呈现"S"形,表明其生长发育正常;表现为60日龄之前生长速度较慢,60~120日龄阶段为该鸡的生长旺盛期,120日龄以后生长速度逐渐减缓。60日龄以前,公鸡、母鸡的体质量累积生长曲线基本一致,60日龄以后,公鸡生长速度明显快于母鸡。3种曲线模型均能较好的拟合公、母鸡的生长发育,拟合度均达0.99以上,其中Gompertz模型对公鸡的拟合值与实际值最为接近,Von Bertalanffy模型对母鸡的拟合值与实际值最接近,表明Gompertz模型对那米鸡公鸡体质量的拟合度更高(R~2=0.998),Von Bertalanffy模型对母鸡体质量的拟合度更高(R~2=1.000)。【结论】本研究揭示了那米鸡的生长发育规律,表明运用Gompertz和Von Bertalanffy模型对那米鸡进行生长曲线的拟合与分析是可行的,可为那米鸡的饲养管理及选育利用提供依据。
- 胡瑀邓俊邱立华范新阳黄静王荣平苗永旺
- 关键词：生长发育
- 河流型与沼泽型水牛CSN3基因密码子使用特征分析被引量：3
- 2017年
- 本研究以54头河流型水牛和70头沼泽型水牛为研究对象,并以从NCBI数据库中下载的普通牛、野牦牛、野牛、绵羊、小鼠和人的序列作对照,对乳成分中重要的κ-酪蛋白(kappa casein)编码基因CSN3的密码子使用偏好性及水牛与其他物种间CSN3基因密码子使用的差异和进化关系进行了深入分析。结果表明:两种类型水牛CSN3基因密码子使用特征相似,河流型水牛CSN3基因共有26个偏好使用的密码子,而沼泽型水牛共有27个;其中,两类水牛偏好性较强的密码子均为GUU、UCA、AGU、CCA、AGG、GGU和GGA(RSCU≥2),河流型水牛对Asp的两种密码子GAU、GAC没有使用偏好性,而沼泽型水牛偏好使用GAC;河流型水牛编码Asp和Cys的同义密码子RSCU值为1,而沼泽型水牛只有编码Cys的同义密码子RSCU值为1。研究发现,所有物种CSN3基因均偏好使用以A/U结尾的密码子,但不同物种之间偏好使用密码子种类和数目均有差异。在密码子使用频率上,水牛CSN3基因与其他牛科物种的差异小于与小鼠、人的差异。密码子使用偏好聚类分析表明,河流型与沼泽型水牛亲缘关系最近,聚为一类,然后依次与其他牛、绵羊、小鼠和人等物种相聚。
- 范新阳邱立华罗国祥张永云滕晓红苗永旺
- 关键词：河流型水牛沼泽型水牛密码子偏好性聚类分析
- 大额牛和牦牛胃型LYZ c基因多态性及其对消化功能的适应性分析
- 2018年
- 【目的】为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化功能的适应性分析。【结果】在大额牛群体内共发现6个SNP位点,分别为c.196G>A、c.267T>C、c.270C>T、c.396C>T、c.423C>T和c.438C>G。在牦牛群体内共发现10个SNP位点,其中6个与大额牛共享,非共享的SNP位点分别为c.336G>C、c.348T>G、c.351T>C和c.375A>C。SNP196和SNP348为异义替换,引起p.G66S和p.H116Q氨基酸替换,但它们对大额牛和牦牛LYZ c的功能没有影响。在大额牛LYZ c基因中,共定义6种单倍型,确定了2种LYZ c蛋白变异体(Gayal 1和Gayal 2);而在牦牛LYZ c基因中,共定义12种单倍型,确定了3种LYZ c变异体(Yak 1～Yak 3);变异体Gayal 1与Yak 3、Gayal 2与Yak 1相同,而变异体Yak 2为牦牛独有。大额牛、牦牛和普通牛胃型LYZ c变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致,但大额牛和牦牛变异体LYZ c等电点比普通牛S3型LYZ c更低。【结论】大额牛和牦牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。
- 范新阳张自芳邱立华钱林东刘丽仙张永云苗永旺
- 关键词：C基因消化酶
- 牛科物种胰岛素诱导基因1(INSIG1)研究进展被引量：1
- 2017年
- 胰岛素诱导基因1编码蛋白(INSIG1)定位于内质网膜上,是调控脂代谢的重要因子。INSIG1主要通过调控固醇调控元件结合蛋白(SREBP)和3-羟-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)来影响脂质代谢。越来越多的研究结果揭示了INSIG1在生物体内作用的复杂性。本文综述了INSIG1与SREBP和HMGR之间在脂代谢调控过程中的相互作用机制、INSIG1的结构及表达调控、INSIG1对牛科动物泌乳、生长等性状的影响。
- 罗建椿邱立华范新阳苗永旺
- 关键词：泌乳性状基因多态性
