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彭丽莹

作品数:1 被引量:0H指数:0
供职机构:华中农业大学园艺林学学院园艺植物生物学教育部重点实验室更多>>
发文基金:湖北省自然科学基金更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇亲缘
  • 1篇亲缘关系
  • 1篇亲缘关系分析
  • 1篇系统进化树
  • 1篇内含子
  • 1篇内含子序列
  • 1篇进化树
  • 1篇甘蓝
  • 1篇MAGIC

机构

  • 1篇华中农业大学

作者

  • 1篇陈炯炯
  • 1篇彭丽莹
  • 1篇安光辉

传媒

  • 1篇华中农业大学...

年份

  • 1篇2017
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
内含子序列在甘蓝MAGIC亲本间亲缘关系分析中的应用
2017年
为探究甘蓝多亲本高级世代互交系(multiparent advanced generation inter-cross,MAGIC)亲本间的亲缘关系和遗传多样性,以便对MAGIC杂交亲本的选择提供依据,采用生物信息学的方法对单拷贝基因进行全基因组鉴定,并采用其内含子序列分析对7个甘蓝亚种共12个MAGIC亲本构建系统发育树。全基因组鉴定共获得7 930个单拷贝基因,每条染色体上随机挑选1条单拷贝基因,采用PCR方法进行内含子扩增并测序,最终获得3 427bp内含子长序列。运用邻接法构建系统发育树,可将甘蓝类蔬菜分为3大类型:花椰菜与西兰花类(CladeⅠ)、羽衣甘蓝类(CladeⅡ)以及结球甘蓝、抱子甘蓝、苤蓝与芥蓝类(CladeⅢ),表明内含子序列适于甘蓝亚种亲缘关系聚类;同时也表明,芥蓝属于甘蓝亚种,西兰花与花椰菜具有较近的亲缘关系;利用单拷贝基因内含子序列分析的方法可以较好地显示甘蓝MAGIC亲本间的亲缘关系,为MAGIC群体的构建提供参考。
安光辉严承欢张维奕彭丽莹陈炯炯
关键词:甘蓝内含子系统进化树
共1页<1>
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